Protein–RNA interactions for Protein: Q96L46

CAPNS2, Calpain small subunit 2, humanhuman

Predictions only

Length 248 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS2Q96L46 AC018467.1-201ENST00000421581 717 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CAPNS2Q96L46 AC073133.1-201ENST00000426187 432 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CAPNS2Q96L46 C1QTNF6-203ENST00000434784 975 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CAPNS2Q96L46 AC072022.1-201ENST00000450760 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CAPNS2Q96L46 AC104306.2-201ENST00000451877 341 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
CAPNS2Q96L46 LYRM9-204ENST00000503642 432 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CAPNS2Q96L46 AC104758.2-201ENST00000562716 483 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CAPNS2Q96L46 AC012173.1-201ENST00000567942 430 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CAPNS2Q96L46 C19orf38-203ENST00000592854 1060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CAPNS2Q96L46 RPS15-212ENST00000593052 629 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CAPNS2Q96L46 ATF5-205ENST00000600336 682 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CAPNS2Q96L46 IFITM3-204ENST00000602735 713 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CAPNS2Q96L46 AC244452.3-201ENST00000636814 210 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
CAPNS2Q96L46 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CAPNS2Q96L46 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CAPNS2Q96L46 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CAPNS2Q96L46 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CAPNS2Q96L46 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CAPNS2Q96L46 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CAPNS2Q96L46 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CAPNS2Q96L46 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CAPNS2Q96L46 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CAPNS2Q96L46 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CAPNS2Q96L46 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CAPNS2Q96L46 MAP2K6-209ENST00000613873 1509 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CAPNS2Q96L46 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CAPNS2Q96L46 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CAPNS2Q96L46 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CAPNS2Q96L46 TMEM52-203ENST00000378602 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CAPNS2Q96L46 ADAMTSL1-208ENST00000380570 931 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CAPNS2Q96L46 RPARP-AS1-201ENST00000473970 1297 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CAPNS2Q96L46 SELENOT-203ENST00000477889 944 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CAPNS2Q96L46 SPATA24-205ENST00000509959 641 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CAPNS2Q96L46 RERG-205ENST00000537647 935 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CAPNS2Q96L46 TGIF2-C20orf24-201ENST00000558530 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CAPNS2Q96L46 COX6B1-204ENST00000592141 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CAPNS2Q96L46 SIGLEC29P-201ENST00000599873 1114 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
CAPNS2Q96L46 ZNF347-208ENST00000601804 496 ntTSL 4 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CAPNS2Q96L46 RWDD4-205ENST00000510968 1551 ntTSL 4 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CAPNS2Q96L46 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CAPNS2Q96L46 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CAPNS2Q96L46 MLKL-201ENST00000306247 1781 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CAPNS2Q96L46 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CAPNS2Q96L46 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CAPNS2Q96L46 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CAPNS2Q96L46 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CAPNS2Q96L46 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CAPNS2Q96L46 HNRNPA1P48-201ENST00000562726 1377 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
CAPNS2Q96L46 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CAPNS2Q96L46 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CAPNS2Q96L46 AL607033.1-201ENST00000623900 1599 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
CAPNS2Q96L46 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CAPNS2Q96L46 MIF4GD-208ENST00000579297 1419 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CAPNS2Q96L46 AGRP-201ENST00000290953 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CAPNS2Q96L46 NOSIP-201ENST00000339093 1000 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CAPNS2Q96L46 UPF3AP2-201ENST00000457924 1132 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
CAPNS2Q96L46 DMKN-216ENST00000458071 510 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CAPNS2Q96L46 AKR7A2P1-201ENST00000460134 915 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
CAPNS2Q96L46 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CAPNS2Q96L46 AC106738.2-201ENST00000559802 557 ntTSL 4 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CAPNS2Q96L46 AL359711.2-201ENST00000563105 872 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
CAPNS2Q96L46 AC025810.1-201ENST00000569986 981 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CAPNS2Q96L46 AL358473.2-201ENST00000610411 556 ntTSL 4 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CAPNS2Q96L46 AL358215.2-201ENST00000639693 946 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CAPNS2Q96L46 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CAPNS2Q96L46 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CAPNS2Q96L46 C1QTNF6-202ENST00000397110 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CAPNS2Q96L46 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CAPNS2Q96L46 FDPS-201ENST00000356657 1478 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CAPNS2Q96L46 MRPS21-201ENST00000581066 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CAPNS2Q96L46 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CAPNS2Q96L46 PRPS2-203ENST00000398491 1348 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CAPNS2Q96L46 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CAPNS2Q96L46 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CAPNS2Q96L46 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
CAPNS2Q96L46 PDE4DIP-230ENST00000530472 1690 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CAPNS2Q96L46 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CAPNS2Q96L46 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CAPNS2Q96L46 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
CAPNS2Q96L46 MAGEA8-201ENST00000286482 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CAPNS2Q96L46 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CAPNS2Q96L46 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CAPNS2Q96L46 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CAPNS2Q96L46 ZNF711-201ENST00000276123 2887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CAPNS2Q96L46 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CAPNS2Q96L46 MED19-201ENST00000337672 1637 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CAPNS2Q96L46 DPM2-202ENST00000373110 738 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CAPNS2Q96L46 AL662890.1-201ENST00000396818 632 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
CAPNS2Q96L46 AL021707.3-201ENST00000418803 527 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CAPNS2Q96L46 OLR1-203ENST00000432556 950 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CAPNS2Q96L46 AC016694.1-201ENST00000434179 700 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
CAPNS2Q96L46 LINC00642-202ENST00000442515 670 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CAPNS2Q96L46 EIF4HP1-201ENST00000453115 687 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
CAPNS2Q96L46 AC097717.1-202ENST00000457577 740 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CAPNS2Q96L46 UCHL1-204ENST00000503431 917 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CAPNS2Q96L46 AC087386.1-201ENST00000553658 572 ntTSL 4 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CAPNS2Q96L46 ZNF596-213ENST00000640035 1163 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CAPNS2Q96L46 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CAPNS2Q96L46 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CAPNS2Q96L46 SLC22A12-201ENST00000336464 1854 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.3 ms