Protein–RNA interactions for Protein: Q16445

GABRA6, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit alpha-6, humanhuman

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Length 453 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABRA6Q16445 BHMT2-205ENST00000521567 1537 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
GABRA6Q16445 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
GABRA6Q16445 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
GABRA6Q16445 WLS-202ENST00000354777 2037 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
GABRA6Q16445 ORMDL1-203ENST00000392350 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
GABRA6Q16445 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
GABRA6Q16445 SHISA6-202ENST00000409168 7262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
GABRA6Q16445 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
GABRA6Q16445 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
GABRA6Q16445 NOX4-207ENST00000525196 1555 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
GABRA6Q16445 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
GABRA6Q16445 KRT8P39-201ENST00000396270 1433 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
GABRA6Q16445 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
GABRA6Q16445 CRYBA2-201ENST00000295728 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
GABRA6Q16445 TFAMP1-201ENST00000412727 736 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
GABRA6Q16445 AL135791.1-201ENST00000429214 826 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
GABRA6Q16445 AL391069.2-202ENST00000447795 622 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
GABRA6Q16445 AL390729.1-201ENST00000456651 587 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
GABRA6Q16445 SEC24B-AS1-201ENST00000499359 957 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
GABRA6Q16445 GATB-205ENST00000508611 605 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
GABRA6Q16445 CCND3-213ENST00000510503 1257 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
GABRA6Q16445 SEC24B-AS1-204ENST00000510971 554 ntTSL 4 BASIC14.61□□□□□ -0.07
GABRA6Q16445 AP000344.2-201ENST00000512987 629 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
GABRA6Q16445 SMCO4-204ENST00000527149 472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
GABRA6Q16445 KRTAP5-9-201ENST00000528743 1136 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
GABRA6Q16445 MTX1-207ENST00000609421 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
GABRA6Q16445 IRF1-211ENST00000613424 821 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
GABRA6Q16445 CDC42EP4-209ENST00000630622 240 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
GABRA6Q16445 AC105339.1-204ENST00000636249 355 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
GABRA6Q16445 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
GABRA6Q16445 CKMT2-202ENST00000424301 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
GABRA6Q16445 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
GABRA6Q16445 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
GABRA6Q16445 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
GABRA6Q16445 CAMKV-204ENST00000466940 1475 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
GABRA6Q16445 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
GABRA6Q16445 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
GABRA6Q16445 AKAP8P1-201ENST00000434743 1349 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
GABRA6Q16445 ADAMTS18-201ENST00000282849 5913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
GABRA6Q16445 SLC22A12-201ENST00000336464 1854 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
GABRA6Q16445 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
GABRA6Q16445 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
GABRA6Q16445 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
GABRA6Q16445 GALNT9-202ENST00000397325 1727 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
GABRA6Q16445 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
GABRA6Q16445 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
GABRA6Q16445 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
GABRA6Q16445 CHCHD3-201ENST00000262570 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
GABRA6Q16445 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
GABRA6Q16445 WASH6P-202ENST00000359512 1437 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
GABRA6Q16445 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
GABRA6Q16445 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
GABRA6Q16445 ADGRB2-206ENST00000398556 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
GABRA6Q16445 L2HGDH-202ENST00000267436 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
GABRA6Q16445 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
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GABRA6Q16445 LTC4S-201ENST00000292596 666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
GABRA6Q16445 RNF151-201ENST00000321392 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
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GABRA6Q16445 TMEM205-201ENST00000354882 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
GABRA6Q16445 CD99-202ENST00000381180 530 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
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GABRA6Q16445 CHMP3-203ENST00000409225 1099 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
GABRA6Q16445 SUMO1-209ENST00000409712 761 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
GABRA6Q16445 CNN2P11-201ENST00000429351 262 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
GABRA6Q16445 URGCP-206ENST00000446958 365 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
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GABRA6Q16445 RNF151-203ENST00000569714 796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
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GABRA6Q16445 FLYWCH2-203ENST00000572006 754 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
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GABRA6Q16445 LINC01128-208ENST00000608189 824 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
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GABRA6Q16445 AL513210.1-201ENST00000629608 234 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
GABRA6Q16445 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
GABRA6Q16445 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
GABRA6Q16445 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
GABRA6Q16445 STEAP3-204ENST00000409811 2103 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
GABRA6Q16445 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
GABRA6Q16445 LRRC42-201ENST00000319223 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
GABRA6Q16445 SIRT6-203ENST00000594279 1507 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
GABRA6Q16445 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
GABRA6Q16445 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
GABRA6Q16445 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
GABRA6Q16445 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
GABRA6Q16445 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
GABRA6Q16445 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
GABRA6Q16445 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
GABRA6Q16445 HLA-F-216ENST00000259951 1635 ntAPPRIS P4 BASIC14.59□□□□□ -0.07
GABRA6Q16445 ARPC5-201ENST00000294742 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
GABRA6Q16445 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
GABRA6Q16445 ZNF446-201ENST00000335841 1889 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
GABRA6Q16445 PHGDH-202ENST00000369409 1882 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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