Protein–RNA interactions for Protein: Q6IPU0

CENPP, Centromere protein P, humanhuman

Predictions only

Length 288 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPPQ6IPU0 SPCS2-202ENST00000526361 772 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CENPPQ6IPU0 ACY1-212ENST00000635797 1294 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CENPPQ6IPU0 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CENPPQ6IPU0 DIMT1-201ENST00000199320 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CENPPQ6IPU0 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CENPPQ6IPU0 PCDHGA11-202ENST00000518882 2263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CENPPQ6IPU0 XRCC3-209ENST00000554913 2539 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CENPPQ6IPU0 SRGAP2B-207ENST00000641863 2367 ntAPPRIS P5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CENPPQ6IPU0 SRSF2-205ENST00000508921 1390 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CENPPQ6IPU0 AC073957.2-201ENST00000549241 1562 ntTSL 4 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CENPPQ6IPU0 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CENPPQ6IPU0 MTHFR-217ENST00000641820 1569 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
CENPPQ6IPU0 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CENPPQ6IPU0 JADE2-202ENST00000361895 3212 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CENPPQ6IPU0 DUSP18-206ENST00000407308 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CENPPQ6IPU0 RPLP2-201ENST00000321153 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CENPPQ6IPU0 TMEM44-201ENST00000330115 1278 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CENPPQ6IPU0 IGKV4-1-201ENST00000390243 538 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CENPPQ6IPU0 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CENPPQ6IPU0 C1orf226-202ENST00000426197 1049 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CENPPQ6IPU0 CRCP-205ENST00000431089 942 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CENPPQ6IPU0 AC007967.2-201ENST00000432613 625 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
CENPPQ6IPU0 HS6ST1P1-201ENST00000481504 1234 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
CENPPQ6IPU0 MRPL52-208ENST00000553711 586 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CENPPQ6IPU0 DCTPP1-203ENST00000567983 801 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CENPPQ6IPU0 SNHG15-206ENST00000580528 1073 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CENPPQ6IPU0 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CENPPQ6IPU0 AL121832.1-201ENST00000615180 677 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CENPPQ6IPU0 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CENPPQ6IPU0 LINC01666-201ENST00000623794 845 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CENPPQ6IPU0 MEIS3-206ENST00000559524 1828 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CENPPQ6IPU0 GPR108-202ENST00000430424 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CENPPQ6IPU0 SYBU-230ENST00000532779 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CENPPQ6IPU0 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CENPPQ6IPU0 ATP5S-201ENST00000245448 1671 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CENPPQ6IPU0 PRR15-201ENST00000319694 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CENPPQ6IPU0 EVA1C-202ENST00000382699 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CENPPQ6IPU0 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CENPPQ6IPU0 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CENPPQ6IPU0 BTN1A1-202ENST00000613186 2266 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CENPPQ6IPU0 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CENPPQ6IPU0 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CENPPQ6IPU0 FUT5-201ENST00000252675 1916 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CENPPQ6IPU0 GPS1-202ENST00000320548 1949 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CENPPQ6IPU0 CCDC90B-203ENST00000525503 1919 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CENPPQ6IPU0 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CENPPQ6IPU0 HYAL1-202ENST00000320295 2324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CENPPQ6IPU0 EDN3-205ENST00000395654 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CENPPQ6IPU0 AC105760.2-201ENST00000418430 2341 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CENPPQ6IPU0 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CENPPQ6IPU0 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CENPPQ6IPU0 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CENPPQ6IPU0 SH2B1-203ENST00000359285 3033 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CENPPQ6IPU0 SLC17A7-204ENST00000600601 2237 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CENPPQ6IPU0 IRAK1-204ENST00000393687 2049 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CENPPQ6IPU0 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CENPPQ6IPU0 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CENPPQ6IPU0 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CENPPQ6IPU0 AP001189.5-201ENST00000637683 1413 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CENPPQ6IPU0 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CENPPQ6IPU0 PDE4DIP-230ENST00000530472 1690 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CENPPQ6IPU0 STX10-201ENST00000242770 1099 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CENPPQ6IPU0 LCE1B-201ENST00000360090 1139 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CENPPQ6IPU0 SERINC2-202ENST00000373710 2146 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CENPPQ6IPU0 GRM5-203ENST00000393294 1268 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CENPPQ6IPU0 PLA2G12A-202ENST00000502283 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CENPPQ6IPU0 MRPL49-203ENST00000526171 501 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CENPPQ6IPU0 TPD52L1-211ENST00000532429 1022 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CENPPQ6IPU0 AP000442.1-201ENST00000533552 769 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CENPPQ6IPU0 AP005019.1-201ENST00000545254 664 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CENPPQ6IPU0 L2HGDH-206ENST00000555610 804 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CENPPQ6IPU0 AC087641.1-201ENST00000557561 1021 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
CENPPQ6IPU0 IFT20-215ENST00000585313 852 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CENPPQ6IPU0 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CENPPQ6IPU0 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CENPPQ6IPU0 COQ6-220ENST00000629426 1538 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CENPPQ6IPU0 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CENPPQ6IPU0 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CENPPQ6IPU0 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CENPPQ6IPU0 RBM4-204ENST00000408993 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CENPPQ6IPU0 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CENPPQ6IPU0 C21orf58-201ENST00000291691 2975 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CENPPQ6IPU0 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CENPPQ6IPU0 HNRNPF-204ENST00000443950 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CENPPQ6IPU0 AC104809.1-201ENST00000425110 2345 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CENPPQ6IPU0 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CENPPQ6IPU0 ARMC6-203ENST00000392336 1866 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CENPPQ6IPU0 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CENPPQ6IPU0 ZNF805-201ENST00000354309 2396 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CENPPQ6IPU0 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CENPPQ6IPU0 RUSC1-201ENST00000292254 2163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CENPPQ6IPU0 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CENPPQ6IPU0 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CENPPQ6IPU0 AP2A2-222ENST00000534328 1491 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CENPPQ6IPU0 PRKAG1-217ENST00000552212 1497 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CENPPQ6IPU0 GUCA1A-203ENST00000394237 2233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CENPPQ6IPU0 PIAS3-201ENST00000369298 2761 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CENPPQ6IPU0 IQCC-202ENST00000537469 2252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CENPPQ6IPU0 CTSB-201ENST00000345125 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CENPPQ6IPU0 SPATC1-201ENST00000377470 2007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.4 ms