Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXC9

BBS2, Bardet-Biedl syndrome 2 protein, humanhuman

Predictions only

Length 721 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BBS2Q9BXC9 AC104581.1-203ENST00000640240 353 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
BBS2Q9BXC9 RGN-203ENST00000397180 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
BBS2Q9BXC9 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
BBS2Q9BXC9 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
BBS2Q9BXC9 KIF5C-201ENST00000435030 6931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
BBS2Q9BXC9 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
BBS2Q9BXC9 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
BBS2Q9BXC9 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
BBS2Q9BXC9 ADAMTS13-206ENST00000371929 4934 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
BBS2Q9BXC9 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
BBS2Q9BXC9 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
BBS2Q9BXC9 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
BBS2Q9BXC9 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
BBS2Q9BXC9 AC016027.1-202ENST00000607927 1699 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
BBS2Q9BXC9 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
BBS2Q9BXC9 THTPA-203ENST00000554789 1595 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
BBS2Q9BXC9 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
BBS2Q9BXC9 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
BBS2Q9BXC9 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
BBS2Q9BXC9 NF2-202ENST00000338641 6025 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
BBS2Q9BXC9 ZNF324-203ENST00000536459 5653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
BBS2Q9BXC9 WDR61-201ENST00000267973 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
BBS2Q9BXC9 CGREF1-205ENST00000404694 1376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
BBS2Q9BXC9 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
BBS2Q9BXC9 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
BBS2Q9BXC9 FAM83A-202ENST00000518448 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
BBS2Q9BXC9 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
BBS2Q9BXC9 MON2-203ENST00000546600 6130 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
BBS2Q9BXC9 NUPR2-201ENST00000329309 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
BBS2Q9BXC9 AC018685.2-201ENST00000414065 547 ntTSL 4 BASIC17.19■□□□□ 0.34
BBS2Q9BXC9 GRTP1-AS1-201ENST00000419199 867 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
BBS2Q9BXC9 SLBP-205ENST00000488267 987 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
BBS2Q9BXC9 KRT8P23-201ENST00000560090 1207 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
BBS2Q9BXC9 ERCC1-212ENST00000591636 836 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
BBS2Q9BXC9 CKMT1B-215ENST00000627381 1074 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
BBS2Q9BXC9 CDC42EP4-209ENST00000630622 240 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
BBS2Q9BXC9 F10-202ENST00000375559 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
BBS2Q9BXC9 CCDC28A-202ENST00000611852 1505 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
BBS2Q9BXC9 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
BBS2Q9BXC9 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
BBS2Q9BXC9 NFIC-211ENST00000641145 8399 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
BBS2Q9BXC9 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
BBS2Q9BXC9 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
BBS2Q9BXC9 KCTD14-201ENST00000353172 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
BBS2Q9BXC9 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
BBS2Q9BXC9 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
BBS2Q9BXC9 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
BBS2Q9BXC9 AC053503.2-201ENST00000420563 1598 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
BBS2Q9BXC9 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
BBS2Q9BXC9 BORCS8-203ENST00000477565 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
BBS2Q9BXC9 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
BBS2Q9BXC9 NEO1-201ENST00000261908 7088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
BBS2Q9BXC9 PDCD5-203ENST00000419343 1799 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
BBS2Q9BXC9 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
BBS2Q9BXC9 OSR2-209ENST00000522510 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
BBS2Q9BXC9 CROCCP3-201ENST00000263511 5368 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
BBS2Q9BXC9 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
BBS2Q9BXC9 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
BBS2Q9BXC9 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
BBS2Q9BXC9 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
BBS2Q9BXC9 WLS-203ENST00000370971 700 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
BBS2Q9BXC9 HLA-DRB6-201ENST00000411500 1235 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
BBS2Q9BXC9 SYS1-203ENST00000414310 795 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
BBS2Q9BXC9 RBPMS2P1-201ENST00000437762 623 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
BBS2Q9BXC9 CTDSP1-204ENST00000443891 1109 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
BBS2Q9BXC9 AL391845.1-202ENST00000449154 437 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
BBS2Q9BXC9 AL807752.3-201ENST00000456356 748 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
BBS2Q9BXC9 OST4-203ENST00000456793 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
BBS2Q9BXC9 RPS3A-212ENST00000514682 985 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
BBS2Q9BXC9 AL109827.1-203ENST00000541176 872 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
BBS2Q9BXC9 AC027243.1-201ENST00000559539 758 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
BBS2Q9BXC9 LINC01225-203ENST00000563550 1244 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
BBS2Q9BXC9 AC021097.1-201ENST00000607902 574 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
BBS2Q9BXC9 Z92544.3-201ENST00000624747 417 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
BBS2Q9BXC9 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
BBS2Q9BXC9 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
BBS2Q9BXC9 CFAP45-201ENST00000368099 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
BBS2Q9BXC9 DNAH14-206ENST00000400952 1984 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
BBS2Q9BXC9 CHCHD3-201ENST00000262570 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
BBS2Q9BXC9 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
BBS2Q9BXC9 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
BBS2Q9BXC9 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
BBS2Q9BXC9 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
BBS2Q9BXC9 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
BBS2Q9BXC9 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
BBS2Q9BXC9 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
BBS2Q9BXC9 AHR-201ENST00000242057 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
BBS2Q9BXC9 OR6D1P-203ENST00000641209 4860 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
BBS2Q9BXC9 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
BBS2Q9BXC9 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
BBS2Q9BXC9 EVPLL-201ENST00000399134 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
BBS2Q9BXC9 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
BBS2Q9BXC9 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
BBS2Q9BXC9 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
BBS2Q9BXC9 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
BBS2Q9BXC9 RPS5-202ENST00000596046 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
BBS2Q9BXC9 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
BBS2Q9BXC9 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
BBS2Q9BXC9 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
BBS2Q9BXC9 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.9 ms