Protein–RNA interactions for Protein: Q09472

EP300, Histone acetyltransferase p300, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 2,414 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EP300Q09472 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
EP300Q09472 KRTAP19-3-201ENST00000334063 522 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.17
EP300Q09472 AL669831.5-201ENST00000434264 844 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
EP300Q09472 AC099552.3-201ENST00000454149 367 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.17
EP300Q09472 MAX-210ENST00000555419 765 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
EP300Q09472 RARRES2P5-201ENST00000564013 466 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
EP300Q09472 MIR5572-201ENST00000583188 137 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
EP300Q09472 AC025048.3-201ENST00000590609 569 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
EP300Q09472 AC021097.1-201ENST00000607902 574 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
EP300Q09472 CR381653.1-201ENST00000622961 812 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.17
EP300Q09472 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
EP300Q09472 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
EP300Q09472 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
EP300Q09472 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
EP300Q09472 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
EP300Q09472 HEBP1-201ENST00000014930 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
EP300Q09472 IFITM5-201ENST00000382614 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
EP300Q09472 AL121983.1-201ENST00000424181 335 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
EP300Q09472 STARD13-205ENST00000439831 945 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
EP300Q09472 RN7SL769P-201ENST00000469386 295 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
EP300Q09472 TMEM198B-204ENST00000484016 896 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
EP300Q09472 AC080188.2-201ENST00000508985 552 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
EP300Q09472 AC084859.1-201ENST00000533002 670 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
EP300Q09472 LINC01595-201ENST00000555406 639 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
EP300Q09472 TPTE2P2-205ENST00000606711 505 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
EP300Q09472 AC091271.1-201ENST00000611877 1162 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
EP300Q09472 ACY1-212ENST00000635797 1294 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
EP300Q09472 LINC00854-216ENST00000636331 718 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
EP300Q09472 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
EP300Q09472 ARPC5-201ENST00000294742 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
EP300Q09472 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
EP300Q09472 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
EP300Q09472 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
EP300Q09472 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
EP300Q09472 SPIN2A-201ENST00000374906 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
EP300Q09472 AGRP-201ENST00000290953 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
EP300Q09472 RHCE-205ENST00000349438 1235 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
EP300Q09472 HOXC-AS3-201ENST00000509870 544 ntTSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
EP300Q09472 TP53AIP1-205ENST00000531399 806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
EP300Q09472 AP001453.3-201ENST00000545800 853 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
EP300Q09472 HAUS2-207ENST00000568846 709 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
EP300Q09472 MIR5189-201ENST00000577370 114 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
EP300Q09472 MIR3619-201ENST00000579667 83 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
EP300Q09472 AC011476.2-201ENST00000585492 1271 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
EP300Q09472 SCGB1C2-201ENST00000595228 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
EP300Q09472 RPL23AP53-203ENST00000606975 736 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
EP300Q09472 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
EP300Q09472 TUBBP5-201ENST00000290377 1563 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
EP300Q09472 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
EP300Q09472 AMT-232ENST00000636199 1546 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
EP300Q09472 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
EP300Q09472 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
EP300Q09472 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
EP300Q09472 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
EP300Q09472 RANBP3-201ENST00000034275 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
EP300Q09472 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
EP300Q09472 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
EP300Q09472 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
EP300Q09472 PSMD8-209ENST00000602911 1330 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
EP300Q09472 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
EP300Q09472 CCDC84-201ENST00000334418 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
EP300Q09472 TMEM243-202ENST00000423734 601 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
EP300Q09472 TDH-203ENST00000531764 1110 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
EP300Q09472 AC025810.1-201ENST00000569986 981 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
EP300Q09472 AP002360.2-202ENST00000572035 738 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
EP300Q09472 KXD1-204ENST00000595073 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
EP300Q09472 AC004597.1-201ENST00000595525 561 ntTSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
EP300Q09472 CU634019.7-201ENST00000624153 1185 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
EP300Q09472 FP236241.2-201ENST00000624906 1185 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
EP300Q09472 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
EP300Q09472 CLCNKB-204ENST00000619181 1544 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
EP300Q09472 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
EP300Q09472 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
EP300Q09472 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
EP300Q09472 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
EP300Q09472 FDFT1-202ENST00000443614 1393 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
EP300Q09472 AC100830.1-201ENST00000560387 1609 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
EP300Q09472 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
EP300Q09472 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
EP300Q09472 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
EP300Q09472 WDR53-204ENST00000433160 887 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
EP300Q09472 IL32-211ENST00000525643 1272 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
EP300Q09472 IL32-213ENST00000528163 950 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
EP300Q09472 TMEM5-AS1-201ENST00000546214 563 ntTSL 4 BASIC16.06■□□□□ 0.16
EP300Q09472 AC138207.8-201ENST00000579692 739 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
EP300Q09472 C19orf38-203ENST00000592854 1060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
EP300Q09472 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
EP300Q09472 CXCL6-201ENST00000226317 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
EP300Q09472 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
EP300Q09472 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
EP300Q09472 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
EP300Q09472 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
EP300Q09472 PNMA3-202ENST00000593810 1432 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
EP300Q09472 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
EP300Q09472 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
EP300Q09472 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
EP300Q09472 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
EP300Q09472 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
EP300Q09472 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
EP300Q09472 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 87.1 ms