Protein–RNA interactions for Protein: Q13888

GTF2H2, General transcription factor IIH subunit 2, humanhuman

Predictions only

Length 395 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2H2Q13888 ONECUT1-201ENST00000305901 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
GTF2H2Q13888 DIMT1-201ENST00000199320 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
GTF2H2Q13888 MYB-203ENST00000341911 3672 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
GTF2H2Q13888 WLS-202ENST00000354777 2037 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
GTF2H2Q13888 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
GTF2H2Q13888 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
GTF2H2Q13888 DGKZ-201ENST00000318201 3213 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
GTF2H2Q13888 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
GTF2H2Q13888 ZNF805-201ENST00000354309 2396 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
GTF2H2Q13888 ACE-204ENST00000428043 5120 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
GTF2H2Q13888 FUT2-201ENST00000391876 1593 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
GTF2H2Q13888 CCDC90B-203ENST00000525503 1919 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
GTF2H2Q13888 AC092143.3-201ENST00000565150 1900 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
GTF2H2Q13888 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
GTF2H2Q13888 BANP-204ENST00000393208 2283 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
GTF2H2Q13888 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
GTF2H2Q13888 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
GTF2H2Q13888 FAM184A-214ENST00000621231 4048 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
GTF2H2Q13888 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
GTF2H2Q13888 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
GTF2H2Q13888 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
GTF2H2Q13888 KCNMA1-201ENST00000286627 6194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
GTF2H2Q13888 MANSC1-202ENST00000535902 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
GTF2H2Q13888 SLC9A5-201ENST00000299798 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
GTF2H2Q13888 ATP5S-201ENST00000245448 1671 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
GTF2H2Q13888 SLC22A20-204ENST00000530038 1673 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
GTF2H2Q13888 SCAI-202ENST00000373549 1968 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
GTF2H2Q13888 AP1AR-201ENST00000274000 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
GTF2H2Q13888 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
GTF2H2Q13888 SLC25A45-202ENST00000398802 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
GTF2H2Q13888 CDIP1-207ENST00000564828 1636 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
GTF2H2Q13888 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
GTF2H2Q13888 ABHD11-203ENST00000395147 812 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
GTF2H2Q13888 RMDN1-202ENST00000430676 1106 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
GTF2H2Q13888 Z97056.1-201ENST00000433230 556 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
GTF2H2Q13888 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
GTF2H2Q13888 AC068389.2-201ENST00000529518 430 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
GTF2H2Q13888 EEF1D-238ENST00000531621 840 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
GTF2H2Q13888 SIGLEC29P-201ENST00000599873 1114 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
GTF2H2Q13888 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
GTF2H2Q13888 AC244517.11-201ENST00000624192 573 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
GTF2H2Q13888 ADORA1-209ENST00000640524 653 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
GTF2H2Q13888 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
GTF2H2Q13888 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
GTF2H2Q13888 GALE-216ENST00000617979 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
GTF2H2Q13888 SH3BP5-202ENST00000383791 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
GTF2H2Q13888 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
GTF2H2Q13888 GLOD4-203ENST00000536578 2497 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
GTF2H2Q13888 PLXND1-201ENST00000324093 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
GTF2H2Q13888 KLF10-202ENST00000395884 3659 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
GTF2H2Q13888 HLA-F-218ENST00000376861 1544 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
GTF2H2Q13888 FOXP1-218ENST00000498215 2400 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
GTF2H2Q13888 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
GTF2H2Q13888 BRD3-201ENST00000303407 5652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
GTF2H2Q13888 FAM83A-202ENST00000518448 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
GTF2H2Q13888 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
GTF2H2Q13888 AL353732.1-201ENST00000569618 1459 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
GTF2H2Q13888 UNC5D-203ENST00000416672 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
GTF2H2Q13888 ADGRB2-203ENST00000398538 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
GTF2H2Q13888 SPAG9-205ENST00000505279 4659 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
GTF2H2Q13888 HYAL1-202ENST00000320295 2324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
GTF2H2Q13888 ITGB1BP1-204ENST00000360635 4859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
GTF2H2Q13888 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
GTF2H2Q13888 LY6E-207ENST00000520466 1419 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
GTF2H2Q13888 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
GTF2H2Q13888 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
GTF2H2Q13888 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
GTF2H2Q13888 AC136759.1-201ENST00000534201 2163 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
GTF2H2Q13888 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
GTF2H2Q13888 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
GTF2H2Q13888 BCL11B-202ENST00000357195 7559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
GTF2H2Q13888 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
GTF2H2Q13888 THTPA-203ENST00000554789 1595 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
GTF2H2Q13888 AL031731.1-201ENST00000642131 2094 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
GTF2H2Q13888 ATP2B1-AS1-201ENST00000605386 3632 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
GTF2H2Q13888 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
GTF2H2Q13888 UIMC1-201ENST00000377227 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
GTF2H2Q13888 DNM2-202ENST00000359692 3588 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
GTF2H2Q13888 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
GTF2H2Q13888 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
GTF2H2Q13888 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
GTF2H2Q13888 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
GTF2H2Q13888 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
GTF2H2Q13888 DUSP6-204ENST00000547291 1074 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
GTF2H2Q13888 ETFA-208ENST00000559602 792 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
GTF2H2Q13888 CYP2A7P1-201ENST00000595391 815 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
GTF2H2Q13888 AC008667.4-201ENST00000607370 168 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
GTF2H2Q13888 MIR1199-201ENST00000621445 119 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
GTF2H2Q13888 AC008735.5-201ENST00000623544 497 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
GTF2H2Q13888 CHAT-203ENST00000351556 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
GTF2H2Q13888 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
GTF2H2Q13888 ABLIM2-202ENST00000361581 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
GTF2H2Q13888 RDH10-201ENST00000240285 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
GTF2H2Q13888 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
GTF2H2Q13888 MUL1-201ENST00000264198 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
GTF2H2Q13888 HTR3E-201ENST00000335304 1912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
GTF2H2Q13888 AC139530.2-201ENST00000571730 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
GTF2H2Q13888 WDR53-201ENST00000332629 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
GTF2H2Q13888 CCDC183-201ENST00000338005 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
GTF2H2Q13888 COPS8-202ENST00000392008 1654 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
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