Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYD9

ACTRT3, Actin-related protein T3, humanhuman

Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTRT3Q9BYD9 COQ6-220ENST00000629426 1538 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ACTRT3Q9BYD9 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ACTRT3Q9BYD9 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ACTRT3Q9BYD9 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ACTRT3Q9BYD9 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ACTRT3Q9BYD9 APOPT1-201ENST00000409074 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ACTRT3Q9BYD9 DYRK1B-205ENST00000597639 1806 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ACTRT3Q9BYD9 NBPF11-205ENST00000615281 5494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ACTRT3Q9BYD9 RGS3-206ENST00000374136 2092 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ACTRT3Q9BYD9 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ACTRT3Q9BYD9 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ACTRT3Q9BYD9 PYCR1-201ENST00000329875 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ACTRT3Q9BYD9 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ACTRT3Q9BYD9 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ACTRT3Q9BYD9 CYP46A1-201ENST00000261835 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ACTRT3Q9BYD9 PRR15-201ENST00000319694 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ACTRT3Q9BYD9 GGT3P-204ENST00000453783 1664 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
ACTRT3Q9BYD9 PRDM5-202ENST00000394435 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ACTRT3Q9BYD9 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ACTRT3Q9BYD9 LINC00612-201ENST00000538094 2213 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ACTRT3Q9BYD9 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ACTRT3Q9BYD9 FAM135A-205ENST00000418814 6415 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ACTRT3Q9BYD9 BCL11B-202ENST00000357195 7559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ACTRT3Q9BYD9 SH2B1-206ENST00000545570 1488 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ACTRT3Q9BYD9 WLS-202ENST00000354777 2037 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ACTRT3Q9BYD9 ZNF451-203ENST00000370706 5268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ACTRT3Q9BYD9 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ACTRT3Q9BYD9 PANX2-201ENST00000159647 2964 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ACTRT3Q9BYD9 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ACTRT3Q9BYD9 MSANTD3-201ENST00000374885 786 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ACTRT3Q9BYD9 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ACTRT3Q9BYD9 ADGRB2-203ENST00000398538 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ACTRT3Q9BYD9 MCFD2-205ENST00000409218 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ACTRT3Q9BYD9 PDE6D-202ENST00000409772 672 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ACTRT3Q9BYD9 ATP6V0CP3-201ENST00000417255 467 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
ACTRT3Q9BYD9 CDK2AP2P3-201ENST00000422476 372 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
ACTRT3Q9BYD9 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ACTRT3Q9BYD9 CYB561-216ENST00000582297 897 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ACTRT3Q9BYD9 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ACTRT3Q9BYD9 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ACTRT3Q9BYD9 SLC9A3-AS1-204ENST00000606288 791 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ACTRT3Q9BYD9 AC010654.1-201ENST00000615722 808 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
ACTRT3Q9BYD9 FUT2-201ENST00000391876 1593 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ACTRT3Q9BYD9 PIKFYVE-204ENST00000407449 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ACTRT3Q9BYD9 PCM1-206ENST00000518537 2171 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ACTRT3Q9BYD9 SHTN1-202ENST00000355371 5361 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ACTRT3Q9BYD9 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ACTRT3Q9BYD9 AC026412.1-202ENST00000512335 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ACTRT3Q9BYD9 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ACTRT3Q9BYD9 ANKRD17-201ENST00000330838 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ACTRT3Q9BYD9 AC009292.1-201ENST00000502156 1986 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ACTRT3Q9BYD9 EVA1C-202ENST00000382699 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ACTRT3Q9BYD9 CHRNG-201ENST00000389492 1398 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ACTRT3Q9BYD9 KDM6A-212ENST00000543216 5655 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ACTRT3Q9BYD9 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ACTRT3Q9BYD9 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ACTRT3Q9BYD9 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ACTRT3Q9BYD9 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ACTRT3Q9BYD9 RRM2-202ENST00000360566 3673 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ACTRT3Q9BYD9 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ACTRT3Q9BYD9 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ACTRT3Q9BYD9 SYNDIG1L-202ENST00000554823 2420 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ACTRT3Q9BYD9 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ACTRT3Q9BYD9 FAM83A-202ENST00000518448 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ACTRT3Q9BYD9 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ACTRT3Q9BYD9 DHRS1-201ENST00000288111 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ACTRT3Q9BYD9 KLC1-212ENST00000553286 3135 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ACTRT3Q9BYD9 SLC22A12-205ENST00000473690 2522 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ACTRT3Q9BYD9 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ACTRT3Q9BYD9 ASAP3-212ENST00000618240 2226 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ACTRT3Q9BYD9 AL021453.1-201ENST00000333487 2989 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ACTRT3Q9BYD9 MANSC1-202ENST00000535902 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ACTRT3Q9BYD9 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ACTRT3Q9BYD9 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ACTRT3Q9BYD9 SERPINB6-201ENST00000335686 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ACTRT3Q9BYD9 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ACTRT3Q9BYD9 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ACTRT3Q9BYD9 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ACTRT3Q9BYD9 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ACTRT3Q9BYD9 AL391069.2-202ENST00000447795 622 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ACTRT3Q9BYD9 AC093909.1-201ENST00000504731 1122 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
ACTRT3Q9BYD9 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ACTRT3Q9BYD9 SPCS2-207ENST00000530257 612 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ACTRT3Q9BYD9 MMP17-203ENST00000535004 719 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ACTRT3Q9BYD9 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ACTRT3Q9BYD9 FAM181A-205ENST00000557719 1072 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ACTRT3Q9BYD9 UBE2Q2P1-205ENST00000559871 534 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ACTRT3Q9BYD9 OR7E47P-204ENST00000575924 449 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
ACTRT3Q9BYD9 TM2D1-212ENST00000606498 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ACTRT3Q9BYD9 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
ACTRT3Q9BYD9 HIC2-201ENST00000407464 6798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ACTRT3Q9BYD9 TIGAR-201ENST00000179259 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ACTRT3Q9BYD9 SMARCA4-201ENST00000344626 5392 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ACTRT3Q9BYD9 TCAF2-203ENST00000425618 2448 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ACTRT3Q9BYD9 AL031731.1-201ENST00000642131 2094 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
ACTRT3Q9BYD9 IGLL5-203ENST00000532223 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ACTRT3Q9BYD9 CDK2-204ENST00000553376 1725 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ACTRT3Q9BYD9 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ACTRT3Q9BYD9 HFE2-204ENST00000475797 1381 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ACTRT3Q9BYD9 CBX3P2-201ENST00000579647 1429 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.9 ms