Protein–RNA interactions for Protein: Q16534

HLF, Hepatic leukemia factor, humanhuman

Predictions only

Length 295 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLFQ16534 TMEM161A-206ENST00000587583 1654 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.91
HLFQ16534 SFRP2-201ENST00000274063 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
HLFQ16534 FAM174A-201ENST00000312637 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
HLFQ16534 UBAP1L-201ENST00000502113 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
HLFQ16534 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
HLFQ16534 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
HLFQ16534 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
HLFQ16534 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
HLFQ16534 AC093724.1-201ENST00000448659 1027 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
HLFQ16534 TMEM176A-202ENST00000461345 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
HLFQ16534 API5-211ENST00000534695 560 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
HLFQ16534 CR383656.12-201ENST00000549567 513 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
HLFQ16534 FKBP4-208ENST00000630279 156 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
HLFQ16534 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
HLFQ16534 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
HLFQ16534 PSMC3IP-202ENST00000393795 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
HLFQ16534 TMEM120A-201ENST00000417509 1444 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
HLFQ16534 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
HLFQ16534 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
HLFQ16534 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
HLFQ16534 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
HLFQ16534 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
HLFQ16534 C2orf68-202ENST00000409734 1722 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
HLFQ16534 CDIP1-206ENST00000563507 1463 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
HLFQ16534 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
HLFQ16534 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC20.75■□□□□ 0.91
HLFQ16534 DUSP26-203ENST00000523956 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
HLFQ16534 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
HLFQ16534 GPHB5-201ENST00000314140 393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
HLFQ16534 MRNIP-202ENST00000376931 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
HLFQ16534 IGHV3-23-201ENST00000390609 432 ntAPPRIS P1 BASIC20.75■□□□□ 0.91
HLFQ16534 CSHL1-204ENST00000392824 823 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
HLFQ16534 RBM39-205ENST00000397370 612 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
HLFQ16534 VMO1-203ENST00000416307 712 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
HLFQ16534 PABPN1L-202ENST00000419291 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
HLFQ16534 RPUSD3-204ENST00000424438 1005 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
HLFQ16534 GNG4-205ENST00000484517 684 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
HLFQ16534 HHEX-203ENST00000492654 808 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
HLFQ16534 AL512361.1-201ENST00000554200 418 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
HLFQ16534 AC005544.2-201ENST00000579138 229 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
HLFQ16534 AC012615.6-204ENST00000587741 477 ntTSL 3 BASIC20.75■□□□□ 0.91
HLFQ16534 AC027307.3-201ENST00000594262 1100 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
HLFQ16534 RNA5-8SN1-201ENST00000610460 153 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
HLFQ16534 RNA5-8SN5-202ENST00000612463 153 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
HLFQ16534 Metazoa_SRP.112-201ENST00000613101 279 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
HLFQ16534 RNA5-8SN4-201ENST00000613359 153 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
HLFQ16534 RNA5-8SN5-201ENST00000619471 153 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
HLFQ16534 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
HLFQ16534 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
HLFQ16534 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
HLFQ16534 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
HLFQ16534 LINC01660-203ENST00000618517 1859 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
HLFQ16534 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
HLFQ16534 RAD51C-215ENST00000583539 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
HLFQ16534 TEAD3-204ENST00000639578 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
HLFQ16534 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
HLFQ16534 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
HLFQ16534 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
HLFQ16534 DHRS1-201ENST00000288111 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
HLFQ16534 CD1E-212ENST00000368167 1458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
HLFQ16534 PRRT3-202ENST00000411976 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
HLFQ16534 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
HLFQ16534 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
HLFQ16534 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC20.74■□□□□ 0.91
HLFQ16534 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
HLFQ16534 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
HLFQ16534 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
HLFQ16534 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
HLFQ16534 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
HLFQ16534 AL807752.4-201ENST00000439076 580 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
HLFQ16534 MAGI2-AS3-208ENST00000446159 670 ntTSL 3 BASIC20.74■□□□□ 0.91
HLFQ16534 AL033519.3-201ENST00000450618 595 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
HLFQ16534 RAB3A-202ENST00000464076 1253 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
HLFQ16534 PMF1-BGLAP-203ENST00000490491 1007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
HLFQ16534 AC104407.1-201ENST00000511017 1568 ntTSL 3 BASIC20.74■□□□□ 0.91
HLFQ16534 FAM49B-224ENST00000522941 1700 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
HLFQ16534 AC136475.3-203ENST00000525217 617 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
HLFQ16534 SLC8B1-206ENST00000549069 1058 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
HLFQ16534 EEF1AKMT3-204ENST00000551420 836 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
HLFQ16534 SPATA8-AS1-201ENST00000558722 465 ntTSL 3 BASIC20.74■□□□□ 0.91
HLFQ16534 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
HLFQ16534 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
HLFQ16534 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
HLFQ16534 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
HLFQ16534 AC007541.1-201ENST00000570282 1469 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
HLFQ16534 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC20.74■□□□□ 0.91
HLFQ16534 DDTL-201ENST00000215770 1545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
HLFQ16534 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
HLFQ16534 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
HLFQ16534 C12orf10-201ENST00000267103 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
HLFQ16534 CIDEA-201ENST00000320477 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
HLFQ16534 AGER-204ENST00000375067 1250 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
HLFQ16534 LINC00473-201ENST00000444465 798 ntTSL 3 BASIC20.73■□□□□ 0.91
HLFQ16534 MAPKAPK5-203ENST00000547305 494 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
HLFQ16534 NUBP2-208ENST00000565987 1049 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
HLFQ16534 TP53TG3HP-202ENST00000569755 579 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
HLFQ16534 DM1-AS-201ENST00000586251 483 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
HLFQ16534 AL132655.2-201ENST00000596276 594 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
HLFQ16534 AL358472.5-202ENST00000641448 1267 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
HLFQ16534 AL139011.1-202ENST00000642063 584 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.5 ms