Protein–RNA interactions for Protein: Q96S38

RPS6KC1, Ribosomal protein S6 kinase delta-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,066 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS6KC1Q96S38 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
RPS6KC1Q96S38 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
RPS6KC1Q96S38 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
RPS6KC1Q96S38 WDR45-234ENST00000634838 1545 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
RPS6KC1Q96S38 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
RPS6KC1Q96S38 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
RPS6KC1Q96S38 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
RPS6KC1Q96S38 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
RPS6KC1Q96S38 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
RPS6KC1Q96S38 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
RPS6KC1Q96S38 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
RPS6KC1Q96S38 CBWD1-201ENST00000314367 1771 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
RPS6KC1Q96S38 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
RPS6KC1Q96S38 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
RPS6KC1Q96S38 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
RPS6KC1Q96S38 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
RPS6KC1Q96S38 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
RPS6KC1Q96S38 AL160408.2-201ENST00000436039 693 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
RPS6KC1Q96S38 AC140658.5-201ENST00000438532 169 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
RPS6KC1Q96S38 SLC22A18-206ENST00000449793 1225 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
RPS6KC1Q96S38 SNCA-209ENST00000506244 570 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
RPS6KC1Q96S38 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
RPS6KC1Q96S38 CYB561D1-209ENST00000533024 913 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
RPS6KC1Q96S38 METTL23-203ENST00000586738 1059 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
RPS6KC1Q96S38 METTL23-205ENST00000588302 925 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
RPS6KC1Q96S38 AC027612.4-201ENST00000605371 583 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
RPS6KC1Q96S38 LINC02084-201ENST00000606069 1096 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
RPS6KC1Q96S38 SLC9A3-AS1-205ENST00000606319 477 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
RPS6KC1Q96S38 AC010735.2-201ENST00000607970 584 ntTSL 4 BASIC18.33■□□□□ 0.52
RPS6KC1Q96S38 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
RPS6KC1Q96S38 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
RPS6KC1Q96S38 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
RPS6KC1Q96S38 NDUFB2-AS1-201ENST00000465466 1648 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
RPS6KC1Q96S38 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
RPS6KC1Q96S38 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
RPS6KC1Q96S38 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
RPS6KC1Q96S38 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
RPS6KC1Q96S38 AC012569.1-201ENST00000591191 1524 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
RPS6KC1Q96S38 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
RPS6KC1Q96S38 BCL11B-202ENST00000357195 7559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
RPS6KC1Q96S38 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
RPS6KC1Q96S38 NFATC2-206ENST00000609943 5690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
RPS6KC1Q96S38 STPG3-AS1-201ENST00000612170 1701 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
RPS6KC1Q96S38 LILRA6-201ENST00000245621 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
RPS6KC1Q96S38 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
RPS6KC1Q96S38 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
RPS6KC1Q96S38 NR1H3-204ENST00000407404 1330 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
RPS6KC1Q96S38 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
RPS6KC1Q96S38 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
RPS6KC1Q96S38 FAM19A5-204ENST00000406880 833 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
RPS6KC1Q96S38 MIPEPP3-202ENST00000424756 347 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
RPS6KC1Q96S38 SHF-202ENST00000458022 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
RPS6KC1Q96S38 BATF2-204ENST00000527716 1230 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
RPS6KC1Q96S38 STT3A-AS1-201ENST00000530526 429 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
RPS6KC1Q96S38 AP000777.2-201ENST00000539897 501 ntTSL 4 BASIC18.32■□□□□ 0.52
RPS6KC1Q96S38 NDUFS7-216ENST00000546283 1060 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
RPS6KC1Q96S38 FAM227B-204ENST00000558594 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
RPS6KC1Q96S38 MARVELD3-206ENST00000567566 850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
RPS6KC1Q96S38 AC013565.3-202ENST00000570120 460 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
RPS6KC1Q96S38 PRELID3A-208ENST00000590956 777 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
RPS6KC1Q96S38 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
RPS6KC1Q96S38 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
RPS6KC1Q96S38 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
RPS6KC1Q96S38 FBP1-201ENST00000375326 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
RPS6KC1Q96S38 NPM2-209ENST00000521157 1484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
RPS6KC1Q96S38 OGFOD2-224ENST00000545612 1465 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
RPS6KC1Q96S38 AL353732.1-201ENST00000569618 1459 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
RPS6KC1Q96S38 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
RPS6KC1Q96S38 ZFP1-208ENST00000568079 1426 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
RPS6KC1Q96S38 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
RPS6KC1Q96S38 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
RPS6KC1Q96S38 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
RPS6KC1Q96S38 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
RPS6KC1Q96S38 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
RPS6KC1Q96S38 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
RPS6KC1Q96S38 PODNL1-201ENST00000254320 1859 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
RPS6KC1Q96S38 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
RPS6KC1Q96S38 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
RPS6KC1Q96S38 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
RPS6KC1Q96S38 COMMD5-202ENST00000402718 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
RPS6KC1Q96S38 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
RPS6KC1Q96S38 ROPN1L-201ENST00000274134 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
RPS6KC1Q96S38 STOM-202ENST00000347359 870 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
RPS6KC1Q96S38 C9orf116-202ENST00000371789 1278 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
RPS6KC1Q96S38 IZUMO4-201ENST00000395296 869 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
RPS6KC1Q96S38 SWI5-205ENST00000495313 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
RPS6KC1Q96S38 AC124067.2-201ENST00000521989 510 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
RPS6KC1Q96S38 RPL8-207ENST00000528957 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
RPS6KC1Q96S38 AC010615.2-202ENST00000597444 832 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
RPS6KC1Q96S38 TMIGD2-203ENST00000600114 489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
RPS6KC1Q96S38 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
RPS6KC1Q96S38 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
RPS6KC1Q96S38 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
RPS6KC1Q96S38 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
RPS6KC1Q96S38 KLK3-201ENST00000326003 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
RPS6KC1Q96S38 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
RPS6KC1Q96S38 SDCBP-201ENST00000260130 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
RPS6KC1Q96S38 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
RPS6KC1Q96S38 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
RPS6KC1Q96S38 PRR15-201ENST00000319694 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.2 ms