Protein–RNA interactions for Protein: Q13509

TUBB3, Tubulin beta-3 chain, humanhuman

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Length 450 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBB3Q13509 RUSC1-203ENST00000368349 1968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TUBB3Q13509 RGL2-247ENST00000497454 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TUBB3Q13509 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TUBB3Q13509 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TUBB3Q13509 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TUBB3Q13509 TBRG4-202ENST00000361278 1917 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TUBB3Q13509 MGAT1-201ENST00000307826 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TUBB3Q13509 SPOP-201ENST00000347630 2965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TUBB3Q13509 TRIM36-203ENST00000379618 693 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TUBB3Q13509 AL445931.1-201ENST00000412181 2112 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TUBB3Q13509 KRT18P27-201ENST00000427733 1299 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
TUBB3Q13509 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TUBB3Q13509 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TUBB3Q13509 AL591424.1-201ENST00000442569 1213 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
TUBB3Q13509 AC136632.2-201ENST00000512891 861 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
TUBB3Q13509 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TUBB3Q13509 GLI4-207ENST00000521682 1082 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TUBB3Q13509 UNC93B6-202ENST00000528242 690 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
TUBB3Q13509 AC092865.5-201ENST00000545435 363 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
TUBB3Q13509 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TUBB3Q13509 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TUBB3Q13509 AC140113.2-201ENST00000604370 208 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
TUBB3Q13509 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TUBB3Q13509 HMGN3-203ENST00000620514 1010 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TUBB3Q13509 PGM5P2-202ENST00000637225 1043 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
TUBB3Q13509 ADORA1-209ENST00000640524 653 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TUBB3Q13509 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TUBB3Q13509 PPP1R21-202ENST00000294952 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TUBB3Q13509 CDC25C-207ENST00000513970 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TUBB3Q13509 CTSD-213ENST00000637915 1982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TUBB3Q13509 TCP10-201ENST00000366827 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TUBB3Q13509 TPD52L2-201ENST00000217121 2362 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.26
TUBB3Q13509 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
TUBB3Q13509 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
TUBB3Q13509 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TUBB3Q13509 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TUBB3Q13509 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TUBB3Q13509 ARHGEF28-211ENST00000512883 2936 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TUBB3Q13509 ZNF799-201ENST00000419318 3036 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TUBB3Q13509 CRY1-201ENST00000008527 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TUBB3Q13509 UBR3-201ENST00000272793 8005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TUBB3Q13509 ZMIZ1-205ENST00000611351 2196 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TUBB3Q13509 MGME1-201ENST00000377704 1781 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TUBB3Q13509 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TUBB3Q13509 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TUBB3Q13509 WDR90-209ENST00000547944 1672 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TUBB3Q13509 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TUBB3Q13509 CSNK2A1-203ENST00000400217 1451 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TUBB3Q13509 ADD1-201ENST00000264758 4045 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TUBB3Q13509 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TUBB3Q13509 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TUBB3Q13509 AQP12A-201ENST00000337801 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TUBB3Q13509 GSTZ1-202ENST00000349555 867 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TUBB3Q13509 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TUBB3Q13509 GYG2P1-204ENST00000382966 639 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TUBB3Q13509 LBH-204ENST00000406087 559 ntTSL 4 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TUBB3Q13509 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
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TUBB3Q13509 AC091182.1-202ENST00000518765 713 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
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TUBB3Q13509 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
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TUBB3Q13509 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TUBB3Q13509 AC107896.1-201ENST00000593212 548 ntTSL 4 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TUBB3Q13509 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TUBB3Q13509 FAM197Y3-203ENST00000618346 717 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
TUBB3Q13509 NSUN2-201ENST00000264670 3303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TUBB3Q13509 PSME3-202ENST00000441946 2944 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TUBB3Q13509 CDKN2AIP-203ENST00000504169 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TUBB3Q13509 RUFY2-205ENST00000454950 2613 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TUBB3Q13509 RASA4-204ENST00000462172 2634 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
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TUBB3Q13509 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TUBB3Q13509 KLHL36-204ENST00000564996 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TUBB3Q13509 PYCR1-201ENST00000329875 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TUBB3Q13509 LSP1-204ENST00000406638 2640 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TUBB3Q13509 BTN3A1-204ENST00000425234 1882 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TUBB3Q13509 GIT2-220ENST00000553118 2424 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TUBB3Q13509 QRICH1-201ENST00000357496 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TUBB3Q13509 ATP2B1-AS1-201ENST00000605386 3632 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
TUBB3Q13509 MTHFR-217ENST00000641820 1569 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
TUBB3Q13509 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TUBB3Q13509 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TUBB3Q13509 HFE2-204ENST00000475797 1381 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TUBB3Q13509 CORO6-202ENST00000388767 2397 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TUBB3Q13509 NR2C1-203ENST00000393101 1822 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TUBB3Q13509 CDH15-201ENST00000289746 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TUBB3Q13509 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TUBB3Q13509 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TUBB3Q13509 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TUBB3Q13509 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TUBB3Q13509 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TUBB3Q13509 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TUBB3Q13509 BX842568.4-201ENST00000421222 227 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
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