Protein–RNA interactions for Protein: Q96EY1

DNAJA3, DnaJ homolog subfamily A member 3, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 480 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNAJA3Q96EY1 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
DNAJA3Q96EY1 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
DNAJA3Q96EY1 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
DNAJA3Q96EY1 AC226118.1-201ENST00000515213 2146 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
DNAJA3Q96EY1 DUOX1-202ENST00000389037 5483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
DNAJA3Q96EY1 NSUN2-201ENST00000264670 3303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
DNAJA3Q96EY1 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
DNAJA3Q96EY1 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
DNAJA3Q96EY1 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
DNAJA3Q96EY1 NOVA2-201ENST00000263257 7803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
DNAJA3Q96EY1 TRPC6-202ENST00000348423 2448 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
DNAJA3Q96EY1 WT1-209ENST00000530998 2421 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
DNAJA3Q96EY1 GDF6-201ENST00000287020 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
DNAJA3Q96EY1 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
DNAJA3Q96EY1 AP1S3-203ENST00000396654 830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
DNAJA3Q96EY1 TIMM17B-202ENST00000396779 1099 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
DNAJA3Q96EY1 AC108073.2-201ENST00000464002 357 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
DNAJA3Q96EY1 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
DNAJA3Q96EY1 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC15.32■□□□□ 0.04
DNAJA3Q96EY1 HEXA-210ENST00000567213 1000 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
DNAJA3Q96EY1 MIR4751-201ENST00000578027 74 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
DNAJA3Q96EY1 TMEM178A-206ENST00000618232 1286 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
DNAJA3Q96EY1 AL805961.1-202ENST00000641562 540 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
DNAJA3Q96EY1 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
DNAJA3Q96EY1 FOXP3-206ENST00000557224 1371 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
DNAJA3Q96EY1 EVPLL-201ENST00000399134 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
DNAJA3Q96EY1 STEAP3-204ENST00000409811 2103 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
DNAJA3Q96EY1 SNTG2-202ENST00000407292 1436 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
DNAJA3Q96EY1 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
DNAJA3Q96EY1 NSFL1C-201ENST00000216879 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
DNAJA3Q96EY1 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
DNAJA3Q96EY1 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
DNAJA3Q96EY1 KCNK7-203ENST00000394216 1563 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
DNAJA3Q96EY1 CTDSP2-201ENST00000398073 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
DNAJA3Q96EY1 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
DNAJA3Q96EY1 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
DNAJA3Q96EY1 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
DNAJA3Q96EY1 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
DNAJA3Q96EY1 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
DNAJA3Q96EY1 TINF2-208ENST00000558566 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
DNAJA3Q96EY1 SEMA4B-202ENST00000411539 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
DNAJA3Q96EY1 GBGT1-204ENST00000372043 1935 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
DNAJA3Q96EY1 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
DNAJA3Q96EY1 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
DNAJA3Q96EY1 SCAI-202ENST00000373549 1968 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
DNAJA3Q96EY1 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
DNAJA3Q96EY1 PPP6R1-201ENST00000412770 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
DNAJA3Q96EY1 PDE12-202ENST00000487257 3040 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
DNAJA3Q96EY1 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
DNAJA3Q96EY1 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
DNAJA3Q96EY1 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
DNAJA3Q96EY1 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
DNAJA3Q96EY1 SLC2A6-201ENST00000371897 2301 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
DNAJA3Q96EY1 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
DNAJA3Q96EY1 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
DNAJA3Q96EY1 AC093909.1-201ENST00000504731 1122 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
DNAJA3Q96EY1 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
DNAJA3Q96EY1 BAX-213ENST00000539787 458 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
DNAJA3Q96EY1 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
DNAJA3Q96EY1 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
DNAJA3Q96EY1 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
DNAJA3Q96EY1 KLK6-204ENST00000594641 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
DNAJA3Q96EY1 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
DNAJA3Q96EY1 ZEB1-AS1-209ENST00000607455 559 ntTSL 4 BASIC15.31■□□□□ 0.04
DNAJA3Q96EY1 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
DNAJA3Q96EY1 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
DNAJA3Q96EY1 LINC02199-201ENST00000506655 2702 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
DNAJA3Q96EY1 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
DNAJA3Q96EY1 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
DNAJA3Q96EY1 RGS6-210ENST00000553530 5685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
DNAJA3Q96EY1 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
DNAJA3Q96EY1 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
DNAJA3Q96EY1 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
DNAJA3Q96EY1 WDR53-201ENST00000332629 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
DNAJA3Q96EY1 BVES-202ENST00000336775 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
DNAJA3Q96EY1 HARS-204ENST00000438307 1789 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
DNAJA3Q96EY1 MIER1-206ENST00000371016 1802 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
DNAJA3Q96EY1 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
DNAJA3Q96EY1 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
DNAJA3Q96EY1 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
DNAJA3Q96EY1 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
DNAJA3Q96EY1 SERTAD4-201ENST00000367012 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
DNAJA3Q96EY1 PDHX-203ENST00000448838 2653 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
DNAJA3Q96EY1 AC092364.2-201ENST00000596710 2692 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
DNAJA3Q96EY1 ZNF346-202ENST00000503039 2774 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
DNAJA3Q96EY1 PPP1R26-205ENST00000605286 4744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
DNAJA3Q96EY1 MLLT10-203ENST00000377072 5126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
DNAJA3Q96EY1 PITPNM2-208ENST00000542749 6660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
DNAJA3Q96EY1 ISCA2-201ENST00000298818 851 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
DNAJA3Q96EY1 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
DNAJA3Q96EY1 AP4S1-202ENST00000313566 839 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
DNAJA3Q96EY1 MXI1-202ENST00000332674 3470 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
DNAJA3Q96EY1 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
DNAJA3Q96EY1 BMP2K-201ENST00000335016 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
DNAJA3Q96EY1 RAD51D-201ENST00000335858 1353 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
DNAJA3Q96EY1 CCNY-202ENST00000339497 4630 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
DNAJA3Q96EY1 RAP2C-201ENST00000342983 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
DNAJA3Q96EY1 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
DNAJA3Q96EY1 PTHLH-202ENST00000395868 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
DNAJA3Q96EY1 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.5 ms