Protein–RNA interactions for Protein: Q12996

CSTF3, Cleavage stimulation factor subunit 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 717 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSTF3Q12996 HNRNPA0-201ENST00000314940 8726 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CSTF3Q12996 ZC3H12A-201ENST00000373087 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CSTF3Q12996 PTPN5-202ENST00000396166 2299 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CSTF3Q12996 ATG5-210ENST00000636437 2261 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CSTF3Q12996 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CSTF3Q12996 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CSTF3Q12996 NAT9-210ENST00000580301 1860 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CSTF3Q12996 KRT15-201ENST00000254043 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CSTF3Q12996 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CSTF3Q12996 WDR90-209ENST00000547944 1672 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CSTF3Q12996 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
CSTF3Q12996 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CSTF3Q12996 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CSTF3Q12996 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CSTF3Q12996 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CSTF3Q12996 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CSTF3Q12996 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CSTF3Q12996 C9orf147-204ENST00000463223 863 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CSTF3Q12996 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
CSTF3Q12996 ZFPM1-204ENST00000563351 808 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CSTF3Q12996 PNMT-203ENST00000581428 677 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CSTF3Q12996 SMIM22-210ENST00000615471 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CSTF3Q12996 AC107918.4-202ENST00000641623 219 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
CSTF3Q12996 SLC4A5-203ENST00000377632 3123 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CSTF3Q12996 TMC5-202ENST00000381414 4755 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CSTF3Q12996 KIF3A-202ENST00000378746 6325 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CSTF3Q12996 ARL14EP-201ENST00000282032 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CSTF3Q12996 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CSTF3Q12996 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CSTF3Q12996 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CSTF3Q12996 GABARAPL1-205ENST00000539170 1700 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CSTF3Q12996 PI4KAP1-204ENST00000612579 1703 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
CSTF3Q12996 SIK3-201ENST00000375300 6213 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CSTF3Q12996 AC091980.2-201ENST00000619056 2775 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CSTF3Q12996 GLMP-201ENST00000362007 1604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CSTF3Q12996 GLS2-216ENST00000610413 2296 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CSTF3Q12996 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CSTF3Q12996 PLPPR4-203ENST00000457765 4846 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CSTF3Q12996 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CSTF3Q12996 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CSTF3Q12996 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CSTF3Q12996 UHMK1-202ENST00000489294 8478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CSTF3Q12996 SULT1A2-204ENST00000533150 1991 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CSTF3Q12996 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CSTF3Q12996 CUX1-213ENST00000549414 4452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CSTF3Q12996 GNB4-201ENST00000232564 6434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CSTF3Q12996 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CSTF3Q12996 AC046158.3-201ENST00000624947 2558 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
CSTF3Q12996 PHGDH-223ENST00000641597 2585 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CSTF3Q12996 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CSTF3Q12996 SUSD4-202ENST00000343846 3480 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CSTF3Q12996 PIGT-221ENST00000638594 1835 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CSTF3Q12996 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CSTF3Q12996 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CSTF3Q12996 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CSTF3Q12996 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CSTF3Q12996 AC091167.2-201ENST00000579581 588 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
CSTF3Q12996 KLK6-204ENST00000594641 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CSTF3Q12996 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
CSTF3Q12996 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
CSTF3Q12996 REXO1L3P-201ENST00000622202 1288 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
CSTF3Q12996 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CSTF3Q12996 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CSTF3Q12996 UNC119B-201ENST00000344651 4404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CSTF3Q12996 USP45-201ENST00000327681 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CSTF3Q12996 SHISA6-204ENST00000441885 7575 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CSTF3Q12996 BCAT2-209ENST00000599246 1449 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CSTF3Q12996 PPEF2-207ENST00000621010 1797 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CSTF3Q12996 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CSTF3Q12996 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CSTF3Q12996 ISCU-205ENST00000535729 1330 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CSTF3Q12996 BICD1-205ENST00000550207 1328 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CSTF3Q12996 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CSTF3Q12996 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CSTF3Q12996 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CSTF3Q12996 EIF4G1-202ENST00000346169 5516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CSTF3Q12996 YPEL3-203ENST00000562641 1941 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CSTF3Q12996 AC006504.4-201ENST00000592118 1568 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
CSTF3Q12996 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CSTF3Q12996 ADRA1A-204ENST00000380573 2548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CSTF3Q12996 RCOR3-204ENST00000452621 1827 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CSTF3Q12996 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CSTF3Q12996 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CSTF3Q12996 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CSTF3Q12996 ELAC2-203ENST00000426905 2671 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CSTF3Q12996 VEPH1-218ENST00000494677 1714 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CSTF3Q12996 TMEM19-201ENST00000266673 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CSTF3Q12996 LRP10-201ENST00000359591 6886 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CSTF3Q12996 UBE3A-227ENST00000638011 8742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CSTF3Q12996 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CSTF3Q12996 SLC38A11-202ENST00000409058 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CSTF3Q12996 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CSTF3Q12996 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CSTF3Q12996 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CSTF3Q12996 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CSTF3Q12996 AC087386.1-201ENST00000553658 572 ntTSL 4 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CSTF3Q12996 AL121820.2-201ENST00000556301 279 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CSTF3Q12996 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CSTF3Q12996 MPDU1-223ENST00000582151 728 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
CSTF3Q12996 CYGB-205ENST00000590175 830 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
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