Protein–RNA interactions for Protein: Q8NDW4

ZNF248, Zinc finger protein 248, humanhuman

Predictions only

Length 579 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF248Q8NDW4 KRTAP5-9-201ENST00000528743 1136 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ZNF248Q8NDW4 MUTYH-237ENST00000531105 501 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ZNF248Q8NDW4 LINC01225-203ENST00000563550 1244 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
ZNF248Q8NDW4 AL596325.1-201ENST00000563991 1082 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
ZNF248Q8NDW4 UBE2E3-205ENST00000602475 602 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ZNF248Q8NDW4 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ZNF248Q8NDW4 ITSN1-209ENST00000399352 5408 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ZNF248Q8NDW4 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ZNF248Q8NDW4 LRRC42-201ENST00000319223 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ZNF248Q8NDW4 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ZNF248Q8NDW4 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ZNF248Q8NDW4 GLG1-201ENST00000205061 8261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ZNF248Q8NDW4 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ZNF248Q8NDW4 KIAA0319L-201ENST00000325722 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ZNF248Q8NDW4 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ZNF248Q8NDW4 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ZNF248Q8NDW4 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ZNF248Q8NDW4 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ZNF248Q8NDW4 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ZNF248Q8NDW4 GUCD1-203ENST00000404664 1606 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ZNF248Q8NDW4 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ZNF248Q8NDW4 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ZNF248Q8NDW4 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
ZNF248Q8NDW4 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ZNF248Q8NDW4 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
ZNF248Q8NDW4 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ZNF248Q8NDW4 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ZNF248Q8NDW4 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
ZNF248Q8NDW4 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ZNF248Q8NDW4 MON2-201ENST00000393629 5612 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ZNF248Q8NDW4 EVC2-202ENST00000344408 4390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ZNF248Q8NDW4 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ZNF248Q8NDW4 GATB-209ENST00000512306 1519 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ZNF248Q8NDW4 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ZNF248Q8NDW4 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ZNF248Q8NDW4 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
ZNF248Q8NDW4 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ZNF248Q8NDW4 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ZNF248Q8NDW4 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ZNF248Q8NDW4 ADCY1-202ENST00000432715 1693 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ZNF248Q8NDW4 NDUFAF3-203ENST00000395458 808 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ZNF248Q8NDW4 ADM2-201ENST00000395737 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ZNF248Q8NDW4 CYB5A-203ENST00000397914 619 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
ZNF248Q8NDW4 PPP6R2P1-201ENST00000450880 1275 ntBASIC16■□□□□ 0.15
ZNF248Q8NDW4 KRT17P7-201ENST00000451704 1104 ntBASIC16■□□□□ 0.15
ZNF248Q8NDW4 RBAKDN-201ENST00000498308 514 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ZNF248Q8NDW4 AC114956.2-201ENST00000512498 572 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
ZNF248Q8NDW4 INS-205ENST00000512523 297 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ZNF248Q8NDW4 CPLX2-206ENST00000512824 518 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
ZNF248Q8NDW4 GATD1-206ENST00000526325 756 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
ZNF248Q8NDW4 AC107918.2-201ENST00000530817 355 ntBASIC16■□□□□ 0.15
ZNF248Q8NDW4 TOMM5-205ENST00000544379 635 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ZNF248Q8NDW4 AL132711.1-201ENST00000557546 722 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
ZNF248Q8NDW4 PMF1-BGLAP-204ENST00000567140 655 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
ZNF248Q8NDW4 DBI-211ENST00000627093 554 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ZNF248Q8NDW4 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ZNF248Q8NDW4 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ZNF248Q8NDW4 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
ZNF248Q8NDW4 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
ZNF248Q8NDW4 SPAG9-205ENST00000505279 4659 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ZNF248Q8NDW4 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ZNF248Q8NDW4 OCIAD1-213ENST00000508293 1423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
ZNF248Q8NDW4 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ZNF248Q8NDW4 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ZNF248Q8NDW4 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ZNF248Q8NDW4 TEX264-202ENST00000395057 1555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ZNF248Q8NDW4 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ZNF248Q8NDW4 FAM174A-201ENST00000312637 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ZNF248Q8NDW4 FRMPD4-201ENST00000380682 8465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ZNF248Q8NDW4 PDE4DIP-201ENST00000313431 5676 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ZNF248Q8NDW4 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ZNF248Q8NDW4 RGPD8-201ENST00000302558 5576 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ZNF248Q8NDW4 VCX2-201ENST00000317103 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ZNF248Q8NDW4 ADIRF-201ENST00000372013 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ZNF248Q8NDW4 TAS2R41-201ENST00000408916 924 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ZNF248Q8NDW4 Z97056.1-201ENST00000433230 556 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ZNF248Q8NDW4 FYCO1-203ENST00000438446 1072 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ZNF248Q8NDW4 TM4SF19-204ENST00000454715 1061 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ZNF248Q8NDW4 ERGIC1-212ENST00000523291 586 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ZNF248Q8NDW4 EEF1D-207ENST00000524624 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ZNF248Q8NDW4 AC008750.1-201ENST00000532473 492 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ZNF248Q8NDW4 AC004233.3-201ENST00000607794 1269 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
ZNF248Q8NDW4 VCX-203ENST00000620630 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ZNF248Q8NDW4 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
ZNF248Q8NDW4 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ZNF248Q8NDW4 WASHC2C-204ENST00000374362 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ZNF248Q8NDW4 POLR2J4-203ENST00000326391 1422 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ZNF248Q8NDW4 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ZNF248Q8NDW4 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ZNF248Q8NDW4 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ZNF248Q8NDW4 RUSC1-209ENST00000471876 1749 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ZNF248Q8NDW4 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ZNF248Q8NDW4 ACP5-212ENST00000592828 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ZNF248Q8NDW4 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ZNF248Q8NDW4 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ZNF248Q8NDW4 RPS6KB1-203ENST00000406116 1982 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ZNF248Q8NDW4 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ZNF248Q8NDW4 XXYLT1-205ENST00000437101 2149 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ZNF248Q8NDW4 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ZNF248Q8NDW4 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.1 ms