Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0C6

CIPC, CLOCK-interacting pacemaker, humanhuman

Predictions only

Length 399 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CIPCQ9C0C6 ACP5-212ENST00000592828 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CIPCQ9C0C6 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CIPCQ9C0C6 LGMN-211ENST00000555699 1728 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CIPCQ9C0C6 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CIPCQ9C0C6 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CIPCQ9C0C6 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CIPCQ9C0C6 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CIPCQ9C0C6 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CIPCQ9C0C6 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CIPCQ9C0C6 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CIPCQ9C0C6 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CIPCQ9C0C6 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CIPCQ9C0C6 PSMG3-201ENST00000252329 1007 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CIPCQ9C0C6 RNF151-201ENST00000321392 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CIPCQ9C0C6 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CIPCQ9C0C6 STOML1-203ENST00000359750 984 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CIPCQ9C0C6 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CIPCQ9C0C6 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CIPCQ9C0C6 IL32-205ENST00000396890 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CIPCQ9C0C6 STARD13-205ENST00000439831 945 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CIPCQ9C0C6 AC020659.2-201ENST00000510176 585 ntTSL 4 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CIPCQ9C0C6 AC103736.1-203ENST00000524565 872 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CIPCQ9C0C6 IGLL5-201ENST00000526893 1050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CIPCQ9C0C6 IGLL5-202ENST00000531372 882 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CIPCQ9C0C6 AKR1E2-212ENST00000532248 844 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CIPCQ9C0C6 IL32-223ENST00000534507 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CIPCQ9C0C6 PXN-AS1-201ENST00000535200 1170 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CIPCQ9C0C6 GALNT9-208ENST00000541995 1001 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CIPCQ9C0C6 IL32-227ENST00000548652 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CIPCQ9C0C6 TSFM-210ENST00000550559 897 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CIPCQ9C0C6 IL32-233ENST00000552664 731 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CIPCQ9C0C6 RNF151-203ENST00000569714 796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CIPCQ9C0C6 IGFLR1-205ENST00000588992 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CIPCQ9C0C6 CYP2A7P1-201ENST00000595391 815 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
CIPCQ9C0C6 AC009093.7-201ENST00000623853 1223 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
CIPCQ9C0C6 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CIPCQ9C0C6 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CIPCQ9C0C6 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CIPCQ9C0C6 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CIPCQ9C0C6 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CIPCQ9C0C6 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CIPCQ9C0C6 WASH6P-202ENST00000359512 1437 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
CIPCQ9C0C6 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CIPCQ9C0C6 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CIPCQ9C0C6 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CIPCQ9C0C6 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CIPCQ9C0C6 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CIPCQ9C0C6 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CIPCQ9C0C6 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CIPCQ9C0C6 DAB2IP-205ENST00000408936 6784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CIPCQ9C0C6 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CIPCQ9C0C6 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CIPCQ9C0C6 RGN-203ENST00000397180 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CIPCQ9C0C6 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CIPCQ9C0C6 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CIPCQ9C0C6 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CIPCQ9C0C6 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CIPCQ9C0C6 CYB5A-203ENST00000397914 619 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CIPCQ9C0C6 PMS2P4-201ENST00000412466 1052 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
CIPCQ9C0C6 SPCS2P4-201ENST00000436160 681 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
CIPCQ9C0C6 ITPA-203ENST00000455664 729 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CIPCQ9C0C6 SHF-202ENST00000458022 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CIPCQ9C0C6 AC069335.1-201ENST00000489972 472 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
CIPCQ9C0C6 AC217774.2-201ENST00000580347 560 ntTSL 4 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CIPCQ9C0C6 C19orf33-202ENST00000588605 520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CIPCQ9C0C6 AC247036.6-201ENST00000632950 410 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CIPCQ9C0C6 TRIP6-209ENST00000619988 1303 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CIPCQ9C0C6 AFF2-204ENST00000370458 1488 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CIPCQ9C0C6 SPSB2-203ENST00000519357 1496 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CIPCQ9C0C6 UXT-AS1-201ENST00000590504 1525 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
CIPCQ9C0C6 ATP6V1C2-204ENST00000635370 1578 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CIPCQ9C0C6 SERPINB6-201ENST00000335686 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CIPCQ9C0C6 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CIPCQ9C0C6 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CIPCQ9C0C6 CALD1-204ENST00000417172 1915 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CIPCQ9C0C6 KDM4F-201ENST00000545950 1917 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CIPCQ9C0C6 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CIPCQ9C0C6 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CIPCQ9C0C6 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CIPCQ9C0C6 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CIPCQ9C0C6 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CIPCQ9C0C6 ZNF451-203ENST00000370706 5268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CIPCQ9C0C6 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
CIPCQ9C0C6 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
CIPCQ9C0C6 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
CIPCQ9C0C6 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.33
CIPCQ9C0C6 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.33
CIPCQ9C0C6 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
CIPCQ9C0C6 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
CIPCQ9C0C6 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
CIPCQ9C0C6 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
CIPCQ9C0C6 UNC13A-205ENST00000551649 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
CIPCQ9C0C6 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
CIPCQ9C0C6 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
CIPCQ9C0C6 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CIPCQ9C0C6 BSG-202ENST00000346916 1605 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CIPCQ9C0C6 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CIPCQ9C0C6 LINC02167-203ENST00000566900 1489 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CIPCQ9C0C6 ARFGAP1-220ENST00000547204 1327 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CIPCQ9C0C6 BSG-215ENST00000618006 1329 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.6 ms