Protein–RNA interactions for Protein: Q96L91

EP400, E1A-binding protein p400, humanhuman

Predictions only

Length 3,159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EP400Q96L91 CIAPIN1-207ENST00000565961 1814 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
EP400Q96L91 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
EP400Q96L91 PEA15-202ENST00000368076 2694 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
EP400Q96L91 SCP2-201ENST00000371509 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
EP400Q96L91 PRMT2-208ENST00000451211 1878 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
EP400Q96L91 LINC02028-203ENST00000443776 453 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
EP400Q96L91 TMBIM4-205ENST00000535812 766 ntTSL 4 BASIC21.3■■□□□ 1
EP400Q96L91 TMBIM4-212ENST00000556010 610 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
EP400Q96L91 AC009065.5-201ENST00000565937 596 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
EP400Q96L91 AC011466.1-201ENST00000595201 566 ntTSL 4 BASIC21.3■■□□□ 1
EP400Q96L91 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
EP400Q96L91 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
EP400Q96L91 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
EP400Q96L91 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
EP400Q96L91 OGDH-204ENST00000443864 1744 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
EP400Q96L91 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
EP400Q96L91 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
EP400Q96L91 KIAA0895-207ENST00000436884 1952 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
EP400Q96L91 AC104784.1-201ENST00000473096 294 ntBASIC21.29■■□□□ 1
EP400Q96L91 IMP3P2-201ENST00000489760 475 ntBASIC21.29■■□□□ 1
EP400Q96L91 AC008750.2-202ENST00000532688 729 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
EP400Q96L91 SIRT2-219ENST00000613542 1170 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
EP400Q96L91 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
EP400Q96L91 NUDT1-203ENST00000356714 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
EP400Q96L91 NUDT1-204ENST00000397046 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
EP400Q96L91 AL161719.1-201ENST00000442716 385 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
EP400Q96L91 LY6G6C-202ENST00000495859 937 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
EP400Q96L91 CCDC153-204ENST00000503566 1295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
EP400Q96L91 RCHY1-210ENST00000513257 759 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
EP400Q96L91 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
EP400Q96L91 LSM10-201ENST00000315732 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
EP400Q96L91 H1FOO-201ENST00000324382 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
EP400Q96L91 HIST1H2AH-201ENST00000377459 387 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
EP400Q96L91 AL109811.2-201ENST00000447600 487 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
EP400Q96L91 HNRNPA1P13-201ENST00000510646 963 ntBASIC21.28■■□□□ 1
EP400Q96L91 AC025259.3-202ENST00000564363 687 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
EP400Q96L91 AL021997.3-201ENST00000621053 557 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.28■■□□□ 1
EP400Q96L91 FP565260.5-201ENST00000623188 479 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
EP400Q96L91 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
EP400Q96L91 HACD3-206ENST00000565299 1465 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
EP400Q96L91 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
EP400Q96L91 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
EP400Q96L91 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
EP400Q96L91 CNN2P8-201ENST00000421872 913 ntBASIC21.28■■□□□ 1
EP400Q96L91 EIF3M-203ENST00000524896 1207 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
EP400Q96L91 RHBDL2-203ENST00000540558 697 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
EP400Q96L91 AC133539.2-201ENST00000604757 467 ntBASIC21.28■■□□□ 1
EP400Q96L91 COPS9-205ENST00000607357 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
EP400Q96L91 ST7L-207ENST00000369669 1743 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
EP400Q96L91 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
EP400Q96L91 SLC39A6-202ENST00000440549 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
EP400Q96L91 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
EP400Q96L91 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC21.28■■□□□ 1
EP400Q96L91 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
EP400Q96L91 IP6K2-202ENST00000340879 1185 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
EP400Q96L91 ARL16-201ENST00000397498 1227 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
EP400Q96L91 AL136361.1-201ENST00000435429 506 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
EP400Q96L91 Z93015.1-201ENST00000451718 390 ntBASIC21.28■■□□□ 1
EP400Q96L91 PCOLCE2-208ENST00000485766 1088 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
EP400Q96L91 PTP4A1P2-201ENST00000546033 454 ntBASIC21.28■■□□□ 1
EP400Q96L91 AC036164.1-201ENST00000570544 333 ntBASIC21.28■■□□□ 1
EP400Q96L91 MPDU1-223ENST00000582151 728 ntBASIC21.28■■□□□ 1
EP400Q96L91 YIF1B-216ENST00000592694 1181 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
EP400Q96L91 ARL16-214ENST00000621051 1181 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
EP400Q96L91 PKIG-204ENST00000372889 1489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
EP400Q96L91 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
EP400Q96L91 CD14-202ENST00000401743 1648 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
EP400Q96L91 CDC25B-204ENST00000379598 2990 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
EP400Q96L91 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
EP400Q96L91 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
EP400Q96L91 TSPAN12-202ENST00000415871 1495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
EP400Q96L91 RAB1A-201ENST00000398529 1198 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
EP400Q96L91 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
EP400Q96L91 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
EP400Q96L91 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
EP400Q96L91 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
EP400Q96L91 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
EP400Q96L91 FAHD2B-202ENST00000414820 1388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
EP400Q96L91 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
EP400Q96L91 CHST10-203ENST00000409701 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
EP400Q96L91 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
EP400Q96L91 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
EP400Q96L91 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
EP400Q96L91 AC092143.3-201ENST00000565150 1900 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
EP400Q96L91 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
EP400Q96L91 PSME1-201ENST00000206451 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
EP400Q96L91 RNF186-201ENST00000375121 1250 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
EP400Q96L91 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
EP400Q96L91 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
EP400Q96L91 FDPS-201ENST00000356657 1478 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
EP400Q96L91 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
EP400Q96L91 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
EP400Q96L91 NFIC-203ENST00000443272 1716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
EP400Q96L91 DEK-201ENST00000244776 1441 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
EP400Q96L91 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
EP400Q96L91 NAT8-201ENST00000272425 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
EP400Q96L91 AC018467.1-201ENST00000421581 717 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
EP400Q96L91 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
EP400Q96L91 IFITM3-204ENST00000602735 713 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
EP400Q96L91 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55 ms