Protein–RNA interactions for Protein: Q16610

ECM1, Extracellular matrix protein 1, humanhuman

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Length 540 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECM1Q16610 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ECM1Q16610 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ECM1Q16610 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ECM1Q16610 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ECM1Q16610 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ECM1Q16610 ME2P1-201ENST00000426028 1970 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
ECM1Q16610 AC009292.1-201ENST00000502156 1986 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ECM1Q16610 GLS2-216ENST00000610413 2296 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ECM1Q16610 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ECM1Q16610 SLC22A12-205ENST00000473690 2522 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ECM1Q16610 TBRG4-203ENST00000395655 2225 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ECM1Q16610 LINC00612-201ENST00000538094 2213 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ECM1Q16610 GSKIP-205ENST00000555181 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ECM1Q16610 MAGEF1-201ENST00000317897 1636 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ECM1Q16610 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ECM1Q16610 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ECM1Q16610 AC053503.2-201ENST00000420563 1598 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ECM1Q16610 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ECM1Q16610 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ECM1Q16610 ATP5G3-202ENST00000392541 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ECM1Q16610 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ECM1Q16610 AL109741.1-201ENST00000432195 403 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ECM1Q16610 ADH5P3-201ENST00000433842 1137 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
ECM1Q16610 AC112482.1-201ENST00000492080 688 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
ECM1Q16610 KRTAP5-9-201ENST00000528743 1136 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ECM1Q16610 ELOF1-204ENST00000587806 1172 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ECM1Q16610 AC010327.4-202ENST00000591484 748 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
ECM1Q16610 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ECM1Q16610 MTDHP5-201ENST00000598980 586 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
ECM1Q16610 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ECM1Q16610 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ECM1Q16610 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ECM1Q16610 MFSD2B-202ENST00000406420 1528 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ECM1Q16610 COMMD6-203ENST00000377615 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ECM1Q16610 MIER1-205ENST00000371014 1728 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ECM1Q16610 TACR2-202ENST00000373307 1740 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ECM1Q16610 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ECM1Q16610 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ECM1Q16610 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ECM1Q16610 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ECM1Q16610 DEF8-225ENST00000569453 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ECM1Q16610 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ECM1Q16610 ST3GAL5-229ENST00000638986 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ECM1Q16610 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ECM1Q16610 AL121758.1-201ENST00000488788 2714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ECM1Q16610 AP001372.2-201ENST00000526036 2493 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ECM1Q16610 AC110813.1-201ENST00000507934 2209 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ECM1Q16610 AP1AR-201ENST00000274000 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ECM1Q16610 FIGLA-201ENST00000332372 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ECM1Q16610 IFNL1-201ENST00000333625 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ECM1Q16610 AMACR-204ENST00000382085 1195 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
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ECM1Q16610 BX842568.4-201ENST00000421222 227 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
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ECM1Q16610 EHMT1-216ENST00000493484 1182 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ECM1Q16610 HILS1-201ENST00000504307 1219 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ECM1Q16610 SEC24B-AS1-203ENST00000505895 800 ntTSL 4 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ECM1Q16610 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ECM1Q16610 IGHV3OR16-6-201ENST00000568775 360 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
ECM1Q16610 AC021097.1-201ENST00000607902 574 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
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ECM1Q16610 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ECM1Q16610 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ECM1Q16610 SLC45A1-202ENST00000471889 2784 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ECM1Q16610 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ECM1Q16610 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ECM1Q16610 COQ10A-202ENST00000433805 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ECM1Q16610 AC087289.2-201ENST00000587267 1419 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ECM1Q16610 TVP23B-201ENST00000307767 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ECM1Q16610 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ECM1Q16610 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ECM1Q16610 PRDM5-202ENST00000394435 2492 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ECM1Q16610 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ECM1Q16610 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ECM1Q16610 UNC5C-202ENST00000504962 1789 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ECM1Q16610 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ECM1Q16610 PAAF1-205ENST00000535604 1695 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ECM1Q16610 AC002056.1-201ENST00000395613 760 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
ECM1Q16610 MOB1B-202ENST00000396051 1107 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ECM1Q16610 GPX1P2-201ENST00000429271 606 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
ECM1Q16610 AL049569.1-201ENST00000446261 636 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ECM1Q16610 CTBP1-AS2-204ENST00000514984 533 ntTSL 4 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ECM1Q16610 MVB12A-211ENST00000529939 1091 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ECM1Q16610 MARVELD3-206ENST00000567566 850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ECM1Q16610 IGFLR1-205ENST00000588992 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ECM1Q16610 AC008761.1-201ENST00000595363 217 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ECM1Q16610 AC004597.1-201ENST00000595525 561 ntTSL 4 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ECM1Q16610 MRPL34-205ENST00000600434 793 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ECM1Q16610 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ECM1Q16610 AP000487.1-202ENST00000500185 2602 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ECM1Q16610 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ECM1Q16610 MYOD1-201ENST00000250003 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ECM1Q16610 HAGH-202ENST00000397356 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ECM1Q16610 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ECM1Q16610 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ECM1Q16610 ICAM4-203ENST00000393717 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ECM1Q16610 PIGQ-201ENST00000026218 2846 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ECM1Q16610 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
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