Protein–RNA interactions for Protein: Q6STE5

SMARCD3, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily D member 3, humanhuman

Predictions only

Length 483 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCD3Q6STE5 ING5-213ENST00000636051 4199 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SMARCD3Q6STE5 ELMSAN1-201ENST00000286523 8091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SMARCD3Q6STE5 NBEAL2-205ENST00000450053 8827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SMARCD3Q6STE5 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SMARCD3Q6STE5 AL139300.1-201ENST00000472726 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SMARCD3Q6STE5 NUTM2F-201ENST00000253262 2561 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
SMARCD3Q6STE5 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
SMARCD3Q6STE5 AFTPH-201ENST00000238855 4113 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
SMARCD3Q6STE5 SDC4-201ENST00000372733 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
SMARCD3Q6STE5 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
SMARCD3Q6STE5 ROBO3-201ENST00000397801 4569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
SMARCD3Q6STE5 ROBO3-220ENST00000538940 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
SMARCD3Q6STE5 CASP2-201ENST00000310447 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
SMARCD3Q6STE5 C4A-243ENST00000428956 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
SMARCD3Q6STE5 C4B-202ENST00000435363 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
SMARCD3Q6STE5 ELF2-207ENST00000510408 1965 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
SMARCD3Q6STE5 KCTD7-206ENST00000639828 5951 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SMARCD3Q6STE5 KLC4-202ENST00000347162 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SMARCD3Q6STE5 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SMARCD3Q6STE5 AC006019.1-201ENST00000425591 2470 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SMARCD3Q6STE5 SNCAIP-202ENST00000261368 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SMARCD3Q6STE5 JRK-209ENST00000612905 9124 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SMARCD3Q6STE5 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SMARCD3Q6STE5 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SMARCD3Q6STE5 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SMARCD3Q6STE5 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SMARCD3Q6STE5 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SMARCD3Q6STE5 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SMARCD3Q6STE5 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SMARCD3Q6STE5 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SMARCD3Q6STE5 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
SMARCD3Q6STE5 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SMARCD3Q6STE5 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SMARCD3Q6STE5 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
SMARCD3Q6STE5 TMED7-TICAM2-201ENST00000282382 3491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SMARCD3Q6STE5 CCNC-209ENST00000520371 2186 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SMARCD3Q6STE5 SLC37A4-217ENST00000545985 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SMARCD3Q6STE5 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SMARCD3Q6STE5 SPIN3-224ENST00000639583 2245 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SMARCD3Q6STE5 PCDH10-201ENST00000264360 8489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SMARCD3Q6STE5 AL121845.3-201ENST00000490623 3119 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SMARCD3Q6STE5 TYSND1-201ENST00000287078 3644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SMARCD3Q6STE5 REPS1-201ENST00000258062 3161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SMARCD3Q6STE5 CDKN2AIP-203ENST00000504169 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SMARCD3Q6STE5 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SMARCD3Q6STE5 SGO1-201ENST00000263753 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SMARCD3Q6STE5 UBR5-207ENST00000520539 10297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SMARCD3Q6STE5 KRT8P49-201ENST00000604166 1432 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
SMARCD3Q6STE5 ADAM8-205ENST00000485491 2441 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SMARCD3Q6STE5 PSME3-202ENST00000441946 2944 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SMARCD3Q6STE5 SYBU-209ENST00000446070 2919 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SMARCD3Q6STE5 CLMAT3-201ENST00000510576 1973 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SMARCD3Q6STE5 ALPPL2-201ENST00000295453 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SMARCD3Q6STE5 FBXO28-201ENST00000366862 5451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SMARCD3Q6STE5 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SMARCD3Q6STE5 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SMARCD3Q6STE5 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SMARCD3Q6STE5 EYA2-201ENST00000317304 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SMARCD3Q6STE5 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SMARCD3Q6STE5 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SMARCD3Q6STE5 AC006538.1-201ENST00000567905 1585 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
SMARCD3Q6STE5 LINC00487-201ENST00000382045 2131 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SMARCD3Q6STE5 SLA2-202ENST00000360672 2171 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SMARCD3Q6STE5 AC022188.1-201ENST00000620960 1664 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
SMARCD3Q6STE5 DCST1-201ENST00000295542 2279 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SMARCD3Q6STE5 TMEM127-201ENST00000258439 6266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SMARCD3Q6STE5 NR4A2-203ENST00000409108 1735 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SMARCD3Q6STE5 RCC2-202ENST00000375436 4087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SMARCD3Q6STE5 TNIP1-202ENST00000389378 2935 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SMARCD3Q6STE5 RAI2-206ENST00000545871 2421 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SMARCD3Q6STE5 CTNND2-214ENST00000511377 4336 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SMARCD3Q6STE5 SMC4-204ENST00000462787 5033 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SMARCD3Q6STE5 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SMARCD3Q6STE5 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SMARCD3Q6STE5 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SMARCD3Q6STE5 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SMARCD3Q6STE5 AL031587.1-201ENST00000410099 1055 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SMARCD3Q6STE5 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
SMARCD3Q6STE5 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SMARCD3Q6STE5 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SMARCD3Q6STE5 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SMARCD3Q6STE5 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SMARCD3Q6STE5 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SMARCD3Q6STE5 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SMARCD3Q6STE5 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SMARCD3Q6STE5 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
SMARCD3Q6STE5 HACE1-201ENST00000262903 4576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SMARCD3Q6STE5 GSAP-201ENST00000257626 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SMARCD3Q6STE5 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SMARCD3Q6STE5 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SMARCD3Q6STE5 GATA3-201ENST00000346208 2654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SMARCD3Q6STE5 LINC02370-201ENST00000428272 2009 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SMARCD3Q6STE5 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SMARCD3Q6STE5 RAD51D-201ENST00000335858 1353 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SMARCD3Q6STE5 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SMARCD3Q6STE5 AC068587.6-202ENST00000641839 5619 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
SMARCD3Q6STE5 MRFAP1-205ENST00000617365 2112 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SMARCD3Q6STE5 SIGLEC7-201ENST00000305628 1469 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SMARCD3Q6STE5 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SMARCD3Q6STE5 NOMO2-203ENST00000543392 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.3 ms