Protein–RNA interactions for Protein: Q53S08

RAB6C, Rab6C, humanhuman

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB6CQ53S08 CALCR-207ENST00000426151 1741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RAB6CQ53S08 TPD52L2-209ENST00000611972 2197 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
RAB6CQ53S08 AC074117.1-201ENST00000447070 3060 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
RAB6CQ53S08 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
RAB6CQ53S08 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
RAB6CQ53S08 TBRG4-203ENST00000395655 2225 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
RAB6CQ53S08 ASAP3-212ENST00000618240 2226 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
RAB6CQ53S08 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RAB6CQ53S08 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RAB6CQ53S08 UBAC2-203ENST00000403766 1375 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
RAB6CQ53S08 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
RAB6CQ53S08 AL162311.3-201ENST00000555918 2867 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
RAB6CQ53S08 SH2B1-206ENST00000545570 1488 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
RAB6CQ53S08 CTSD-213ENST00000637915 1982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
RAB6CQ53S08 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RAB6CQ53S08 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
RAB6CQ53S08 DCST1-201ENST00000295542 2279 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
RAB6CQ53S08 MIER1-205ENST00000371014 1728 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
RAB6CQ53S08 SLC27A5-201ENST00000263093 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RAB6CQ53S08 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RAB6CQ53S08 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
RAB6CQ53S08 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
RAB6CQ53S08 NPM2-203ENST00000397940 1874 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
RAB6CQ53S08 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RAB6CQ53S08 EPHA10-203ENST00000427468 3167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
RAB6CQ53S08 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RAB6CQ53S08 NRN1L-201ENST00000339176 710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RAB6CQ53S08 ANAPC11-201ENST00000344877 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RAB6CQ53S08 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RAB6CQ53S08 SH3TC1-202ENST00000382521 829 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RAB6CQ53S08 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RAB6CQ53S08 C6orf226-201ENST00000408925 552 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
RAB6CQ53S08 C21orf33-205ENST00000427803 1077 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
RAB6CQ53S08 AC131097.3-202ENST00000439270 331 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
RAB6CQ53S08 MTRF1LP2-201ENST00000506027 1122 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
RAB6CQ53S08 REEP2-206ENST00000506158 1021 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
RAB6CQ53S08 RNA5SP416-201ENST00000516838 111 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
RAB6CQ53S08 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC17.36■□□□□ 0.37
RAB6CQ53S08 ANAPC11-213ENST00000577747 672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
RAB6CQ53S08 CD7-202ENST00000578509 925 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
RAB6CQ53S08 SNHG15-206ENST00000580528 1073 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
RAB6CQ53S08 ZEB1-AS1-206ENST00000606250 573 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
RAB6CQ53S08 AL031055.1-201ENST00000606362 631 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
RAB6CQ53S08 ITPRIPL1-205ENST00000536814 1947 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
RAB6CQ53S08 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RAB6CQ53S08 TUBA4B-203ENST00000490341 1380 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
RAB6CQ53S08 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RAB6CQ53S08 BCL2L12-202ENST00000246785 1431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RAB6CQ53S08 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RAB6CQ53S08 GPR158-AS1-201ENST00000449643 2433 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
RAB6CQ53S08 VEPH1-218ENST00000494677 1714 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RAB6CQ53S08 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RAB6CQ53S08 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RAB6CQ53S08 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RAB6CQ53S08 KDM4F-201ENST00000545950 1917 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
RAB6CQ53S08 ME2P1-201ENST00000426028 1970 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
RAB6CQ53S08 CTCFL-215ENST00000608158 1984 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RAB6CQ53S08 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RAB6CQ53S08 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
RAB6CQ53S08 DDOST-202ENST00000415136 2126 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RAB6CQ53S08 GUCA1A-203ENST00000394237 2233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
RAB6CQ53S08 ARHGAP27-208ENST00000528384 2296 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RAB6CQ53S08 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
RAB6CQ53S08 UNC5D-203ENST00000416672 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
RAB6CQ53S08 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
RAB6CQ53S08 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RAB6CQ53S08 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
RAB6CQ53S08 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RAB6CQ53S08 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RAB6CQ53S08 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
RAB6CQ53S08 AC064807.1-202ENST00000423716 936 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
RAB6CQ53S08 LINC02123-201ENST00000514869 885 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RAB6CQ53S08 SPCS2-202ENST00000526361 772 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
RAB6CQ53S08 CD63-210ENST00000550776 870 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
RAB6CQ53S08 MED16-214ENST00000617672 554 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
RAB6CQ53S08 AP001350.2-201ENST00000625104 1094 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
RAB6CQ53S08 AL645728.2-201ENST00000641974 660 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
RAB6CQ53S08 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
RAB6CQ53S08 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RAB6CQ53S08 PSMC3IP-202ENST00000393795 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RAB6CQ53S08 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
RAB6CQ53S08 HSD17B6-203ENST00000554150 1547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
RAB6CQ53S08 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RAB6CQ53S08 ATP5S-201ENST00000245448 1671 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RAB6CQ53S08 IRF5-215ENST00000619830 1652 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
RAB6CQ53S08 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RAB6CQ53S08 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RAB6CQ53S08 GPAA1P2-202ENST00000606848 1787 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
RAB6CQ53S08 PIKFYVE-204ENST00000407449 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RAB6CQ53S08 EEFSEC-202ENST00000483457 1859 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
RAB6CQ53S08 HAPLN3-201ENST00000359595 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RAB6CQ53S08 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
RAB6CQ53S08 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RAB6CQ53S08 GSKIP-205ENST00000555181 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RAB6CQ53S08 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RAB6CQ53S08 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RAB6CQ53S08 SURF4-208ENST00000613129 3148 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
RAB6CQ53S08 DGKZ-201ENST00000318201 3213 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
RAB6CQ53S08 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
RAB6CQ53S08 ARHGAP22-201ENST00000249601 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.7 ms