Protein–RNA interactions for Protein: Q86TJ5

ZNF554, Zinc finger protein 554, humanhuman

Predictions only

Length 538 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF554Q86TJ5 CNOT8-202ENST00000403027 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ZNF554Q86TJ5 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
ZNF554Q86TJ5 ZMYND12-201ENST00000372565 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
ZNF554Q86TJ5 KCNK4-TEX40-201ENST00000539086 2733 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
ZNF554Q86TJ5 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
ZNF554Q86TJ5 KCNQ4-201ENST00000347132 4099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
ZNF554Q86TJ5 WDR97-201ENST00000323662 6916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
ZNF554Q86TJ5 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
ZNF554Q86TJ5 TSPAN5-201ENST00000305798 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
ZNF554Q86TJ5 DAGLA-201ENST00000257215 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
ZNF554Q86TJ5 HNRNPA0-201ENST00000314940 8726 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.02
ZNF554Q86TJ5 CEP170B-203ENST00000453495 6813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ZNF554Q86TJ5 VSIR-201ENST00000394957 4689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ZNF554Q86TJ5 NFATC4-204ENST00000424781 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ZNF554Q86TJ5 NELFA-202ENST00000382882 3343 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ZNF554Q86TJ5 FSTL3-206ENST00000592947 2144 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ZNF554Q86TJ5 LIN9-201ENST00000328205 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ZNF554Q86TJ5 NBPF9-207ENST00000615421 5835 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ZNF554Q86TJ5 TMEM30B-202ENST00000555868 4471 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ZNF554Q86TJ5 NCOA6-206ENST00000612493 4082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ZNF554Q86TJ5 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
ZNF554Q86TJ5 GAS2L1-209ENST00000618518 3382 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ZNF554Q86TJ5 SOX7-201ENST00000304501 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ZNF554Q86TJ5 SYBU-235ENST00000533895 3244 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ZNF554Q86TJ5 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ZNF554Q86TJ5 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ZNF554Q86TJ5 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ZNF554Q86TJ5 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ZNF554Q86TJ5 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ZNF554Q86TJ5 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
ZNF554Q86TJ5 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
ZNF554Q86TJ5 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ZNF554Q86TJ5 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ZNF554Q86TJ5 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ZNF554Q86TJ5 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ZNF554Q86TJ5 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ZNF554Q86TJ5 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ZNF554Q86TJ5 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
ZNF554Q86TJ5 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
ZNF554Q86TJ5 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ZNF554Q86TJ5 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
ZNF554Q86TJ5 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ZNF554Q86TJ5 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ZNF554Q86TJ5 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ZNF554Q86TJ5 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ZNF554Q86TJ5 GCK-203ENST00000395796 2539 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ZNF554Q86TJ5 OBSL1-202ENST00000373873 3297 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ZNF554Q86TJ5 COQ8A-203ENST00000366779 5523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ZNF554Q86TJ5 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ZNF554Q86TJ5 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ZNF554Q86TJ5 AP000439.3-201ENST00000545202 2376 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ZNF554Q86TJ5 SPOCK3-201ENST00000357154 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ZNF554Q86TJ5 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ZNF554Q86TJ5 CAPN2-201ENST00000295006 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ZNF554Q86TJ5 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ZNF554Q86TJ5 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ZNF554Q86TJ5 MEX3B-201ENST00000329713 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ZNF554Q86TJ5 GCK-202ENST00000345378 2421 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ZNF554Q86TJ5 PBX3-201ENST00000342287 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ZNF554Q86TJ5 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ZNF554Q86TJ5 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ZNF554Q86TJ5 LMAN1-201ENST00000251047 5521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ZNF554Q86TJ5 EID1-201ENST00000530028 2298 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ZNF554Q86TJ5 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ZNF554Q86TJ5 RSPRY1-202ENST00000537866 3586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ZNF554Q86TJ5 FBN2-205ENST00000508989 4987 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ZNF554Q86TJ5 TRIM46-211ENST00000611379 3082 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ZNF554Q86TJ5 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ZNF554Q86TJ5 ANOS1-201ENST00000262648 6314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ZNF554Q86TJ5 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ZNF554Q86TJ5 CAMKK2-209ENST00000446440 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ZNF554Q86TJ5 TMEM189-203ENST00000371656 1973 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ZNF554Q86TJ5 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ZNF554Q86TJ5 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ZNF554Q86TJ5 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ZNF554Q86TJ5 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ZNF554Q86TJ5 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ZNF554Q86TJ5 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ZNF554Q86TJ5 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ZNF554Q86TJ5 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ZNF554Q86TJ5 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ZNF554Q86TJ5 ZBTB32-202ENST00000392197 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ZNF554Q86TJ5 PDPK1-201ENST00000268673 4728 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ZNF554Q86TJ5 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ZNF554Q86TJ5 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ZNF554Q86TJ5 SEMA4F-201ENST00000339773 2177 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ZNF554Q86TJ5 TCP10-210ENST00000617120 2182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ZNF554Q86TJ5 WNT10B-203ENST00000407467 1802 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ZNF554Q86TJ5 PLXNC1-202ENST00000545312 1813 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ZNF554Q86TJ5 NEO1-207ENST00000560262 4315 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ZNF554Q86TJ5 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ZNF554Q86TJ5 SMAP1-202ENST00000370452 2491 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ZNF554Q86TJ5 RALGAPA1-203ENST00000389698 7864 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ZNF554Q86TJ5 ARHGEF7-204ENST00000375736 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ZNF554Q86TJ5 AC244021.1-201ENST00000417218 3662 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ZNF554Q86TJ5 IL17RD-208ENST00000640796 2345 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ZNF554Q86TJ5 THTPA-201ENST00000288014 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ZNF554Q86TJ5 B3GLCT-201ENST00000343307 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ZNF554Q86TJ5 AC004233.2-201ENST00000573315 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ZNF554Q86TJ5 DPYSL4-201ENST00000338492 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.2 ms