Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYV7

BCO2, Beta,beta-carotene 9',10'-oxygenase, humanhuman

Predictions only

Length 579 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BCO2Q9BYV7 SPATC1-201ENST00000377470 2007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
BCO2Q9BYV7 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
BCO2Q9BYV7 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
BCO2Q9BYV7 GCK-202ENST00000345378 2421 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
BCO2Q9BYV7 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
BCO2Q9BYV7 BSCL2-210ENST00000421906 1440 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
BCO2Q9BYV7 NPM2-203ENST00000397940 1874 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
BCO2Q9BYV7 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
BCO2Q9BYV7 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
BCO2Q9BYV7 BIRC7-201ENST00000217169 1368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
BCO2Q9BYV7 PRR22-202ENST00000419421 1392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
BCO2Q9BYV7 BCL2L12-203ENST00000441864 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
BCO2Q9BYV7 CD1E-213ENST00000444681 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
BCO2Q9BYV7 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
BCO2Q9BYV7 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
BCO2Q9BYV7 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
BCO2Q9BYV7 CTRB2-201ENST00000303037 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
BCO2Q9BYV7 GUK1-210ENST00000391865 990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
BCO2Q9BYV7 SUMO1-201ENST00000392244 831 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
BCO2Q9BYV7 AC002056.1-201ENST00000395613 760 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
BCO2Q9BYV7 SUMO1-209ENST00000409712 761 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
BCO2Q9BYV7 TM4SF19-204ENST00000454715 1061 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
BCO2Q9BYV7 PTGES3-205ENST00000456859 957 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
BCO2Q9BYV7 AC138304.1-201ENST00000563841 424 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
BCO2Q9BYV7 PMF1-BGLAP-204ENST00000567140 655 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
BCO2Q9BYV7 AC099522.2-201ENST00000607001 744 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
BCO2Q9BYV7 ACP5-212ENST00000592828 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
BCO2Q9BYV7 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
BCO2Q9BYV7 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
BCO2Q9BYV7 SERPINB6-201ENST00000335686 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
BCO2Q9BYV7 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
BCO2Q9BYV7 CHCHD3-201ENST00000262570 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
BCO2Q9BYV7 PDXP-202ENST00000403251 1571 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
BCO2Q9BYV7 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
BCO2Q9BYV7 AC139530.2-201ENST00000571730 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
BCO2Q9BYV7 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
BCO2Q9BYV7 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
BCO2Q9BYV7 AMHR2-202ENST00000379791 1437 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
BCO2Q9BYV7 TRPC6-202ENST00000348423 2448 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
BCO2Q9BYV7 IGHM-202ENST00000637539 1683 ntAPPRIS P5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
BCO2Q9BYV7 AL512625.3-203ENST00000445604 1602 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
BCO2Q9BYV7 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
BCO2Q9BYV7 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
BCO2Q9BYV7 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
BCO2Q9BYV7 PAK4-203ENST00000360442 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
BCO2Q9BYV7 SIVA1-202ENST00000347067 550 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
BCO2Q9BYV7 STOM-202ENST00000347359 870 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
BCO2Q9BYV7 IFT20-202ENST00000357896 974 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
BCO2Q9BYV7 SFT2D1-201ENST00000361731 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
BCO2Q9BYV7 WLS-203ENST00000370971 700 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
BCO2Q9BYV7 C9orf116-202ENST00000371789 1278 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
BCO2Q9BYV7 CAMKMT-204ENST00000407131 652 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
BCO2Q9BYV7 DANCR-201ENST00000411630 904 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
BCO2Q9BYV7 LINC00029-202ENST00000414668 1117 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
BCO2Q9BYV7 HILS1-201ENST00000504307 1219 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
BCO2Q9BYV7 C8orf46-213ENST00000521495 557 ntTSL 4 BASIC17.81■□□□□ 0.44
BCO2Q9BYV7 AC112191.1-201ENST00000523689 701 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
BCO2Q9BYV7 AP000777.2-201ENST00000539897 501 ntTSL 4 BASIC17.81■□□□□ 0.44
BCO2Q9BYV7 MARVELD3-206ENST00000567566 850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
BCO2Q9BYV7 AC087741.1-203ENST00000576824 820 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
BCO2Q9BYV7 CITED2-204ENST00000618718 901 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
BCO2Q9BYV7 AC092902.6-201ENST00000641783 218 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
BCO2Q9BYV7 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
BCO2Q9BYV7 FUT2-201ENST00000391876 1593 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
BCO2Q9BYV7 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
BCO2Q9BYV7 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
BCO2Q9BYV7 LRP8-207ENST00000465675 2670 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
BCO2Q9BYV7 LINC00323-202ENST00000441268 2095 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
BCO2Q9BYV7 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
BCO2Q9BYV7 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
BCO2Q9BYV7 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
BCO2Q9BYV7 ATP6V1E1-201ENST00000253413 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
BCO2Q9BYV7 CCDC183-201ENST00000338005 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
BCO2Q9BYV7 FAM53C-202ENST00000434981 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
BCO2Q9BYV7 GGT3P-204ENST00000453783 1664 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
BCO2Q9BYV7 PACS1-209ENST00000529757 1688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
BCO2Q9BYV7 ITPRIPL1-205ENST00000536814 1947 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
BCO2Q9BYV7 GOLGA6L17P-202ENST00000614358 1398 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
BCO2Q9BYV7 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
BCO2Q9BYV7 CCDC90B-202ENST00000455220 1550 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
BCO2Q9BYV7 SDR16C5-201ENST00000303749 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
BCO2Q9BYV7 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
BCO2Q9BYV7 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
BCO2Q9BYV7 CA12-203ENST00000422263 2556 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
BCO2Q9BYV7 NKX2-6-201ENST00000325017 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
BCO2Q9BYV7 GBGT1-201ENST00000372036 871 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
BCO2Q9BYV7 SNCA-209ENST00000506244 570 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
BCO2Q9BYV7 AC104581.1-203ENST00000640240 353 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
BCO2Q9BYV7 GMPPA-202ENST00000341142 1524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
BCO2Q9BYV7 GOLGA2P2Y-202ENST00000423852 1506 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
BCO2Q9BYV7 SLC25A35-205ENST00000580340 1541 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
BCO2Q9BYV7 PPEF2-207ENST00000621010 1797 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
BCO2Q9BYV7 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
BCO2Q9BYV7 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
BCO2Q9BYV7 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
BCO2Q9BYV7 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
BCO2Q9BYV7 C2orf81-206ENST00000640868 2407 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
BCO2Q9BYV7 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
BCO2Q9BYV7 CCNA1-203ENST00000625767 1699 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
BCO2Q9BYV7 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.6 ms