Protein–RNA interactions for Protein: Q6NUP7

PPP4R4, Serine/threonine-protein phosphatase 4 regulatory subunit 4, humanhuman

Predictions only

Length 873 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPP4R4Q6NUP7 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PPP4R4Q6NUP7 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PPP4R4Q6NUP7 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
PPP4R4Q6NUP7 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PPP4R4Q6NUP7 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
PPP4R4Q6NUP7 PRDM8-201ENST00000339711 4095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PPP4R4Q6NUP7 LRIT1-201ENST00000372105 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PPP4R4Q6NUP7 FAM160B1-202ENST00000369248 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PPP4R4Q6NUP7 PITPNA-201ENST00000313486 3912 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PPP4R4Q6NUP7 MBOAT2-201ENST00000305997 7751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PPP4R4Q6NUP7 ZBTB17-216ENST00000537142 2511 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PPP4R4Q6NUP7 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PPP4R4Q6NUP7 RGS3-210ENST00000462143 2759 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PPP4R4Q6NUP7 MTHFR-217ENST00000641820 1569 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
PPP4R4Q6NUP7 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PPP4R4Q6NUP7 MITF-204ENST00000352241 4814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PPP4R4Q6NUP7 SLC29A1-206ENST00000371755 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PPP4R4Q6NUP7 DIXDC1-201ENST00000440460 5897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PPP4R4Q6NUP7 AC010478.1-202ENST00000559112 2367 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PPP4R4Q6NUP7 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PPP4R4Q6NUP7 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
PPP4R4Q6NUP7 C2orf81-206ENST00000640868 2407 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PPP4R4Q6NUP7 CYP46A1-201ENST00000261835 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PPP4R4Q6NUP7 MAGEA2-207ENST00000620710 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PPP4R4Q6NUP7 CANT1-211ENST00000591773 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PPP4R4Q6NUP7 OTULIN-201ENST00000284274 7800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PPP4R4Q6NUP7 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PPP4R4Q6NUP7 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PPP4R4Q6NUP7 DOLK-201ENST00000372586 2090 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PPP4R4Q6NUP7 IL12RB2-201ENST00000262345 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PPP4R4Q6NUP7 LHX5-201ENST00000261731 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PPP4R4Q6NUP7 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PPP4R4Q6NUP7 NPY4R-202ENST00000612632 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PPP4R4Q6NUP7 NPY4R2-202ENST00000613306 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PPP4R4Q6NUP7 TRIM46-203ENST00000368383 2666 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PPP4R4Q6NUP7 RELT-201ENST00000064780 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PPP4R4Q6NUP7 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PPP4R4Q6NUP7 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PPP4R4Q6NUP7 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PPP4R4Q6NUP7 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PPP4R4Q6NUP7 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PPP4R4Q6NUP7 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
PPP4R4Q6NUP7 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PPP4R4Q6NUP7 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PPP4R4Q6NUP7 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PPP4R4Q6NUP7 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PPP4R4Q6NUP7 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PPP4R4Q6NUP7 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PPP4R4Q6NUP7 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PPP4R4Q6NUP7 ZFAND6-211ENST00000559157 1559 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PPP4R4Q6NUP7 SCARB1-202ENST00000339570 3329 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PPP4R4Q6NUP7 CTDSP2-201ENST00000398073 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PPP4R4Q6NUP7 PSMG3-AS1-201ENST00000437621 5701 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PPP4R4Q6NUP7 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PPP4R4Q6NUP7 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PPP4R4Q6NUP7 TRIM67-202ENST00000444294 9320 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PPP4R4Q6NUP7 NAF1-201ENST00000274054 1907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PPP4R4Q6NUP7 HPCAL1-207ENST00000620771 1941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PPP4R4Q6NUP7 SLIT1-201ENST00000266058 7925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PPP4R4Q6NUP7 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PPP4R4Q6NUP7 PSME3-202ENST00000441946 2944 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PPP4R4Q6NUP7 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PPP4R4Q6NUP7 ZNF382-202ENST00000423582 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PPP4R4Q6NUP7 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PPP4R4Q6NUP7 TFPI2-201ENST00000222543 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PPP4R4Q6NUP7 KRT2-201ENST00000309680 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PPP4R4Q6NUP7 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PPP4R4Q6NUP7 CELF4-202ENST00000361795 1853 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PPP4R4Q6NUP7 AC126177.1-201ENST00000547829 2218 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
PPP4R4Q6NUP7 UIMC1-201ENST00000377227 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PPP4R4Q6NUP7 TOPAZ1-201ENST00000309765 5334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PPP4R4Q6NUP7 SCAF1-201ENST00000360565 4306 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PPP4R4Q6NUP7 GLUL-201ENST00000311223 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PPP4R4Q6NUP7 AL136309.2-201ENST00000427049 2277 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PPP4R4Q6NUP7 ITPKB-201ENST00000272117 5822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PPP4R4Q6NUP7 JRK-203ENST00000571961 2687 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PPP4R4Q6NUP7 SF3A2-201ENST00000221494 1963 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PPP4R4Q6NUP7 ABTB1-202ENST00000453791 1961 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PPP4R4Q6NUP7 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PPP4R4Q6NUP7 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PPP4R4Q6NUP7 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PPP4R4Q6NUP7 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PPP4R4Q6NUP7 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PPP4R4Q6NUP7 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PPP4R4Q6NUP7 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PPP4R4Q6NUP7 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
PPP4R4Q6NUP7 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
PPP4R4Q6NUP7 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PPP4R4Q6NUP7 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PPP4R4Q6NUP7 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PPP4R4Q6NUP7 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PPP4R4Q6NUP7 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PPP4R4Q6NUP7 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PPP4R4Q6NUP7 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PPP4R4Q6NUP7 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PPP4R4Q6NUP7 EPS8L2-201ENST00000318562 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PPP4R4Q6NUP7 MICALL1-201ENST00000215957 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PPP4R4Q6NUP7 OTX1-201ENST00000282549 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PPP4R4Q6NUP7 OTX1-202ENST00000366671 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PPP4R4Q6NUP7 CSAD-208ENST00000444623 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.6 ms