Protein–RNA interactions for Protein: Q5J8X5

MS4A13, Membrane-spanning 4-domains subfamily A member 13, humanhuman

Predictions only

Length 152 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MS4A13Q5J8X5 C19orf33-202ENST00000588605 520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
MS4A13Q5J8X5 LINC00623-204ENST00000617702 746 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
MS4A13Q5J8X5 RAB9A-203ENST00000618931 737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
MS4A13Q5J8X5 PDCD6-214ENST00000628729 1073 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
MS4A13Q5J8X5 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
MS4A13Q5J8X5 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
MS4A13Q5J8X5 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
MS4A13Q5J8X5 PDXP-202ENST00000403251 1571 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
MS4A13Q5J8X5 FAM60A-203ENST00000454658 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
MS4A13Q5J8X5 ELP5-201ENST00000354429 1304 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
MS4A13Q5J8X5 OPCML-202ENST00000374778 1302 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
MS4A13Q5J8X5 TMEM225B-202ENST00000431679 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
MS4A13Q5J8X5 PRRG3-205ENST00000538575 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
MS4A13Q5J8X5 BEND4-203ENST00000611697 1348 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
MS4A13Q5J8X5 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
MS4A13Q5J8X5 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
MS4A13Q5J8X5 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
MS4A13Q5J8X5 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
MS4A13Q5J8X5 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
MS4A13Q5J8X5 AL031731.1-201ENST00000642131 2094 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
MS4A13Q5J8X5 MAP4K1-203ENST00000586296 1363 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
MS4A13Q5J8X5 C12orf40-202ENST00000405531 1656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
MS4A13Q5J8X5 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
MS4A13Q5J8X5 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
MS4A13Q5J8X5 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
MS4A13Q5J8X5 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
MS4A13Q5J8X5 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
MS4A13Q5J8X5 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
MS4A13Q5J8X5 PHF19-201ENST00000312189 836 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
MS4A13Q5J8X5 FCN1-201ENST00000371806 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
MS4A13Q5J8X5 PRUNE2-202ENST00000376713 1069 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
MS4A13Q5J8X5 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
MS4A13Q5J8X5 CRLF2-202ENST00000381567 1013 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
MS4A13Q5J8X5 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
MS4A13Q5J8X5 MEIS1-AS2-201ENST00000439433 690 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
MS4A13Q5J8X5 AC018730.1-201ENST00000454183 327 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
MS4A13Q5J8X5 CCDC90B-202ENST00000455220 1550 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
MS4A13Q5J8X5 AC079140.1-201ENST00000508039 487 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
MS4A13Q5J8X5 STT3A-AS1-201ENST00000530526 429 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
MS4A13Q5J8X5 PIGT-207ENST00000543458 2037 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
MS4A13Q5J8X5 COX14-202ENST00000548985 677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
MS4A13Q5J8X5 FAM227B-204ENST00000558594 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
MS4A13Q5J8X5 AC133550.1-201ENST00000563565 295 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
MS4A13Q5J8X5 METTL23-203ENST00000586738 1059 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
MS4A13Q5J8X5 METTL23-205ENST00000588302 925 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
MS4A13Q5J8X5 AC004835.2-201ENST00000603762 682 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
MS4A13Q5J8X5 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
MS4A13Q5J8X5 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
MS4A13Q5J8X5 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
MS4A13Q5J8X5 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
MS4A13Q5J8X5 LINC02138-201ENST00000378340 1326 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
MS4A13Q5J8X5 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
MS4A13Q5J8X5 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
MS4A13Q5J8X5 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
MS4A13Q5J8X5 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
MS4A13Q5J8X5 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
MS4A13Q5J8X5 NPY4R-202ENST00000612632 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
MS4A13Q5J8X5 NPY4R2-202ENST00000613306 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
MS4A13Q5J8X5 ABLIM2-202ENST00000361581 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
MS4A13Q5J8X5 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
MS4A13Q5J8X5 MARVELD3-204ENST00000565261 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
MS4A13Q5J8X5 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
MS4A13Q5J8X5 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
MS4A13Q5J8X5 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
MS4A13Q5J8X5 MEG3-206ENST00000423456 1771 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
MS4A13Q5J8X5 NUPR2-201ENST00000329309 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
MS4A13Q5J8X5 TNNC2-202ENST00000372557 780 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
MS4A13Q5J8X5 ALKBH6-202ENST00000378875 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
MS4A13Q5J8X5 PRORY-201ENST00000382764 878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
MS4A13Q5J8X5 CXCL1-201ENST00000395761 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
MS4A13Q5J8X5 AL022341.1-201ENST00000455294 389 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
MS4A13Q5J8X5 SPINK2-203ENST00000506738 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
MS4A13Q5J8X5 PP7080-203ENST00000510604 859 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
MS4A13Q5J8X5 FAM118B-206ENST00000529731 1028 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
MS4A13Q5J8X5 AP000275.2-202ENST00000553001 929 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
MS4A13Q5J8X5 AC005330.1-201ENST00000590086 1238 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
MS4A13Q5J8X5 AC247036.6-201ENST00000632950 410 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
MS4A13Q5J8X5 GLMP-201ENST00000362007 1604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
MS4A13Q5J8X5 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
MS4A13Q5J8X5 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
MS4A13Q5J8X5 SDR16C5-201ENST00000303749 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
MS4A13Q5J8X5 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
MS4A13Q5J8X5 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
MS4A13Q5J8X5 TTC8-216ENST00000614125 2377 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
MS4A13Q5J8X5 NSL1-203ENST00000366978 1344 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
MS4A13Q5J8X5 TRIP6-209ENST00000619988 1303 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
MS4A13Q5J8X5 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
MS4A13Q5J8X5 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
MS4A13Q5J8X5 F10-202ENST00000375559 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
MS4A13Q5J8X5 HLA-B-249ENST00000412585 1547 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
MS4A13Q5J8X5 AL139398.1-201ENST00000638795 1529 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
MS4A13Q5J8X5 GABARAPL1-205ENST00000539170 1700 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
MS4A13Q5J8X5 GGT4P-201ENST00000623672 1708 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
MS4A13Q5J8X5 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
MS4A13Q5J8X5 PEA15-202ENST00000368076 2694 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
MS4A13Q5J8X5 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
MS4A13Q5J8X5 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
MS4A13Q5J8X5 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
MS4A13Q5J8X5 ADGRG3-202ENST00000450388 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
MS4A13Q5J8X5 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.4 ms