Protein–RNA interactions for Protein: Q99627

COPS8, COP9 signalosome complex subunit 8, humanhuman

Predictions only

Length 209 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPS8Q99627 NDUFA11-205ENST00000592634 2154 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
COPS8Q99627 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
COPS8Q99627 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
COPS8Q99627 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
COPS8Q99627 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
COPS8Q99627 ZNF451-203ENST00000370706 5268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
COPS8Q99627 THAP3-202ENST00000307896 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
COPS8Q99627 MRPS16-201ENST00000372940 866 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
COPS8Q99627 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
COPS8Q99627 PLA2G16-203ENST00000415826 1099 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
COPS8Q99627 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
COPS8Q99627 AP000892.1-201ENST00000504906 488 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
COPS8Q99627 POLD2P1-201ENST00000511220 997 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
COPS8Q99627 SMN2-210ENST00000511812 867 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
COPS8Q99627 IL32-212ENST00000526464 1198 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
COPS8Q99627 IL32-217ENST00000530538 674 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
COPS8Q99627 AC005606.1-201ENST00000567515 504 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
COPS8Q99627 TMEM220-AS1-206ENST00000583343 876 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
COPS8Q99627 MED16-214ENST00000617672 554 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
COPS8Q99627 PLA2G16-206ENST00000639271 957 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
COPS8Q99627 FOXS1-201ENST00000375978 1319 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
COPS8Q99627 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
COPS8Q99627 NPM2-209ENST00000521157 1484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
COPS8Q99627 PHKA1-202ENST00000373539 4476 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
COPS8Q99627 ESR2-201ENST00000267525 1518 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
COPS8Q99627 ATP6V1C2-204ENST00000635370 1578 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
COPS8Q99627 HOXA5-201ENST00000222726 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
COPS8Q99627 PPA2-201ENST00000341695 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
COPS8Q99627 CHAD-201ENST00000258969 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
COPS8Q99627 PRMT2-208ENST00000451211 1878 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
COPS8Q99627 ARHGEF40-201ENST00000298694 5919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
COPS8Q99627 WLS-202ENST00000354777 2037 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
COPS8Q99627 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
COPS8Q99627 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
COPS8Q99627 CA12-203ENST00000422263 2556 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
COPS8Q99627 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
COPS8Q99627 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
COPS8Q99627 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
COPS8Q99627 ARHGEF4-205ENST00000409359 5489 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
COPS8Q99627 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
COPS8Q99627 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
COPS8Q99627 CCT6A-202ENST00000335503 2529 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
COPS8Q99627 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
COPS8Q99627 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
COPS8Q99627 TTC8-216ENST00000614125 2377 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
COPS8Q99627 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
COPS8Q99627 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
COPS8Q99627 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
COPS8Q99627 ASH1L-207ENST00000548830 1862 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
COPS8Q99627 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
COPS8Q99627 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
COPS8Q99627 ATP5S-201ENST00000245448 1671 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
COPS8Q99627 RAD1-208ENST00000628399 1678 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
COPS8Q99627 HELT-201ENST00000338875 1008 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
COPS8Q99627 NRN1L-201ENST00000339176 710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
COPS8Q99627 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
COPS8Q99627 SELENOH-201ENST00000388857 833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
COPS8Q99627 ZGLP1-201ENST00000403352 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
COPS8Q99627 FALEC-201ENST00000416894 566 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
COPS8Q99627 AL391069.2-202ENST00000447795 622 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
COPS8Q99627 TSPAN32-207ENST00000451520 1236 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
COPS8Q99627 LINC00237-202ENST00000455890 1220 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
COPS8Q99627 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
COPS8Q99627 FBXL21-206ENST00000495672 589 ntTSL 4 BASIC16.57■□□□□ 0.24
COPS8Q99627 DDIAS-202ENST00000524921 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.57■□□□□ 0.24
COPS8Q99627 AL590999.1-203ENST00000606829 542 ntTSL 4 BASIC16.57■□□□□ 0.24
COPS8Q99627 PGLYRP1-201ENST00000008938 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
COPS8Q99627 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
COPS8Q99627 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
COPS8Q99627 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
COPS8Q99627 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
COPS8Q99627 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
COPS8Q99627 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
COPS8Q99627 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
COPS8Q99627 CEP76-202ENST00000423709 2197 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
COPS8Q99627 PDXDC1-204ENST00000455313 2183 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
COPS8Q99627 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
COPS8Q99627 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
COPS8Q99627 ORMDL1-203ENST00000392350 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
COPS8Q99627 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
COPS8Q99627 KDM4F-201ENST00000545950 1917 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
COPS8Q99627 SLC22A12-201ENST00000336464 1854 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
COPS8Q99627 MEG3-206ENST00000423456 1771 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
COPS8Q99627 SH2D2A-202ENST00000368199 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
COPS8Q99627 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
COPS8Q99627 EPN2-201ENST00000314728 4871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
COPS8Q99627 GULP1-209ENST00000410051 1595 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
COPS8Q99627 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
COPS8Q99627 SMIM10-201ENST00000330288 1536 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
COPS8Q99627 WDR45-234ENST00000634838 1545 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
COPS8Q99627 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
COPS8Q99627 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
COPS8Q99627 PSMC3IP-202ENST00000393795 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
COPS8Q99627 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
COPS8Q99627 TUBA4B-203ENST00000490341 1380 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
COPS8Q99627 C4orf50-202ENST00000531445 6860 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
COPS8Q99627 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
COPS8Q99627 STARD3NL-204ENST00000434197 1341 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
COPS8Q99627 FGFBP2-201ENST00000259989 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
COPS8Q99627 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.4 ms