Protein–RNA interactions for Protein: Q96MF7

NSMCE2, E3 SUMO-protein ligase NSE2, humanhuman

Predictions only

Length 247 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NSMCE2Q96MF7 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NSMCE2Q96MF7 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
NSMCE2Q96MF7 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NSMCE2Q96MF7 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NSMCE2Q96MF7 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NSMCE2Q96MF7 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NSMCE2Q96MF7 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NSMCE2Q96MF7 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NSMCE2Q96MF7 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NSMCE2Q96MF7 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NSMCE2Q96MF7 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NSMCE2Q96MF7 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NSMCE2Q96MF7 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NSMCE2Q96MF7 INPPL1-207ENST00000538751 4656 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NSMCE2Q96MF7 FBN2-205ENST00000508989 4987 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NSMCE2Q96MF7 C1RL-210ENST00000544702 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NSMCE2Q96MF7 GUCD1-204ENST00000407471 3482 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NSMCE2Q96MF7 GLIPR2-205ENST00000619700 1645 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NSMCE2Q96MF7 USP45-201ENST00000327681 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NSMCE2Q96MF7 SLC43A2-204ENST00000571650 3261 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NSMCE2Q96MF7 SMAD6-201ENST00000288840 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NSMCE2Q96MF7 TIGAR-201ENST00000179259 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NSMCE2Q96MF7 ASB7-202ENST00000343276 1694 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NSMCE2Q96MF7 ELF2-207ENST00000510408 1965 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NSMCE2Q96MF7 KRT8P49-201ENST00000604166 1432 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
NSMCE2Q96MF7 SEPT8-208ENST00000378721 1723 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
NSMCE2Q96MF7 STPG3-AS1-201ENST00000612170 1701 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
NSMCE2Q96MF7 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
NSMCE2Q96MF7 COL26A1-203ENST00000613501 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NSMCE2Q96MF7 B3GLCT-201ENST00000343307 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NSMCE2Q96MF7 PCDH19-202ENST00000373034 9756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NSMCE2Q96MF7 PRMT2-208ENST00000451211 1878 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NSMCE2Q96MF7 CMKLR1-204ENST00000550402 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NSMCE2Q96MF7 FAM222B-202ENST00000452648 2836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
NSMCE2Q96MF7 ALDH3A1-212ENST00000494157 1572 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
NSMCE2Q96MF7 HYAL1-201ENST00000266031 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NSMCE2Q96MF7 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NSMCE2Q96MF7 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NSMCE2Q96MF7 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
NSMCE2Q96MF7 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
NSMCE2Q96MF7 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
NSMCE2Q96MF7 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC15.85■□□□□ 0.13
NSMCE2Q96MF7 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NSMCE2Q96MF7 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NSMCE2Q96MF7 AC013467.2-201ENST00000605472 835 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
NSMCE2Q96MF7 LENG8-208ENST00000610347 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
NSMCE2Q96MF7 C2orf54-203ENST00000402775 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
NSMCE2Q96MF7 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NSMCE2Q96MF7 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NSMCE2Q96MF7 TNXB-208ENST00000611016 6083 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
NSMCE2Q96MF7 GHDC-207ENST00000587427 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NSMCE2Q96MF7 CDIP1-209ENST00000567695 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NSMCE2Q96MF7 NUDT16-203ENST00000537561 5943 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
NSMCE2Q96MF7 RB1CC1-202ENST00000435644 6614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NSMCE2Q96MF7 GPAT2-204ENST00000453542 2466 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
NSMCE2Q96MF7 ADAM15-208ENST00000447332 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
NSMCE2Q96MF7 AL353997.2-201ENST00000579352 4955 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NSMCE2Q96MF7 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NSMCE2Q96MF7 GRB7-205ENST00000445327 2197 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
NSMCE2Q96MF7 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NSMCE2Q96MF7 ZNF7-207ENST00000528372 2905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NSMCE2Q96MF7 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NSMCE2Q96MF7 SALL4-203ENST00000395997 1918 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NSMCE2Q96MF7 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NSMCE2Q96MF7 LRRC47-201ENST00000378251 4310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NSMCE2Q96MF7 PDE3A-201ENST00000359062 7576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NSMCE2Q96MF7 EIF2B4-206ENST00000451130 1633 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NSMCE2Q96MF7 AC006277.1-201ENST00000624348 1610 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
NSMCE2Q96MF7 CHD4-210ENST00000544040 6514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
NSMCE2Q96MF7 AP001372.2-201ENST00000526036 2493 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NSMCE2Q96MF7 GGT3P-204ENST00000453783 1664 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
NSMCE2Q96MF7 TMPO-AS1-202ENST00000548760 3357 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NSMCE2Q96MF7 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
NSMCE2Q96MF7 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NSMCE2Q96MF7 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
NSMCE2Q96MF7 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
NSMCE2Q96MF7 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
NSMCE2Q96MF7 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NSMCE2Q96MF7 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NSMCE2Q96MF7 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
NSMCE2Q96MF7 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NSMCE2Q96MF7 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
NSMCE2Q96MF7 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NSMCE2Q96MF7 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
NSMCE2Q96MF7 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
NSMCE2Q96MF7 ASAH1-231ENST00000636577 2129 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
NSMCE2Q96MF7 TNR-201ENST00000263525 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
NSMCE2Q96MF7 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NSMCE2Q96MF7 GATA4-206ENST00000528712 2614 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
NSMCE2Q96MF7 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NSMCE2Q96MF7 INTS11-203ENST00000419704 1798 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
NSMCE2Q96MF7 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
NSMCE2Q96MF7 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
NSMCE2Q96MF7 SIX6-201ENST00000327720 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NSMCE2Q96MF7 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
NSMCE2Q96MF7 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NSMCE2Q96MF7 ANXA11-203ENST00000422982 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NSMCE2Q96MF7 ZBTB17-216ENST00000537142 2511 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
NSMCE2Q96MF7 SCLT1-208ENST00000506368 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
NSMCE2Q96MF7 RUSC1-205ENST00000368354 3114 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.1 ms