Protein–RNA interactions for Protein: Q16549

PCSK7, Proprotein convertase subtilisin/kexin type 7, humanhuman

Predictions only

Length 785 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCSK7Q16549 KDM5C-202ENST00000375379 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
PCSK7Q16549 HLA-A-202ENST00000376806 1854 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
PCSK7Q16549 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PCSK7Q16549 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
PCSK7Q16549 SPAG9-205ENST00000505279 4659 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PCSK7Q16549 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PCSK7Q16549 RANBP3-201ENST00000034275 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PCSK7Q16549 LILRA6-201ENST00000245621 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
PCSK7Q16549 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PCSK7Q16549 AC093627.6-201ENST00000478759 1365 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
PCSK7Q16549 FAM76B-201ENST00000358780 3952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PCSK7Q16549 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
PCSK7Q16549 ABHD15-201ENST00000307201 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PCSK7Q16549 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PCSK7Q16549 HUS1B-201ENST00000380907 1025 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
PCSK7Q16549 ABHD11-203ENST00000395147 812 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
PCSK7Q16549 CD99L2-206ENST00000466436 988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PCSK7Q16549 UCHL1-204ENST00000503431 917 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
PCSK7Q16549 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
PCSK7Q16549 MRPL52-208ENST00000553711 586 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
PCSK7Q16549 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
PCSK7Q16549 AC010776.2-201ENST00000588946 1081 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
PCSK7Q16549 Z83851.2-201ENST00000609564 659 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
PCSK7Q16549 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
PCSK7Q16549 PANK4-201ENST00000378466 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PCSK7Q16549 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PCSK7Q16549 CD9-203ENST00000382518 1556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
PCSK7Q16549 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
PCSK7Q16549 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
PCSK7Q16549 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PCSK7Q16549 TRIP10-201ENST00000313244 2153 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PCSK7Q16549 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PCSK7Q16549 DGKE-204ENST00000572810 1843 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PCSK7Q16549 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
PCSK7Q16549 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
PCSK7Q16549 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PCSK7Q16549 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
PCSK7Q16549 EIF4G3-212ENST00000602326 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PCSK7Q16549 AC131009.4-201ENST00000624048 1740 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
PCSK7Q16549 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
PCSK7Q16549 SRSF2-205ENST00000508921 1390 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
PCSK7Q16549 PRR15-201ENST00000319694 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PCSK7Q16549 SH3BP4-201ENST00000344528 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PCSK7Q16549 SLC22A20-204ENST00000530038 1673 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
PCSK7Q16549 B4GALNT4-201ENST00000329962 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PCSK7Q16549 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PCSK7Q16549 AMT-206ENST00000458307 1860 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
PCSK7Q16549 C2orf81-206ENST00000640868 2407 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
PCSK7Q16549 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PCSK7Q16549 CRYGEP-201ENST00000412192 528 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
PCSK7Q16549 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
PCSK7Q16549 SUMO2P17-202ENST00000508743 738 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
PCSK7Q16549 LDLRAD2-203ENST00000543870 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PCSK7Q16549 CD63-204ENST00000546939 779 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
PCSK7Q16549 AL049869.3-201ENST00000554918 558 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
PCSK7Q16549 AC092115.3-201ENST00000575838 592 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
PCSK7Q16549 TCAP-202ENST00000578283 583 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
PCSK7Q16549 AL512343.2-201ENST00000609423 490 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
PCSK7Q16549 MAGIX-204ENST00000614074 778 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PCSK7Q16549 ACTN2-207ENST00000546208 5103 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PCSK7Q16549 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PCSK7Q16549 ACOT12-201ENST00000307624 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PCSK7Q16549 MAPT-201ENST00000262410 6762 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PCSK7Q16549 SLC9A5-201ENST00000299798 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PCSK7Q16549 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PCSK7Q16549 RDH10-201ENST00000240285 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PCSK7Q16549 AC062028.1-203ENST00000447433 1472 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PCSK7Q16549 PKD1L2-209ENST00000531391 1488 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PCSK7Q16549 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
PCSK7Q16549 JAK3-201ENST00000458235 5432 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
PCSK7Q16549 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PCSK7Q16549 GOLGA2-213ENST00000610329 2212 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
PCSK7Q16549 SLC9A6-203ENST00000370701 4755 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PCSK7Q16549 SUSD4-202ENST00000343846 3480 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
PCSK7Q16549 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PCSK7Q16549 ZC3H12A-201ENST00000373087 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PCSK7Q16549 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
PCSK7Q16549 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PCSK7Q16549 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
PCSK7Q16549 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PCSK7Q16549 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PCSK7Q16549 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
PCSK7Q16549 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PCSK7Q16549 SHTN1-202ENST00000355371 5361 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
PCSK7Q16549 PEG3-206ENST00000598410 5304 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PCSK7Q16549 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
PCSK7Q16549 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
PCSK7Q16549 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PCSK7Q16549 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
PCSK7Q16549 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PCSK7Q16549 Z97056.1-201ENST00000433230 556 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
PCSK7Q16549 HYAL1-206ENST00000447605 666 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PCSK7Q16549 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
PCSK7Q16549 NUTM2B-AS1-211ENST00000601369 1233 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
PCSK7Q16549 BSG-214ENST00000614867 960 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
PCSK7Q16549 ZNF445-205ENST00000617032 1291 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
PCSK7Q16549 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
PCSK7Q16549 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
PCSK7Q16549 IQSEC2-210ENST00000639161 936 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PCSK7Q16549 AFTPH-202ENST00000238856 4040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.8 ms