Protein–RNA interactions for Protein: Q6NXT2

H3F3C, Histone H3.3C, humanhuman

Predictions only

Length 135 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H3F3CQ6NXT2 CD37-201ENST00000323906 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
H3F3CQ6NXT2 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
H3F3CQ6NXT2 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
H3F3CQ6NXT2 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
H3F3CQ6NXT2 PNMT-202ENST00000394246 821 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
H3F3CQ6NXT2 MECP2-203ENST00000407218 1174 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
H3F3CQ6NXT2 HHATL-AS1-201ENST00000423165 557 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
H3F3CQ6NXT2 HMGN1P19-201ENST00000436976 333 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
H3F3CQ6NXT2 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
H3F3CQ6NXT2 SLC25A36-204ENST00000453248 1040 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
H3F3CQ6NXT2 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
H3F3CQ6NXT2 CYMP-203ENST00000474680 1263 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
H3F3CQ6NXT2 DAD1-205ENST00000543337 501 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
H3F3CQ6NXT2 UBE2Q2L-201ENST00000558195 498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
H3F3CQ6NXT2 KRT8P23-201ENST00000560090 1207 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
H3F3CQ6NXT2 AC133550.1-201ENST00000563565 295 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
H3F3CQ6NXT2 COQ7-208ENST00000568985 714 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
H3F3CQ6NXT2 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
H3F3CQ6NXT2 IGFLR1-205ENST00000588992 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
H3F3CQ6NXT2 CBY1-211ENST00000619293 1118 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
H3F3CQ6NXT2 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
H3F3CQ6NXT2 CDC42EP4-209ENST00000630622 240 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
H3F3CQ6NXT2 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
H3F3CQ6NXT2 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
H3F3CQ6NXT2 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
H3F3CQ6NXT2 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
H3F3CQ6NXT2 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
H3F3CQ6NXT2 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
H3F3CQ6NXT2 DNAH14-206ENST00000400952 1984 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
H3F3CQ6NXT2 F10-202ENST00000375559 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
H3F3CQ6NXT2 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
H3F3CQ6NXT2 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
H3F3CQ6NXT2 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
H3F3CQ6NXT2 EVPLL-201ENST00000399134 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
H3F3CQ6NXT2 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
H3F3CQ6NXT2 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
H3F3CQ6NXT2 UNC5C-202ENST00000504962 1789 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
H3F3CQ6NXT2 APLNR-203ENST00000611099 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
H3F3CQ6NXT2 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
H3F3CQ6NXT2 CAMKV-204ENST00000466940 1475 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
H3F3CQ6NXT2 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
H3F3CQ6NXT2 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
H3F3CQ6NXT2 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
H3F3CQ6NXT2 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
H3F3CQ6NXT2 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
H3F3CQ6NXT2 MRFAP1-205ENST00000617365 2112 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
H3F3CQ6NXT2 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
H3F3CQ6NXT2 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
H3F3CQ6NXT2 PLPPR4-202ENST00000370185 5369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
H3F3CQ6NXT2 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
H3F3CQ6NXT2 PSMG3-201ENST00000252329 1007 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
H3F3CQ6NXT2 NUPR2-201ENST00000329309 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
H3F3CQ6NXT2 RNASE10-202ENST00000430083 1172 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
H3F3CQ6NXT2 AC005237.2-201ENST00000434368 219 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
H3F3CQ6NXT2 SPCS2P4-201ENST00000436160 681 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
H3F3CQ6NXT2 AL355140.1-201ENST00000457328 398 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
H3F3CQ6NXT2 PXN-AS1-201ENST00000535200 1170 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
H3F3CQ6NXT2 OTUB2-202ENST00000553723 708 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
H3F3CQ6NXT2 AC025678.2-201ENST00000562061 970 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
H3F3CQ6NXT2 KRT16P2-202ENST00000579062 563 ntTSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
H3F3CQ6NXT2 AC013467.2-201ENST00000605472 835 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
H3F3CQ6NXT2 AC247036.6-201ENST00000632950 410 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
H3F3CQ6NXT2 HOXA5-201ENST00000222726 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
H3F3CQ6NXT2 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
H3F3CQ6NXT2 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
H3F3CQ6NXT2 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
H3F3CQ6NXT2 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
H3F3CQ6NXT2 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
H3F3CQ6NXT2 CDH6-205ENST00000514738 2569 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
H3F3CQ6NXT2 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
H3F3CQ6NXT2 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
H3F3CQ6NXT2 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
H3F3CQ6NXT2 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
H3F3CQ6NXT2 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
H3F3CQ6NXT2 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
H3F3CQ6NXT2 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
H3F3CQ6NXT2 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
H3F3CQ6NXT2 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
H3F3CQ6NXT2 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
H3F3CQ6NXT2 LGMN-211ENST00000555699 1728 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
H3F3CQ6NXT2 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
H3F3CQ6NXT2 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
H3F3CQ6NXT2 ATP6V1C2-204ENST00000635370 1578 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
H3F3CQ6NXT2 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
H3F3CQ6NXT2 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
H3F3CQ6NXT2 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
H3F3CQ6NXT2 KDM4F-201ENST00000545950 1917 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
H3F3CQ6NXT2 ORAI2-205ENST00000478730 5531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
H3F3CQ6NXT2 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
H3F3CQ6NXT2 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
H3F3CQ6NXT2 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
H3F3CQ6NXT2 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
H3F3CQ6NXT2 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
H3F3CQ6NXT2 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
H3F3CQ6NXT2 SLC9A3P2-201ENST00000447821 2021 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
H3F3CQ6NXT2 RPS5-202ENST00000596046 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
H3F3CQ6NXT2 AL139398.1-201ENST00000638795 1529 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
H3F3CQ6NXT2 ANAPC11-201ENST00000344877 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
H3F3CQ6NXT2 RPL36-201ENST00000347512 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
H3F3CQ6NXT2 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.1 ms