Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY60

GABARAPL3, Gamma-aminobutyric acid receptor-associated protein-like 3, humanhuman

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABARAPL3Q9BY60 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
GABARAPL3Q9BY60 GRK5-202ENST00000392870 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
GABARAPL3Q9BY60 PIPOX-201ENST00000323372 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
GABARAPL3Q9BY60 SLC6A13-201ENST00000343164 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
GABARAPL3Q9BY60 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
GABARAPL3Q9BY60 SCAF1-201ENST00000360565 4306 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
GABARAPL3Q9BY60 BMP1-201ENST00000306349 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
GABARAPL3Q9BY60 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
GABARAPL3Q9BY60 SIGLEC16-201ENST00000599858 1437 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
GABARAPL3Q9BY60 PDZRN3-201ENST00000263666 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
GABARAPL3Q9BY60 CNOT10-202ENST00000331889 2573 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
GABARAPL3Q9BY60 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
GABARAPL3Q9BY60 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
GABARAPL3Q9BY60 CES4A-207ENST00000540947 2284 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
GABARAPL3Q9BY60 MTHFD1L-203ENST00000367321 3604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
GABARAPL3Q9BY60 SLC9A2-201ENST00000233969 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
GABARAPL3Q9BY60 MAP1LC3B-201ENST00000268607 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
GABARAPL3Q9BY60 TPT1-AS1-215ENST00000522673 1519 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
GABARAPL3Q9BY60 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
GABARAPL3Q9BY60 MPPED1-202ENST00000417669 3657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
GABARAPL3Q9BY60 AC069224.1-201ENST00000566372 1715 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
GABARAPL3Q9BY60 MTA1-203ENST00000406191 2770 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
GABARAPL3Q9BY60 FADS2-202ENST00000278840 3630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
GABARAPL3Q9BY60 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
GABARAPL3Q9BY60 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
GABARAPL3Q9BY60 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
GABARAPL3Q9BY60 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
GABARAPL3Q9BY60 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
GABARAPL3Q9BY60 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
GABARAPL3Q9BY60 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
GABARAPL3Q9BY60 NABP1-203ENST00000409510 843 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
GABARAPL3Q9BY60 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
GABARAPL3Q9BY60 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
GABARAPL3Q9BY60 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
GABARAPL3Q9BY60 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
GABARAPL3Q9BY60 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
GABARAPL3Q9BY60 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
GABARAPL3Q9BY60 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
GABARAPL3Q9BY60 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
GABARAPL3Q9BY60 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
GABARAPL3Q9BY60 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
GABARAPL3Q9BY60 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
GABARAPL3Q9BY60 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
GABARAPL3Q9BY60 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
GABARAPL3Q9BY60 PRRT2-205ENST00000567659 1470 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
GABARAPL3Q9BY60 TUBB6-211ENST00000591208 1492 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
GABARAPL3Q9BY60 PACS1-209ENST00000529757 1688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
GABARAPL3Q9BY60 IQCE-204ENST00000404984 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
GABARAPL3Q9BY60 AC092198.1-201ENST00000447651 2691 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
GABARAPL3Q9BY60 TRIM46-211ENST00000611379 3082 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
GABARAPL3Q9BY60 CRYZL1-202ENST00000361534 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
GABARAPL3Q9BY60 MGAT4B-202ENST00000337755 3027 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
GABARAPL3Q9BY60 PANK2-209ENST00000621507 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
GABARAPL3Q9BY60 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
GABARAPL3Q9BY60 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
GABARAPL3Q9BY60 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
GABARAPL3Q9BY60 EIF2AK4-208ENST00000559624 3548 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
GABARAPL3Q9BY60 CACNA2D3-201ENST00000288197 3671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
GABARAPL3Q9BY60 CACNA2D3-206ENST00000474759 3675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
GABARAPL3Q9BY60 BANK1-207ENST00000508653 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
GABARAPL3Q9BY60 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
GABARAPL3Q9BY60 LINC01144-201ENST00000626198 1710 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
GABARAPL3Q9BY60 LINC00884-202ENST00000448892 2680 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
GABARAPL3Q9BY60 GOLGA2P2Y-202ENST00000423852 1506 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
GABARAPL3Q9BY60 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
GABARAPL3Q9BY60 IL6ST-209ENST00000502326 3007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
GABARAPL3Q9BY60 SLC39A1-201ENST00000310483 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
GABARAPL3Q9BY60 MYEF2-201ENST00000267836 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
GABARAPL3Q9BY60 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
GABARAPL3Q9BY60 PC-214ENST00000628663 1470 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
GABARAPL3Q9BY60 ALPI-201ENST00000295463 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
GABARAPL3Q9BY60 SYT3-201ENST00000338916 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
GABARAPL3Q9BY60 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
GABARAPL3Q9BY60 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
GABARAPL3Q9BY60 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
GABARAPL3Q9BY60 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
GABARAPL3Q9BY60 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
GABARAPL3Q9BY60 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC15.23■□□□□ 0.03
GABARAPL3Q9BY60 AC127496.4-201ENST00000571591 549 ntTSL 4 BASIC15.23■□□□□ 0.03
GABARAPL3Q9BY60 MIR4492-201ENST00000581627 80 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
GABARAPL3Q9BY60 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
GABARAPL3Q9BY60 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
GABARAPL3Q9BY60 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
GABARAPL3Q9BY60 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
GABARAPL3Q9BY60 RNASE4-203ENST00000555835 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
GABARAPL3Q9BY60 PSMC3IP-202ENST00000393795 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
GABARAPL3Q9BY60 MBL1P-201ENST00000480805 1424 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
GABARAPL3Q9BY60 EIF4G1-204ENST00000352767 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
GABARAPL3Q9BY60 NFATC4-201ENST00000250373 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
GABARAPL3Q9BY60 PARVB-203ENST00000404989 1591 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
GABARAPL3Q9BY60 PARVB-204ENST00000406477 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
GABARAPL3Q9BY60 KCNMA1-261ENST00000639486 8850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
GABARAPL3Q9BY60 AC003986.2-201ENST00000419944 1711 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
GABARAPL3Q9BY60 ACIN1-205ENST00000457657 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
GABARAPL3Q9BY60 ZBTB7C-201ENST00000535628 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
GABARAPL3Q9BY60 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
GABARAPL3Q9BY60 PCGF3-213ENST00000620529 1899 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
GABARAPL3Q9BY60 CD8A-201ENST00000283635 2873 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
GABARAPL3Q9BY60 HTR1B-201ENST00000369947 2021 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
GABARAPL3Q9BY60 SLC22A23-210ENST00000490273 2043 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43 ms