Protein–RNA interactions for Protein: Q5VT98

PRAMEF20, PRAME family member 20, humanhuman

Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAMEF20Q5VT98 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PRAMEF20Q5VT98 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PRAMEF20Q5VT98 KDM4F-201ENST00000545950 1917 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PRAMEF20Q5VT98 YPEL3-203ENST00000562641 1941 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PRAMEF20Q5VT98 PRX-202ENST00000324001 4855 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PRAMEF20Q5VT98 TTLL5-219ENST00000556977 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PRAMEF20Q5VT98 PTCH1-201ENST00000331920 8057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PRAMEF20Q5VT98 WLS-202ENST00000354777 2037 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PRAMEF20Q5VT98 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PRAMEF20Q5VT98 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PRAMEF20Q5VT98 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PRAMEF20Q5VT98 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PRAMEF20Q5VT98 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PRAMEF20Q5VT98 CRYBA2-201ENST00000295728 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PRAMEF20Q5VT98 NRN1L-201ENST00000339176 710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PRAMEF20Q5VT98 MRPL9-202ENST00000368830 1296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PRAMEF20Q5VT98 CNN2P11-201ENST00000429351 262 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
PRAMEF20Q5VT98 AL671277.1-201ENST00000429656 993 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
PRAMEF20Q5VT98 SPDYE2-202ENST00000432940 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PRAMEF20Q5VT98 SPDYE2B-201ENST00000436228 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PRAMEF20Q5VT98 TTC31-205ENST00000442235 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PRAMEF20Q5VT98 LINC00899-202ENST00000444890 493 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PRAMEF20Q5VT98 LINC01640-201ENST00000452505 550 ntTSL 4 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PRAMEF20Q5VT98 TM4SF19-204ENST00000454715 1061 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PRAMEF20Q5VT98 SPDYE5-201ENST00000455862 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PRAMEF20Q5VT98 OR10S1-201ENST00000531945 1121 ntAPPRIS P2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PRAMEF20Q5VT98 AC069503.2-201ENST00000546333 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PRAMEF20Q5VT98 CEMP1-201ENST00000565480 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PRAMEF20Q5VT98 OR10S1-202ENST00000641123 1121 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PRAMEF20Q5VT98 NTNG1-203ENST00000370066 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PRAMEF20Q5VT98 EYA2-201ENST00000317304 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PRAMEF20Q5VT98 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PRAMEF20Q5VT98 THTPA-203ENST00000554789 1595 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PRAMEF20Q5VT98 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PRAMEF20Q5VT98 ITGB1BP1-204ENST00000360635 4859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PRAMEF20Q5VT98 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PRAMEF20Q5VT98 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PRAMEF20Q5VT98 TSC2-204ENST00000401874 5421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PRAMEF20Q5VT98 AL391256.1-201ENST00000443260 1855 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
PRAMEF20Q5VT98 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PRAMEF20Q5VT98 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PRAMEF20Q5VT98 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PRAMEF20Q5VT98 AL645728.1-201ENST00000366221 2101 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
PRAMEF20Q5VT98 ARID5A-201ENST00000357485 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PRAMEF20Q5VT98 MAPT-201ENST00000262410 6762 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PRAMEF20Q5VT98 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PRAMEF20Q5VT98 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PRAMEF20Q5VT98 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PRAMEF20Q5VT98 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PRAMEF20Q5VT98 TULP2-201ENST00000221399 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PRAMEF20Q5VT98 PIEZO1-201ENST00000301015 8072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PRAMEF20Q5VT98 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PRAMEF20Q5VT98 TMEM205-201ENST00000354882 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PRAMEF20Q5VT98 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PRAMEF20Q5VT98 CORO6-202ENST00000388767 2397 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PRAMEF20Q5VT98 ADGRB2-206ENST00000398556 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PRAMEF20Q5VT98 AC254562.1-201ENST00000417586 456 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
PRAMEF20Q5VT98 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PRAMEF20Q5VT98 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PRAMEF20Q5VT98 MAGI2-AS3-208ENST00000446159 670 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PRAMEF20Q5VT98 MCF2L-AS1-201ENST00000446789 712 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PRAMEF20Q5VT98 LIFR-202ENST00000453190 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PRAMEF20Q5VT98 AC092183.1-201ENST00000469884 875 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
PRAMEF20Q5VT98 ALDH3A1-212ENST00000494157 1572 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PRAMEF20Q5VT98 FAM118B-206ENST00000529731 1028 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PRAMEF20Q5VT98 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PRAMEF20Q5VT98 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PRAMEF20Q5VT98 PXN-AS1-202ENST00000538804 508 ntTSL 4 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PRAMEF20Q5VT98 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PRAMEF20Q5VT98 TMEM205-205ENST00000586590 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PRAMEF20Q5VT98 TMEM205-207ENST00000586956 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PRAMEF20Q5VT98 GPR42-202ENST00000597214 1182 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PRAMEF20Q5VT98 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PRAMEF20Q5VT98 AC010503.2-201ENST00000599292 296 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PRAMEF20Q5VT98 SIGLEC7-205ENST00000600577 616 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PRAMEF20Q5VT98 TBX18-206ENST00000606784 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PRAMEF20Q5VT98 CR392000.2-201ENST00000640235 1994 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PRAMEF20Q5VT98 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PRAMEF20Q5VT98 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PRAMEF20Q5VT98 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PRAMEF20Q5VT98 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PRAMEF20Q5VT98 ZNRF3-201ENST00000402174 2667 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PRAMEF20Q5VT98 ZNF496-201ENST00000294753 5336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PRAMEF20Q5VT98 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PRAMEF20Q5VT98 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PRAMEF20Q5VT98 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PRAMEF20Q5VT98 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
PRAMEF20Q5VT98 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PRAMEF20Q5VT98 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PRAMEF20Q5VT98 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PRAMEF20Q5VT98 VIPR2-201ENST00000262178 3944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PRAMEF20Q5VT98 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PRAMEF20Q5VT98 PC-204ENST00000524491 1714 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PRAMEF20Q5VT98 TMEM86B-201ENST00000327042 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PRAMEF20Q5VT98 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PRAMEF20Q5VT98 SMIM10-201ENST00000330288 1536 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PRAMEF20Q5VT98 MFSD2B-202ENST00000406420 1528 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PRAMEF20Q5VT98 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PRAMEF20Q5VT98 SPSB2-203ENST00000519357 1496 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PRAMEF20Q5VT98 SH2B1-206ENST00000545570 1488 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.5 ms