Protein–RNA interactions for Protein: Q16667

CDKN3, Cyclin-dependent kinase inhibitor 3, humanhuman

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Length 212 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDKN3Q16667 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CDKN3Q16667 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CDKN3Q16667 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CDKN3Q16667 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CDKN3Q16667 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CDKN3Q16667 PAAF1-205ENST00000535604 1695 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CDKN3Q16667 CCNA1-203ENST00000625767 1699 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CDKN3Q16667 NFIX-214ENST00000592199 1509 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CDKN3Q16667 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CDKN3Q16667 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CDKN3Q16667 PAK4-203ENST00000360442 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CDKN3Q16667 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CDKN3Q16667 GOLGA2-213ENST00000610329 2212 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CDKN3Q16667 CCDC90B-202ENST00000455220 1550 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CDKN3Q16667 C2orf81-206ENST00000640868 2407 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CDKN3Q16667 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CDKN3Q16667 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CDKN3Q16667 BCL2L12-202ENST00000246785 1431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CDKN3Q16667 ATP6V1E1-201ENST00000253413 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CDKN3Q16667 NKAIN4-202ENST00000370313 1421 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CDKN3Q16667 KCNK9-203ENST00000520439 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CDKN3Q16667 MTA2-204ENST00000527204 2265 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CDKN3Q16667 AL139400.1-201ENST00000366220 510 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
CDKN3Q16667 EFNA4-202ENST00000368409 1263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CDKN3Q16667 FAM24B-201ENST00000368896 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CDKN3Q16667 MECP2-203ENST00000407218 1174 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CDKN3Q16667 DANCR-201ENST00000411630 904 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CDKN3Q16667 AC004461.1-201ENST00000412461 403 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
CDKN3Q16667 HHATL-AS1-201ENST00000423165 557 ntTSL 4 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CDKN3Q16667 AL109613.1-202ENST00000427243 639 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CDKN3Q16667 AL160408.2-201ENST00000436039 693 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CDKN3Q16667 TM4SF19-204ENST00000454715 1061 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CDKN3Q16667 AC112191.1-201ENST00000523689 701 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
CDKN3Q16667 RNASEK-207ENST00000552842 595 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CDKN3Q16667 IGHV3OR16-6-201ENST00000568775 360 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
CDKN3Q16667 AC010503.2-201ENST00000599292 296 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CDKN3Q16667 AC021097.1-201ENST00000607902 574 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
CDKN3Q16667 SWI5-206ENST00000608796 906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CDKN3Q16667 AL513210.1-201ENST00000629608 234 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
CDKN3Q16667 AC105339.1-204ENST00000636249 355 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
CDKN3Q16667 MAGEF1-201ENST00000317897 1636 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CDKN3Q16667 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CDKN3Q16667 IGSF11-209ENST00000491903 1487 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CDKN3Q16667 NDUFA11-205ENST00000592634 2154 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CDKN3Q16667 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CDKN3Q16667 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CDKN3Q16667 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CDKN3Q16667 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CDKN3Q16667 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CDKN3Q16667 GPR108-202ENST00000430424 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CDKN3Q16667 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CDKN3Q16667 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CDKN3Q16667 SIRT6-201ENST00000305232 1506 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CDKN3Q16667 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CDKN3Q16667 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CDKN3Q16667 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
CDKN3Q16667 UGT3A2-204ENST00000513300 1924 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.26
CDKN3Q16667 GOLGA6L17P-202ENST00000614358 1398 ntBASIC16.64■□□□□ 0.26
CDKN3Q16667 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CDKN3Q16667 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CDKN3Q16667 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CDKN3Q16667 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CDKN3Q16667 TRPC6-202ENST00000348423 2448 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CDKN3Q16667 SYS1-203ENST00000414310 795 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CDKN3Q16667 LINC00029-202ENST00000414668 1117 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CDKN3Q16667 HILS1-201ENST00000504307 1219 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CDKN3Q16667 CTBP1-AS2-204ENST00000514984 533 ntTSL 4 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CDKN3Q16667 C8orf46-213ENST00000521495 557 ntTSL 4 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CDKN3Q16667 LINC01485-205ENST00000523617 586 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CDKN3Q16667 INO80E-210ENST00000567705 880 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CDKN3Q16667 GPR42-202ENST00000597214 1182 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CDKN3Q16667 IRF1-211ENST00000613424 821 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CDKN3Q16667 ATP5S-201ENST00000245448 1671 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CDKN3Q16667 LETM2-201ENST00000297720 1693 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CDKN3Q16667 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CDKN3Q16667 LYPD5-203ENST00000594013 1519 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CDKN3Q16667 ZDHHC4-206ENST00000405731 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CDKN3Q16667 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CDKN3Q16667 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CDKN3Q16667 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CDKN3Q16667 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CDKN3Q16667 CA12-203ENST00000422263 2556 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CDKN3Q16667 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CDKN3Q16667 AP005329.2-201ENST00000580139 1771 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CDKN3Q16667 BCL2L12-203ENST00000441864 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CDKN3Q16667 SERPINB6-201ENST00000335686 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CDKN3Q16667 AL512625.3-203ENST00000445604 1602 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CDKN3Q16667 NTNG1-203ENST00000370066 1443 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CDKN3Q16667 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CDKN3Q16667 CCDC183-201ENST00000338005 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CDKN3Q16667 PACS1-209ENST00000529757 1688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CDKN3Q16667 IGHM-202ENST00000637539 1683 ntAPPRIS P5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CDKN3Q16667 LRRC42-201ENST00000319223 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CDKN3Q16667 LGMN-211ENST00000555699 1728 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CDKN3Q16667 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
CDKN3Q16667 CTRB2-201ENST00000303037 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CDKN3Q16667 H3F3C-201ENST00000340398 1057 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CDKN3Q16667 GBGT1-201ENST00000372036 871 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CDKN3Q16667 LCN2-203ENST00000373017 848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CDKN3Q16667 MIR770-201ENST00000390219 98 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
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