Protein–RNA interactions for Protein: Q15811

ITSN1, Intersectin-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,721 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITSN1Q15811 SERF1B-208ENST00000515588 792 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ITSN1Q15811 RAB1B-202ENST00000527397 991 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ITSN1Q15811 SLC38A7-207ENST00000564391 731 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ITSN1Q15811 AC008770.3-202ENST00000591944 567 ntTSL 4 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ITSN1Q15811 AC008735.3-201ENST00000596646 500 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
ITSN1Q15811 PDCD6-212ENST00000614778 1050 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ITSN1Q15811 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
ITSN1Q15811 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ITSN1Q15811 CCDC28A-201ENST00000332797 1496 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ITSN1Q15811 DUSP14-204ENST00000613659 1559 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ITSN1Q15811 AL512652.2-201ENST00000625156 1716 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
ITSN1Q15811 PLEKHA8P1-201ENST00000256692 1839 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ITSN1Q15811 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ITSN1Q15811 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ITSN1Q15811 MCM3AP-AS1-202ENST00000420074 1947 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ITSN1Q15811 VEZF1-202ENST00000581208 2321 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ITSN1Q15811 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ITSN1Q15811 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ITSN1Q15811 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ITSN1Q15811 RASAL2-AS1-202ENST00000421505 2329 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ITSN1Q15811 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
ITSN1Q15811 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ITSN1Q15811 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ITSN1Q15811 ATP6AP2-233ENST00000638153 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ITSN1Q15811 CLCN6-207ENST00000376497 814 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ITSN1Q15811 AC087499.6-201ENST00000411576 835 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
ITSN1Q15811 TMEM176B-202ENST00000429904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ITSN1Q15811 AL356441.1-201ENST00000452618 492 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ITSN1Q15811 MRPL36-204ENST00000508987 686 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ITSN1Q15811 CLNS1A-210ENST00000528364 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ITSN1Q15811 AC007406.4-201ENST00000539568 765 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ITSN1Q15811 AC005520.2-201ENST00000556194 573 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ITSN1Q15811 AC244517.11-204ENST00000624424 760 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ITSN1Q15811 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ITSN1Q15811 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ITSN1Q15811 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ITSN1Q15811 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ITSN1Q15811 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ITSN1Q15811 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ITSN1Q15811 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ITSN1Q15811 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ITSN1Q15811 TEAD2-203ENST00000539846 1444 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ITSN1Q15811 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ITSN1Q15811 CD300LG-204ENST00000539718 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ITSN1Q15811 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ITSN1Q15811 SPAG7-201ENST00000206020 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ITSN1Q15811 AGTRAP-202ENST00000376627 1055 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ITSN1Q15811 PIR-201ENST00000380420 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ITSN1Q15811 AC098850.1-201ENST00000419919 790 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
ITSN1Q15811 DRAP1-208ENST00000532933 751 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ITSN1Q15811 SNX29P1-201ENST00000548357 1007 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
ITSN1Q15811 AC106886.1-201ENST00000568660 600 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
ITSN1Q15811 AC079336.1-201ENST00000583156 420 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ITSN1Q15811 SPATC1-201ENST00000377470 2007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ITSN1Q15811 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ITSN1Q15811 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ITSN1Q15811 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ITSN1Q15811 ACSL6-201ENST00000296869 2561 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ITSN1Q15811 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ITSN1Q15811 FLVCR1-AS1-201ENST00000356684 2525 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ITSN1Q15811 DUOXA2-201ENST00000323030 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ITSN1Q15811 TAX1BP1-201ENST00000265393 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ITSN1Q15811 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ITSN1Q15811 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ITSN1Q15811 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ITSN1Q15811 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ITSN1Q15811 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ITSN1Q15811 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ITSN1Q15811 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ITSN1Q15811 HIST1H2AC-203ENST00000602637 1462 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ITSN1Q15811 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ITSN1Q15811 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ITSN1Q15811 TMEM5-205ENST00000537373 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ITSN1Q15811 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ITSN1Q15811 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ITSN1Q15811 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ITSN1Q15811 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ITSN1Q15811 HRCT1-201ENST00000354323 950 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ITSN1Q15811 ZDHHC12-201ENST00000372663 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ITSN1Q15811 CD164L2-203ENST00000374030 993 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ITSN1Q15811 AC073130.2-202ENST00000444244 842 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ITSN1Q15811 AP001995.1-201ENST00000531784 1157 ntTSL 4 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ITSN1Q15811 AC087612.1-201ENST00000560238 658 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ITSN1Q15811 FLT3LG-205ENST00000596435 1034 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ITSN1Q15811 AC074044.1-201ENST00000609673 707 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
ITSN1Q15811 EIPR1-202ENST00000398659 1795 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ITSN1Q15811 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ITSN1Q15811 FBXW9-201ENST00000393261 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ITSN1Q15811 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ITSN1Q15811 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ITSN1Q15811 ABLIM2-202ENST00000361581 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ITSN1Q15811 BMP4-201ENST00000245451 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ITSN1Q15811 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ITSN1Q15811 HDHD3-202ENST00000374180 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ITSN1Q15811 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
ITSN1Q15811 COTL1-201ENST00000262428 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ITSN1Q15811 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ITSN1Q15811 ASNA1-204ENST00000591090 1368 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ITSN1Q15811 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ITSN1Q15811 NDUFS8-201ENST00000313468 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
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