Protein–RNA interactions for Protein: Q5W0B7

TMEM236, Transmembrane protein 236, humanhuman

Predictions only

Length 351 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM236Q5W0B7 CALCR-207ENST00000426151 1741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TMEM236Q5W0B7 PC-204ENST00000524491 1714 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TMEM236Q5W0B7 TSPAN5-201ENST00000305798 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TMEM236Q5W0B7 ARHGEF1-219ENST00000599846 3393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TMEM236Q5W0B7 CAAP1-201ENST00000333916 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TMEM236Q5W0B7 ZFYVE19-203ENST00000355341 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TMEM236Q5W0B7 PCM1-206ENST00000518537 2171 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TMEM236Q5W0B7 P2RX5-TAX1BP3-201ENST00000550383 5905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TMEM236Q5W0B7 PTPN11-201ENST00000351677 6101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TMEM236Q5W0B7 SLC34A1-204ENST00000512593 1912 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TMEM236Q5W0B7 GALE-216ENST00000617979 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TMEM236Q5W0B7 CIAPIN1-209ENST00000567518 2016 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TMEM236Q5W0B7 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TMEM236Q5W0B7 SYNGAP1-202ENST00000418600 5828 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TMEM236Q5W0B7 GRAMD4-203ENST00000408031 2834 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TMEM236Q5W0B7 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TMEM236Q5W0B7 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TMEM236Q5W0B7 ACE-204ENST00000428043 5120 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TMEM236Q5W0B7 SERTAD4-201ENST00000367012 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TMEM236Q5W0B7 PDXK-202ENST00000327574 2583 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TMEM236Q5W0B7 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TMEM236Q5W0B7 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TMEM236Q5W0B7 ZNF563-201ENST00000293725 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TMEM236Q5W0B7 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TMEM236Q5W0B7 RGPD8-201ENST00000302558 5576 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TMEM236Q5W0B7 C12orf65-201ENST00000253233 2073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TMEM236Q5W0B7 MCF2L2-201ENST00000328913 4980 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TMEM236Q5W0B7 OAZ2-207ENST00000560258 1744 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TMEM236Q5W0B7 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TMEM236Q5W0B7 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TMEM236Q5W0B7 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
TMEM236Q5W0B7 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
TMEM236Q5W0B7 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TMEM236Q5W0B7 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TMEM236Q5W0B7 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TMEM236Q5W0B7 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
TMEM236Q5W0B7 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TMEM236Q5W0B7 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
TMEM236Q5W0B7 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TMEM236Q5W0B7 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
TMEM236Q5W0B7 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
TMEM236Q5W0B7 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TMEM236Q5W0B7 XK-201ENST00000378616 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TMEM236Q5W0B7 PPM1J-202ENST00000464951 2474 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TMEM236Q5W0B7 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TMEM236Q5W0B7 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TMEM236Q5W0B7 SIGLEC10-205ENST00000439889 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TMEM236Q5W0B7 ACHE-202ENST00000302913 2956 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TMEM236Q5W0B7 ARL8B-208ENST00000611208 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TMEM236Q5W0B7 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TMEM236Q5W0B7 SMAP1-201ENST00000316999 2403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TMEM236Q5W0B7 AXIN2-202ENST00000375702 2541 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TMEM236Q5W0B7 TLDC2-201ENST00000217320 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TMEM236Q5W0B7 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMEM236Q5W0B7 RSPO1-203ENST00000612451 2463 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMEM236Q5W0B7 MYEF2-201ENST00000267836 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMEM236Q5W0B7 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMEM236Q5W0B7 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMEM236Q5W0B7 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMEM236Q5W0B7 LTK-204ENST00000561619 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMEM236Q5W0B7 NAF1-201ENST00000274054 1907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMEM236Q5W0B7 RBBP8-201ENST00000327155 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMEM236Q5W0B7 CYP2U1-201ENST00000332884 4944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMEM236Q5W0B7 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMEM236Q5W0B7 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMEM236Q5W0B7 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMEM236Q5W0B7 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
TMEM236Q5W0B7 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMEM236Q5W0B7 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMEM236Q5W0B7 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMEM236Q5W0B7 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMEM236Q5W0B7 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMEM236Q5W0B7 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMEM236Q5W0B7 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
TMEM236Q5W0B7 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
TMEM236Q5W0B7 MOB3B-201ENST00000262244 6454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMEM236Q5W0B7 ZXDA-201ENST00000358697 4113 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMEM236Q5W0B7 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMEM236Q5W0B7 PRKAG1-217ENST00000552212 1497 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMEM236Q5W0B7 PKDREJ-201ENST00000253255 7693 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMEM236Q5W0B7 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMEM236Q5W0B7 MTHFR-217ENST00000641820 1569 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
TMEM236Q5W0B7 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMEM236Q5W0B7 KCTD14-201ENST00000353172 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMEM236Q5W0B7 CANT1-211ENST00000591773 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMEM236Q5W0B7 KANK1-204ENST00000382293 5249 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMEM236Q5W0B7 CTD-3080P12.3-203ENST00000514376 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMEM236Q5W0B7 PHGDH-202ENST00000369409 1882 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMEM236Q5W0B7 SCP2-213ENST00000528311 1896 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMEM236Q5W0B7 SLC29A2-207ENST00000619145 2380 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMEM236Q5W0B7 CDCA5-201ENST00000275517 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMEM236Q5W0B7 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMEM236Q5W0B7 AC096667.1-201ENST00000640078 3465 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMEM236Q5W0B7 TMEM184A-201ENST00000297477 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMEM236Q5W0B7 UROC1-202ENST00000383579 2735 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMEM236Q5W0B7 SLC5A7-202ENST00000409059 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMEM236Q5W0B7 FUT3-202ENST00000458379 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMEM236Q5W0B7 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMEM236Q5W0B7 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMEM236Q5W0B7 ATG4B-205ENST00000404914 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.1 ms