Protein–RNA interactions for Protein: Q70EL4

USP43, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 43, humanhuman

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Length 1,123 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP43Q70EL4 AP002490.2-201ENST00000524791 560 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
USP43Q70EL4 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC15.33■□□□□ 0.04
USP43Q70EL4 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC15.33■□□□□ 0.04
USP43Q70EL4 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
USP43Q70EL4 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
USP43Q70EL4 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
USP43Q70EL4 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
USP43Q70EL4 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
USP43Q70EL4 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
USP43Q70EL4 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
USP43Q70EL4 TPD52L2-209ENST00000611972 2197 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
USP43Q70EL4 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
USP43Q70EL4 AC009242.1-201ENST00000634300 2706 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
USP43Q70EL4 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
USP43Q70EL4 FGFBP1-201ENST00000382333 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
USP43Q70EL4 RCAN3-210ENST00000618490 2386 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
USP43Q70EL4 PCBP4-201ENST00000322099 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
USP43Q70EL4 POR-218ENST00000461988 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
USP43Q70EL4 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
USP43Q70EL4 TMPRSS4-201ENST00000437212 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
USP43Q70EL4 LTBP2-201ENST00000261978 8567 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
USP43Q70EL4 SLC44A2-203ENST00000586078 3784 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
USP43Q70EL4 AKR1B15-202ENST00000457545 1621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
USP43Q70EL4 KIAA2026-202ENST00000399933 6988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
USP43Q70EL4 ALDOA-201ENST00000338110 2384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
USP43Q70EL4 IER5-201ENST00000367577 4188 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
USP43Q70EL4 GPSM1-205ENST00000440944 3633 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
USP43Q70EL4 PPP3CB-201ENST00000342558 2418 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
USP43Q70EL4 ENDOV-212ENST00000520284 2500 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
USP43Q70EL4 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
USP43Q70EL4 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
USP43Q70EL4 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
USP43Q70EL4 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
USP43Q70EL4 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
USP43Q70EL4 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC15.32■□□□□ 0.04
USP43Q70EL4 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
USP43Q70EL4 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
USP43Q70EL4 MAP4-202ENST00000360240 5142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
USP43Q70EL4 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
USP43Q70EL4 P3H1-202ENST00000296388 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
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USP43Q70EL4 C12orf65-201ENST00000253233 2073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
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USP43Q70EL4 TACR3-201ENST00000304883 5190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
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USP43Q70EL4 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
USP43Q70EL4 PODN-202ENST00000371500 3287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
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USP43Q70EL4 TRIM24-202ENST00000415680 3799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
USP43Q70EL4 NOMO2-203ENST00000543392 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
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USP43Q70EL4 SALL4-203ENST00000395997 1918 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
USP43Q70EL4 EXT2-210ENST00000533608 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
USP43Q70EL4 AHCY-201ENST00000217426 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
USP43Q70EL4 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
USP43Q70EL4 SLC9A7P1-201ENST00000554295 3311 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
USP43Q70EL4 TSC22D4-201ENST00000300181 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
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USP43Q70EL4 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
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USP43Q70EL4 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
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USP43Q70EL4 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
USP43Q70EL4 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
USP43Q70EL4 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
USP43Q70EL4 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
USP43Q70EL4 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
USP43Q70EL4 ZFAND5-205ENST00000376962 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
USP43Q70EL4 ARL8B-201ENST00000256496 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
USP43Q70EL4 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
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USP43Q70EL4 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
USP43Q70EL4 DNM1-208ENST00000486160 3181 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
USP43Q70EL4 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
USP43Q70EL4 MTHFD1L-203ENST00000367321 3604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
USP43Q70EL4 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
USP43Q70EL4 ELFN1-202ENST00000561626 3742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
USP43Q70EL4 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
USP43Q70EL4 TBRG4-202ENST00000361278 1917 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
USP43Q70EL4 APPL1-201ENST00000288266 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
USP43Q70EL4 HLA-DQB2-231ENST00000435145 2026 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
USP43Q70EL4 KTN1-AS1-202ENST00000412224 2185 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
USP43Q70EL4 SENP6-205ENST00000447266 6501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
USP43Q70EL4 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
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