Protein–RNA interactions for Protein: Q16048

PMCHL1, Putative pro-MCH-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 86 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PMCHL1Q16048 SOX14-201ENST00000306087 2055 ntAPPRIS P1 BASIC12.36□□□□□ -0.43
PMCHL1Q16048 PYCR1-201ENST00000329875 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
PMCHL1Q16048 SMAD2-202ENST00000356825 10445 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
PMCHL1Q16048 CYP27B1-201ENST00000228606 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
PMCHL1Q16048 RAB2A-201ENST00000262646 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
PMCHL1Q16048 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
PMCHL1Q16048 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
PMCHL1Q16048 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
PMCHL1Q16048 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
PMCHL1Q16048 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC12.36□□□□□ -0.43
PMCHL1Q16048 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
PMCHL1Q16048 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
PMCHL1Q16048 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
PMCHL1Q16048 PTPRU-205ENST00000460170 5337 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
PMCHL1Q16048 C11orf80-201ENST00000360962 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
PMCHL1Q16048 IL17RD-201ENST00000296318 8720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
PMCHL1Q16048 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
PMCHL1Q16048 HSPA4L-204ENST00000508776 3020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
PMCHL1Q16048 SLC4A8-204ENST00000514353 3041 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
PMCHL1Q16048 KCNT1-208ENST00000488444 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
PMCHL1Q16048 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
PMCHL1Q16048 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
PMCHL1Q16048 ACOX3-203ENST00000503233 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
PMCHL1Q16048 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
PMCHL1Q16048 AC005252.3-201ENST00000623855 2258 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
PMCHL1Q16048 NELFA-203ENST00000411638 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
PMCHL1Q16048 DENND1B-211ENST00000620048 8378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
PMCHL1Q16048 WDR59-201ENST00000262144 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
PMCHL1Q16048 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
PMCHL1Q16048 FOXRED2-201ENST00000216187 3933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
PMCHL1Q16048 AC010247.2-201ENST00000559786 1955 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
PMCHL1Q16048 CEP78-203ENST00000376598 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
PMCHL1Q16048 LINC01101-201ENST00000622953 1884 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
PMCHL1Q16048 AUTS2-218ENST00000615871 4511 ntTSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
PMCHL1Q16048 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
PMCHL1Q16048 EML4-201ENST00000318522 5549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
PMCHL1Q16048 HHIP-202ENST00000434550 1770 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
PMCHL1Q16048 AIFM1-202ENST00000319908 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
PMCHL1Q16048 ZNF618-201ENST00000288466 9109 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
PMCHL1Q16048 TMEM50A-201ENST00000374358 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
PMCHL1Q16048 GRSF1-208ENST00000545193 2682 ntTSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
PMCHL1Q16048 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
PMCHL1Q16048 AC007686.3-201ENST00000619017 3487 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
PMCHL1Q16048 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
PMCHL1Q16048 IRAK1-204ENST00000393687 2049 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
PMCHL1Q16048 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
PMCHL1Q16048 WDR6-222ENST00000615452 1949 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
PMCHL1Q16048 EEF1A1-202ENST00000316292 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
PMCHL1Q16048 PTENP1-202ENST00000532280 3996 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
PMCHL1Q16048 PES1-202ENST00000354694 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
PMCHL1Q16048 SERPINE3-204ENST00000524365 2293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
PMCHL1Q16048 GATA3-202ENST00000379328 3078 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
PMCHL1Q16048 RNF222-202ENST00000399398 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
PMCHL1Q16048 GPAT2-202ENST00000434632 3061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
PMCHL1Q16048 FBXL19-202ENST00000380310 3796 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
PMCHL1Q16048 PCM1-206ENST00000518537 2171 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
PMCHL1Q16048 PPP3CA-207ENST00000512215 4007 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
PMCHL1Q16048 ANKLE2-210ENST00000542657 2446 ntTSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
PMCHL1Q16048 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
PMCHL1Q16048 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
PMCHL1Q16048 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
PMCHL1Q16048 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC12.35□□□□□ -0.43
PMCHL1Q16048 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
PMCHL1Q16048 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
PMCHL1Q16048 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
PMCHL1Q16048 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
PMCHL1Q16048 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
PMCHL1Q16048 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
PMCHL1Q16048 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC12.35□□□□□ -0.43
PMCHL1Q16048 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
PMCHL1Q16048 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
PMCHL1Q16048 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC12.35□□□□□ -0.43
PMCHL1Q16048 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
PMCHL1Q16048 FLI1-201ENST00000281428 4151 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
PMCHL1Q16048 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
PMCHL1Q16048 SPATS2L-209ENST00000409988 2698 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
PMCHL1Q16048 ARRDC4-201ENST00000268042 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
PMCHL1Q16048 CENPT-202ENST00000440851 2200 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
PMCHL1Q16048 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
PMCHL1Q16048 NIPA1-201ENST00000337435 6567 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
PMCHL1Q16048 YTHDF3-205ENST00000539294 5163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
PMCHL1Q16048 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
PMCHL1Q16048 ZMYM3-206ENST00000373988 6021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
PMCHL1Q16048 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
PMCHL1Q16048 AP000439.3-201ENST00000545202 2376 ntTSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
PMCHL1Q16048 CYP4F22-201ENST00000269703 2641 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
PMCHL1Q16048 MCM3AP-AS1-203ENST00000421927 2280 ntTSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
PMCHL1Q16048 KCNN2-201ENST00000264773 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
PMCHL1Q16048 KIF7-201ENST00000394412 4551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
PMCHL1Q16048 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
PMCHL1Q16048 RNF145-212ENST00000611185 3624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
PMCHL1Q16048 AC006486.2-201ENST00000624246 2199 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
PMCHL1Q16048 STAC3-206ENST00000554578 1580 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
PMCHL1Q16048 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
PMCHL1Q16048 AC138904.3-201ENST00000635780 2681 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
PMCHL1Q16048 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
PMCHL1Q16048 DLX6-202ENST00000518156 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
PMCHL1Q16048 IMPDH1-203ENST00000354269 2580 ntTSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
PMCHL1Q16048 FRMD3-201ENST00000304195 5297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
PMCHL1Q16048 CALCR-207ENST00000426151 1741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.7 ms