Protein–RNA interactions for Protein: Q96QS3

ARX, Homeobox protein ARX, humanhuman

Predictions only

Length 562 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARXQ96QS3 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ARXQ96QS3 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ARXQ96QS3 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ARXQ96QS3 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ARXQ96QS3 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ARXQ96QS3 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ARXQ96QS3 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ARXQ96QS3 FAM174A-201ENST00000312637 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ARXQ96QS3 PHYHD1-202ENST00000353176 1374 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ARXQ96QS3 AZI2-205ENST00000420543 1366 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ARXQ96QS3 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ARXQ96QS3 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ARXQ96QS3 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ARXQ96QS3 NSFL1C-201ENST00000216879 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ARXQ96QS3 VCX2-201ENST00000317103 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ARXQ96QS3 CGB3-201ENST00000357383 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ARXQ96QS3 CGB2-201ENST00000359342 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ARXQ96QS3 C1orf43-203ENST00000368516 872 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ARXQ96QS3 LCE3E-201ENST00000368789 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ARXQ96QS3 AC093423.3-201ENST00000370453 654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ARXQ96QS3 LRRC30-201ENST00000383467 923 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ARXQ96QS3 FLG-AS1-204ENST00000420707 906 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ARXQ96QS3 TTC31-205ENST00000442235 958 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ARXQ96QS3 RN7SL692P-201ENST00000464677 288 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
ARXQ96QS3 TSC22D3-213ENST00000506081 956 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ARXQ96QS3 KRT8P48-201ENST00000515599 1220 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
ARXQ96QS3 IGHV3-42-201ENST00000520410 361 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
ARXQ96QS3 AC027088.1-201ENST00000557966 1117 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ARXQ96QS3 AC140878.1-201ENST00000565277 250 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
ARXQ96QS3 SPDYE22P-201ENST00000582158 798 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
ARXQ96QS3 ZNF667-AS1-202ENST00000586091 678 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ARXQ96QS3 AL662799.1-202ENST00000614205 422 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
ARXQ96QS3 VCX-203ENST00000620630 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ARXQ96QS3 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ARXQ96QS3 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ARXQ96QS3 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ARXQ96QS3 KCNJ10-208ENST00000639408 1546 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ARXQ96QS3 NFATC2-206ENST00000609943 5690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ARXQ96QS3 CBWD1-201ENST00000314367 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ARXQ96QS3 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ARXQ96QS3 FAM131A-207ENST00000450976 1335 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ARXQ96QS3 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ARXQ96QS3 DUSP8-201ENST00000331588 4455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ARXQ96QS3 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ARXQ96QS3 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ARXQ96QS3 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ARXQ96QS3 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ARXQ96QS3 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ARXQ96QS3 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ARXQ96QS3 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ARXQ96QS3 RPL30-202ENST00000396070 440 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ARXQ96QS3 WRB-204ENST00000398753 699 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ARXQ96QS3 COLEC11-205ENST00000402922 1134 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ARXQ96QS3 LINC02055-207ENST00000524346 706 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ARXQ96QS3 BAD-207ENST00000544785 525 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ARXQ96QS3 AC004832.1-201ENST00000610936 1005 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ARXQ96QS3 SRP9-204ENST00000619790 377 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ARXQ96QS3 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ARXQ96QS3 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ARXQ96QS3 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ARXQ96QS3 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ARXQ96QS3 BSCL2-210ENST00000421906 1440 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ARXQ96QS3 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ARXQ96QS3 RAB37-208ENST00000402449 1560 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ARXQ96QS3 ITSN1-209ENST00000399352 5408 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ARXQ96QS3 DUOXA1-202ENST00000430224 1317 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ARXQ96QS3 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ARXQ96QS3 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ARXQ96QS3 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ARXQ96QS3 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ARXQ96QS3 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ARXQ96QS3 ITPRIPL1-205ENST00000536814 1947 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ARXQ96QS3 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ARXQ96QS3 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ARXQ96QS3 IQCE-204ENST00000404984 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ARXQ96QS3 FAM53C-202ENST00000434981 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ARXQ96QS3 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ARXQ96QS3 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ARXQ96QS3 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ARXQ96QS3 CRYBA2-201ENST00000295728 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ARXQ96QS3 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ARXQ96QS3 TMEM37-202ENST00000409826 794 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ARXQ96QS3 CTBP1-AS2-204ENST00000514984 533 ntTSL 4 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ARXQ96QS3 MIR210HG-203ENST00000533920 816 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ARXQ96QS3 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ARXQ96QS3 AC084346.2-201ENST00000607097 949 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
ARXQ96QS3 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ARXQ96QS3 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ARXQ96QS3 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ARXQ96QS3 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ARXQ96QS3 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ARXQ96QS3 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ARXQ96QS3 HEY1-208ENST00000523976 1325 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ARXQ96QS3 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
ARXQ96QS3 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
ARXQ96QS3 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ARXQ96QS3 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ARXQ96QS3 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ARXQ96QS3 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ARXQ96QS3 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.5 ms