Protein–RNA interactions for Protein: Q15113

PCOLCE, Procollagen C-endopeptidase enhancer 1, humanhuman

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Length 449 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCOLCEQ15113 FBLIM1-201ENST00000332305 1530 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PCOLCEQ15113 SRPK3-201ENST00000370100 1717 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PCOLCEQ15113 AP3S2-216ENST00000617003 1561 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
PCOLCEQ15113 PANK2-209ENST00000621507 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PCOLCEQ15113 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PCOLCEQ15113 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
PCOLCEQ15113 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PCOLCEQ15113 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PCOLCEQ15113 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PCOLCEQ15113 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PCOLCEQ15113 AMT-206ENST00000458307 1860 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PCOLCEQ15113 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PCOLCEQ15113 C10orf107-201ENST00000330194 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PCOLCEQ15113 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PCOLCEQ15113 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PCOLCEQ15113 ZNF524-201ENST00000301073 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PCOLCEQ15113 SIVA1-202ENST00000347067 550 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PCOLCEQ15113 WRB-204ENST00000398753 699 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PCOLCEQ15113 PP14571-201ENST00000404327 934 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PCOLCEQ15113 CYTH4-203ENST00000405206 636 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PCOLCEQ15113 C6orf47-AS1-203ENST00000422049 673 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PCOLCEQ15113 ST7-OT4-203ENST00000466018 894 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PCOLCEQ15113 RARRES2P9-201ENST00000565168 469 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
PCOLCEQ15113 BCL2L12-206ENST00000598306 510 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PCOLCEQ15113 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PCOLCEQ15113 PLEKHA2-208ENST00000616927 1748 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PCOLCEQ15113 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PCOLCEQ15113 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PCOLCEQ15113 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PCOLCEQ15113 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PCOLCEQ15113 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
PCOLCEQ15113 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PCOLCEQ15113 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PCOLCEQ15113 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PCOLCEQ15113 SNX1-213ENST00000561026 1374 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PCOLCEQ15113 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PCOLCEQ15113 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PCOLCEQ15113 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PCOLCEQ15113 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PCOLCEQ15113 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PCOLCEQ15113 PON2-201ENST00000222572 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PCOLCEQ15113 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PCOLCEQ15113 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PCOLCEQ15113 NFYC-210ENST00000425457 1536 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PCOLCEQ15113 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PCOLCEQ15113 AURKAIP1-201ENST00000321751 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PCOLCEQ15113 PSMA8-203ENST00000415576 1280 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PCOLCEQ15113 AC107890.1-201ENST00000422478 521 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
PCOLCEQ15113 AC026202.2-201ENST00000439325 672 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PCOLCEQ15113 SSNA1-204ENST00000464553 723 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PCOLCEQ15113 PTPRVP-202ENST00000490575 953 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PCOLCEQ15113 TPT1-AS1-219ENST00000523506 574 ntTSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PCOLCEQ15113 BEST1-205ENST00000526988 1263 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PCOLCEQ15113 LINC01089-211ENST00000543334 1282 ntTSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PCOLCEQ15113 AC008127.1-201ENST00000548424 499 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PCOLCEQ15113 AC027088.1-201ENST00000557966 1117 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PCOLCEQ15113 LAT-209ENST00000564277 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PCOLCEQ15113 AC011467.4-201ENST00000594891 528 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
PCOLCEQ15113 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PCOLCEQ15113 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PCOLCEQ15113 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PCOLCEQ15113 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PCOLCEQ15113 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PCOLCEQ15113 DGKE-204ENST00000572810 1843 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PCOLCEQ15113 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PCOLCEQ15113 AL512625.3-203ENST00000445604 1602 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PCOLCEQ15113 AC100830.1-201ENST00000560387 1609 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PCOLCEQ15113 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PCOLCEQ15113 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PCOLCEQ15113 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
PCOLCEQ15113 CEP19-202ENST00000409690 2201 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PCOLCEQ15113 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PCOLCEQ15113 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PCOLCEQ15113 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PCOLCEQ15113 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PCOLCEQ15113 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PCOLCEQ15113 CAMKV-217ENST00000620470 1485 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PCOLCEQ15113 AL031731.1-201ENST00000642131 2094 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
PCOLCEQ15113 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PCOLCEQ15113 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PCOLCEQ15113 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PCOLCEQ15113 PSMC3-201ENST00000298852 1544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PCOLCEQ15113 MANBAL-204ENST00000397151 1503 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PCOLCEQ15113 MANBAL-205ENST00000397152 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PCOLCEQ15113 AC006538.1-201ENST00000567905 1585 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
PCOLCEQ15113 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PCOLCEQ15113 PIP5KL1-201ENST00000300432 1104 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PCOLCEQ15113 PPP1R27-201ENST00000330261 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PCOLCEQ15113 BAD-202ENST00000394531 631 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PCOLCEQ15113 CXCL12-206ENST00000395795 404 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PCOLCEQ15113 MIR943-201ENST00000401286 94 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
PCOLCEQ15113 PPP6R2P1-201ENST00000450880 1275 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
PCOLCEQ15113 ITGA9-AS1-209ENST00000450990 562 ntTSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PCOLCEQ15113 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
PCOLCEQ15113 AC092691.1-201ENST00000484092 554 ntTSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PCOLCEQ15113 AC064807.1-203ENST00000520357 575 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PCOLCEQ15113 BAD-207ENST00000544785 525 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PCOLCEQ15113 DUT-210ENST00000559935 569 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PCOLCEQ15113 SPCS2P1-201ENST00000561636 679 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
PCOLCEQ15113 AJ003147.2-201ENST00000576468 629 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
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