Protein–RNA interactions for Protein: Q96KX2

CAPZA3, F-actin-capping protein subunit alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 299 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPZA3Q96KX2 TRPC4AP-201ENST00000252015 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CAPZA3Q96KX2 MOXD1-202ENST00000367963 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CAPZA3Q96KX2 TBC1D22A-205ENST00000406733 2267 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
CAPZA3Q96KX2 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
CAPZA3Q96KX2 IL6ST-209ENST00000502326 3007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
CAPZA3Q96KX2 AL603832.2-201ENST00000566195 2125 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
CAPZA3Q96KX2 ASAH1-231ENST00000636577 2129 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
CAPZA3Q96KX2 TRIM46-203ENST00000368383 2666 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CAPZA3Q96KX2 NRP1-203ENST00000374821 1988 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CAPZA3Q96KX2 DNAH14-206ENST00000400952 1984 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CAPZA3Q96KX2 SEPT5-204ENST00000406395 1974 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CAPZA3Q96KX2 ELF2-207ENST00000510408 1965 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CAPZA3Q96KX2 ALPL-204ENST00000374840 2589 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CAPZA3Q96KX2 MGME1-202ENST00000377709 1936 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CAPZA3Q96KX2 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CAPZA3Q96KX2 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CAPZA3Q96KX2 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CAPZA3Q96KX2 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CAPZA3Q96KX2 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CAPZA3Q96KX2 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CAPZA3Q96KX2 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CAPZA3Q96KX2 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CAPZA3Q96KX2 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CAPZA3Q96KX2 CDH7-203ENST00000536984 3766 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CAPZA3Q96KX2 CCR7-203ENST00000579344 1874 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CAPZA3Q96KX2 ITPR3-201ENST00000374316 9870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CAPZA3Q96KX2 KCNC2-207ENST00000548513 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CAPZA3Q96KX2 MIEF2-203ENST00000395704 2879 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CAPZA3Q96KX2 LINC01270-201ENST00000371639 2281 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CAPZA3Q96KX2 ASAH1-223ENST00000636171 2283 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CAPZA3Q96KX2 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CAPZA3Q96KX2 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CAPZA3Q96KX2 SUCLA2-201ENST00000378654 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CAPZA3Q96KX2 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CAPZA3Q96KX2 LINC00895-201ENST00000629028 1637 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
CAPZA3Q96KX2 RFK-201ENST00000376736 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CAPZA3Q96KX2 MMP2-201ENST00000219070 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CAPZA3Q96KX2 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CAPZA3Q96KX2 MAPT-201ENST00000262410 6762 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CAPZA3Q96KX2 ANKRD33B-201ENST00000296657 9188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CAPZA3Q96KX2 CNPY4-201ENST00000262932 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CAPZA3Q96KX2 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CAPZA3Q96KX2 PLIN1-201ENST00000300055 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CAPZA3Q96KX2 CHMP1A-201ENST00000397901 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CAPZA3Q96KX2 AC009292.1-201ENST00000502156 1986 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CAPZA3Q96KX2 RBM12-201ENST00000359646 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CAPZA3Q96KX2 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CAPZA3Q96KX2 SGSH-201ENST00000326317 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CAPZA3Q96KX2 DDX1-201ENST00000233084 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CAPZA3Q96KX2 CLEC18A-209ENST00000615430 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CAPZA3Q96KX2 CLEC18C-211ENST00000618957 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CAPZA3Q96KX2 CLEC18B-205ENST00000619275 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CAPZA3Q96KX2 PDCD5-203ENST00000419343 1799 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CAPZA3Q96KX2 CPEB2-201ENST00000259997 5612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CAPZA3Q96KX2 PAQR8-202ENST00000442253 4738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CAPZA3Q96KX2 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
CAPZA3Q96KX2 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CAPZA3Q96KX2 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CAPZA3Q96KX2 LRRFIP2-205ENST00000421276 2522 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CAPZA3Q96KX2 SH2D2A-202ENST00000368199 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CAPZA3Q96KX2 PCDHA6-203ENST00000529310 5374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CAPZA3Q96KX2 ARL15-201ENST00000502271 3248 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CAPZA3Q96KX2 SYT5-207ENST00000590851 3619 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CAPZA3Q96KX2 ATXN7-213ENST00000538065 6842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CAPZA3Q96KX2 ZNF687-201ENST00000324048 5378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CAPZA3Q96KX2 MYEF2-201ENST00000267836 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CAPZA3Q96KX2 UBR5-207ENST00000520539 10297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CAPZA3Q96KX2 KLF11-201ENST00000305883 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CAPZA3Q96KX2 ENDOV-212ENST00000520284 2500 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CAPZA3Q96KX2 ADAM15-208ENST00000447332 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CAPZA3Q96KX2 SUPT20HL2-201ENST00000486479 2409 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
CAPZA3Q96KX2 CDIP1-209ENST00000567695 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CAPZA3Q96KX2 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CAPZA3Q96KX2 AC092198.1-201ENST00000447651 2691 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CAPZA3Q96KX2 PRX-201ENST00000291825 5502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CAPZA3Q96KX2 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CAPZA3Q96KX2 AC100830.1-201ENST00000560387 1609 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CAPZA3Q96KX2 PRMT5-203ENST00000397440 1907 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CAPZA3Q96KX2 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CAPZA3Q96KX2 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CAPZA3Q96KX2 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CAPZA3Q96KX2 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CAPZA3Q96KX2 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
CAPZA3Q96KX2 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
CAPZA3Q96KX2 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CAPZA3Q96KX2 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CAPZA3Q96KX2 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CAPZA3Q96KX2 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
CAPZA3Q96KX2 HAUS3-204ENST00000506763 3166 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CAPZA3Q96KX2 ADAM6-201ENST00000606026 1843 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CAPZA3Q96KX2 PHLDB1-202ENST00000361417 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CAPZA3Q96KX2 SYNCRIP-202ENST00000369622 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CAPZA3Q96KX2 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CAPZA3Q96KX2 PRKD2-216ENST00000601806 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CAPZA3Q96KX2 FEN1-201ENST00000305885 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CAPZA3Q96KX2 ASXL1-210ENST00000613218 7038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CAPZA3Q96KX2 COL26A1-201ENST00000313669 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CAPZA3Q96KX2 MBD4-203ENST00000429544 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CAPZA3Q96KX2 ZNF628-203ENST00000598519 3847 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CAPZA3Q96KX2 DNAJB9-201ENST00000249356 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.2 ms