Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTE3

MCMBP, Mini-chromosome maintenance complex-binding protein, humanhuman

Predictions only

Length 642 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCMBPQ9BTE3 SNAI2-201ENST00000020945 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
MCMBPQ9BTE3 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
MCMBPQ9BTE3 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
MCMBPQ9BTE3 PPP1R3E-201ENST00000452015 4773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
MCMBPQ9BTE3 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
MCMBPQ9BTE3 TM9SF1-201ENST00000261789 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
MCMBPQ9BTE3 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
MCMBPQ9BTE3 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
MCMBPQ9BTE3 RASAL3-201ENST00000343625 3293 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
MCMBPQ9BTE3 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
MCMBPQ9BTE3 PSMC3IP-202ENST00000393795 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
MCMBPQ9BTE3 AP001189.5-201ENST00000637683 1413 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
MCMBPQ9BTE3 AL512625.3-203ENST00000445604 1602 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
MCMBPQ9BTE3 FAM49B-202ENST00000517654 1817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
MCMBPQ9BTE3 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
MCMBPQ9BTE3 MEAF6-202ENST00000373073 603 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
MCMBPQ9BTE3 TIMM17B-202ENST00000396779 1099 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
MCMBPQ9BTE3 NPY-203ENST00000407573 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
MCMBPQ9BTE3 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
MCMBPQ9BTE3 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
MCMBPQ9BTE3 ETFA-208ENST00000559602 792 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
MCMBPQ9BTE3 AC010776.2-201ENST00000588946 1081 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
MCMBPQ9BTE3 AC006557.2-201ENST00000592985 1240 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
MCMBPQ9BTE3 KLK6-204ENST00000594641 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
MCMBPQ9BTE3 AC092902.2-205ENST00000622381 394 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
MCMBPQ9BTE3 AC244517.11-201ENST00000624192 573 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
MCMBPQ9BTE3 ACY1-212ENST00000635797 1294 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
MCMBPQ9BTE3 AL353732.1-201ENST00000569618 1459 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
MCMBPQ9BTE3 ATP5S-201ENST00000245448 1671 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
MCMBPQ9BTE3 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
MCMBPQ9BTE3 IL11-201ENST00000264563 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
MCMBPQ9BTE3 FLJ31104-201ENST00000500093 2289 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
MCMBPQ9BTE3 AP001372.2-201ENST00000526036 2493 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
MCMBPQ9BTE3 SHQ1-201ENST00000325599 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
MCMBPQ9BTE3 ZNF707-223ENST00000532205 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
MCMBPQ9BTE3 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
MCMBPQ9BTE3 SURF4-208ENST00000613129 3148 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
MCMBPQ9BTE3 SHISA5-209ENST00000443308 1933 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
MCMBPQ9BTE3 ISCU-205ENST00000535729 1330 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
MCMBPQ9BTE3 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
MCMBPQ9BTE3 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
MCMBPQ9BTE3 ARHGAP22-201ENST00000249601 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
MCMBPQ9BTE3 AC025165.1-201ENST00000356672 2355 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
MCMBPQ9BTE3 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
MCMBPQ9BTE3 RAB37-208ENST00000402449 1560 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
MCMBPQ9BTE3 CYP4F22-202ENST00000601005 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
MCMBPQ9BTE3 C14orf93-202ENST00000341470 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
MCMBPQ9BTE3 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
MCMBPQ9BTE3 AL445931.1-201ENST00000412181 2112 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
MCMBPQ9BTE3 SLC27A5-201ENST00000263093 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
MCMBPQ9BTE3 ALDOA-226ENST00000569798 1499 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
MCMBPQ9BTE3 ARID5A-201ENST00000357485 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
MCMBPQ9BTE3 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
MCMBPQ9BTE3 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
MCMBPQ9BTE3 Z97056.1-201ENST00000433230 556 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
MCMBPQ9BTE3 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
MCMBPQ9BTE3 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
MCMBPQ9BTE3 RPS15P9-201ENST00000494093 319 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
MCMBPQ9BTE3 SFTPC-204ENST00000520605 519 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
MCMBPQ9BTE3 SFTPC-210ENST00000524255 681 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
MCMBPQ9BTE3 KBTBD4-203ENST00000525720 980 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
MCMBPQ9BTE3 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
MCMBPQ9BTE3 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
MCMBPQ9BTE3 HAPLN3-201ENST00000359595 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
MCMBPQ9BTE3 LGR6-205ENST00000439764 2487 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
MCMBPQ9BTE3 ANXA6-211ENST00000521512 1793 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
MCMBPQ9BTE3 GPAA1P2-202ENST00000606848 1787 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
MCMBPQ9BTE3 CICP6-201ENST00000457191 2729 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
MCMBPQ9BTE3 ZDHHC13-201ENST00000399351 2283 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
MCMBPQ9BTE3 POLR2A-201ENST00000572844 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
MCMBPQ9BTE3 UNC13A-205ENST00000551649 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
MCMBPQ9BTE3 SP100-204ENST00000409341 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
MCMBPQ9BTE3 AC107871.1-202ENST00000562767 3389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
MCMBPQ9BTE3 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
MCMBPQ9BTE3 GMPR2-217ENST00000559104 1719 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
MCMBPQ9BTE3 WDR45-239ENST00000634944 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
MCMBPQ9BTE3 IQCE-217ENST00000623361 6775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
MCMBPQ9BTE3 KRT76-201ENST00000332411 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
MCMBPQ9BTE3 FGF11-201ENST00000293829 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
MCMBPQ9BTE3 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
MCMBPQ9BTE3 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
MCMBPQ9BTE3 HNRNPA3-201ENST00000392524 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
MCMBPQ9BTE3 RCAN3-210ENST00000618490 2386 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
MCMBPQ9BTE3 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
MCMBPQ9BTE3 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
MCMBPQ9BTE3 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
MCMBPQ9BTE3 AC068389.2-201ENST00000529518 430 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
MCMBPQ9BTE3 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
MCMBPQ9BTE3 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
MCMBPQ9BTE3 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
MCMBPQ9BTE3 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
MCMBPQ9BTE3 AL022328.2-201ENST00000608016 640 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
MCMBPQ9BTE3 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
MCMBPQ9BTE3 BSG-214ENST00000614867 960 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
MCMBPQ9BTE3 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
MCMBPQ9BTE3 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
MCMBPQ9BTE3 TBC1D1-203ENST00000402522 1567 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
MCMBPQ9BTE3 TXNDC2-201ENST00000306084 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
MCMBPQ9BTE3 AL162727.3-201ENST00000635661 2787 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
MCMBPQ9BTE3 KIF25-201ENST00000351261 1326 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.7 ms