Protein–RNA interactions for Protein: Q96SW2

CRBN, Protein cereblon, humanhuman

Predictions only

Length 442 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRBNQ96SW2 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CRBNQ96SW2 MAP4K1-208ENST00000589130 2654 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CRBNQ96SW2 CDC14A-202ENST00000361544 2417 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CRBNQ96SW2 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CRBNQ96SW2 SEMA4B-202ENST00000411539 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CRBNQ96SW2 EYA2-208ENST00000497062 2384 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CRBNQ96SW2 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CRBNQ96SW2 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CRBNQ96SW2 ARL8B-201ENST00000256496 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CRBNQ96SW2 AC026412.1-203ENST00000507841 2338 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CRBNQ96SW2 BBS5-201ENST00000295240 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CRBNQ96SW2 TIMM44-201ENST00000270538 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CRBNQ96SW2 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CRBNQ96SW2 CDKN1A-203ENST00000405375 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CRBNQ96SW2 FBXL5-201ENST00000341285 3385 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CRBNQ96SW2 TTYH2-206ENST00000529107 2015 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CRBNQ96SW2 MAGEA2-208ENST00000623438 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CRBNQ96SW2 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CRBNQ96SW2 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CRBNQ96SW2 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CRBNQ96SW2 ZNF213-206ENST00000574902 3208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CRBNQ96SW2 LHCGR-203ENST00000403273 1921 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CRBNQ96SW2 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CRBNQ96SW2 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CRBNQ96SW2 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CRBNQ96SW2 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CRBNQ96SW2 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CRBNQ96SW2 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CRBNQ96SW2 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CRBNQ96SW2 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CRBNQ96SW2 BLOC1S6-214ENST00000567461 1052 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CRBNQ96SW2 AC025062.2-201ENST00000605477 670 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
CRBNQ96SW2 WDR53-201ENST00000332629 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CRBNQ96SW2 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CRBNQ96SW2 ASAH1-223ENST00000636171 2283 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CRBNQ96SW2 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CRBNQ96SW2 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CRBNQ96SW2 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CRBNQ96SW2 ARFGAP1-210ENST00000519273 3176 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CRBNQ96SW2 MAD1L1-202ENST00000399654 2762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CRBNQ96SW2 CCDC155-201ENST00000447857 2378 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CRBNQ96SW2 KLHL36-204ENST00000564996 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CRBNQ96SW2 DDX19B-207ENST00000563206 1765 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CRBNQ96SW2 PANK2-209ENST00000621507 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CRBNQ96SW2 AL603832.2-201ENST00000566195 2125 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
CRBNQ96SW2 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CRBNQ96SW2 CDK2-204ENST00000553376 1725 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CRBNQ96SW2 PI4KAP1-204ENST00000612579 1703 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
CRBNQ96SW2 ADORA1-204ENST00000367236 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CRBNQ96SW2 CTNNBIP1-203ENST00000377263 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CRBNQ96SW2 SLC25A48-203ENST00000425402 2062 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CRBNQ96SW2 SP100-204ENST00000409341 1898 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CRBNQ96SW2 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CRBNQ96SW2 LATS1-202ENST00000392273 2567 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CRBNQ96SW2 LRRC20-206ENST00000395011 2903 ntTSL 4 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CRBNQ96SW2 ADAM9-206ENST00000481513 2387 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CRBNQ96SW2 FBXL12-206ENST00000588922 1843 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CRBNQ96SW2 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CRBNQ96SW2 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CRBNQ96SW2 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CRBNQ96SW2 PLA2G16-203ENST00000415826 1099 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CRBNQ96SW2 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CRBNQ96SW2 ARTN-206ENST00000472435 402 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CRBNQ96SW2 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CRBNQ96SW2 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CRBNQ96SW2 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CRBNQ96SW2 OPN5-206ENST00000638973 1090 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CRBNQ96SW2 PLA2G16-206ENST00000639271 957 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CRBNQ96SW2 RBM14-202ENST00000393979 1426 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CRBNQ96SW2 DACT1-202ENST00000395153 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CRBNQ96SW2 CCDC71L-202ENST00000523505 4232 ntAPPRIS P2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CRBNQ96SW2 MFSD1-203ENST00000415822 2423 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CRBNQ96SW2 DDX5-201ENST00000225792 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CRBNQ96SW2 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CRBNQ96SW2 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CRBNQ96SW2 DYRK3-201ENST00000367106 2329 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CRBNQ96SW2 TRIM24-202ENST00000415680 3799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CRBNQ96SW2 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CRBNQ96SW2 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CRBNQ96SW2 TMUB2-212ENST00000589785 1918 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CRBNQ96SW2 POLR2A-201ENST00000572844 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CRBNQ96SW2 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CRBNQ96SW2 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CRBNQ96SW2 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CRBNQ96SW2 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
CRBNQ96SW2 SNHG11-204ENST00000420006 720 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CRBNQ96SW2 SNHG11-206ENST00000432153 1181 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CRBNQ96SW2 AL109741.1-201ENST00000432195 403 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CRBNQ96SW2 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
CRBNQ96SW2 AC107918.2-201ENST00000530817 355 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
CRBNQ96SW2 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CRBNQ96SW2 AC092902.2-205ENST00000622381 394 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CRBNQ96SW2 AP001189.5-201ENST00000637683 1413 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CRBNQ96SW2 TYSND1-201ENST00000287078 3644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CRBNQ96SW2 PLPPR5-201ENST00000263177 3288 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CRBNQ96SW2 SNCAIP-202ENST00000261368 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CRBNQ96SW2 GMPPA-204ENST00000373908 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CRBNQ96SW2 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CRBNQ96SW2 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CRBNQ96SW2 CFAP45-201ENST00000368099 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.8 ms