Protein–RNA interactions for Protein: Q04323

UBXN1, UBX domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 297 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN1Q04323 NAA30-204ENST00000556492 7644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
UBXN1Q04323 COQ8B-202ENST00000324464 2443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
UBXN1Q04323 CIAPIN1-209ENST00000567518 2016 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
UBXN1Q04323 SLC30A1-201ENST00000367001 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
UBXN1Q04323 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
UBXN1Q04323 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
UBXN1Q04323 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
UBXN1Q04323 LINC01972-201ENST00000422271 553 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
UBXN1Q04323 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC18.39■□□□□ 0.53
UBXN1Q04323 SIGLEC10-205ENST00000439889 2126 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
UBXN1Q04323 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
UBXN1Q04323 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
UBXN1Q04323 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
UBXN1Q04323 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
UBXN1Q04323 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
UBXN1Q04323 TMEM265-201ENST00000615541 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
UBXN1Q04323 TBC1D3D-201ENST00000616101 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
UBXN1Q04323 TBC1D3K-201ENST00000620247 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
UBXN1Q04323 KCNJ12-201ENST00000331718 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
UBXN1Q04323 JPH4-202ENST00000397118 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
UBXN1Q04323 MGRN1-201ENST00000262370 3968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
UBXN1Q04323 ZP3-204ENST00000416245 1846 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
UBXN1Q04323 TOP3BP1-201ENST00000420768 1380 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
UBXN1Q04323 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
UBXN1Q04323 ZNF425-201ENST00000378061 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
UBXN1Q04323 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
UBXN1Q04323 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
UBXN1Q04323 INPP4A-202ENST00000409016 9996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
UBXN1Q04323 CYP4F22-202ENST00000601005 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
UBXN1Q04323 PRRT2-205ENST00000567659 1470 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
UBXN1Q04323 TGIF1-201ENST00000330513 1980 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
UBXN1Q04323 TMEM25-202ENST00000354064 1965 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
UBXN1Q04323 TPT1-AS1-215ENST00000522673 1519 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
UBXN1Q04323 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
UBXN1Q04323 MDGA1-203ENST00000434837 10736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
UBXN1Q04323 SLC6A9-204ENST00000372307 2162 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
UBXN1Q04323 BTC-201ENST00000395743 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
UBXN1Q04323 FAM109A-203ENST00000547838 2846 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC18.38■□□□□ 0.53
UBXN1Q04323 PGR-209ENST00000617858 2816 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
UBXN1Q04323 TMEM132D-202ENST00000422113 5776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
UBXN1Q04323 GLUL-201ENST00000311223 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
UBXN1Q04323 SEC14L4-201ENST00000255858 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
UBXN1Q04323 CBSL-201ENST00000398168 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
UBXN1Q04323 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
UBXN1Q04323 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
UBXN1Q04323 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
UBXN1Q04323 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
UBXN1Q04323 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
UBXN1Q04323 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
UBXN1Q04323 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
UBXN1Q04323 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
UBXN1Q04323 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
UBXN1Q04323 NUTM2F-201ENST00000253262 2561 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
UBXN1Q04323 CARS-203ENST00000397111 2685 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
UBXN1Q04323 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
UBXN1Q04323 PDZRN3-201ENST00000263666 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
UBXN1Q04323 ORMDL3-201ENST00000304046 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
UBXN1Q04323 SPATS2L-202ENST00000360760 2119 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
UBXN1Q04323 TRIM24-202ENST00000415680 3799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
UBXN1Q04323 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
UBXN1Q04323 ZMYM3-202ENST00000373978 1511 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
UBXN1Q04323 RTL6-201ENST00000341255 5495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
UBXN1Q04323 ADGRA1-AS1-201ENST00000366099 3236 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
UBXN1Q04323 APLN-201ENST00000429967 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
UBXN1Q04323 AP001372.2-201ENST00000526036 2493 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
UBXN1Q04323 PNMA6E-202ENST00000633844 2596 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
UBXN1Q04323 MON2-213ENST00000552738 5543 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
UBXN1Q04323 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
UBXN1Q04323 GPS1-202ENST00000320548 1949 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
UBXN1Q04323 SYT6-201ENST00000369547 4369 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
UBXN1Q04323 SHANK1-204ENST00000391814 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
UBXN1Q04323 TXNRD2-214ENST00000491939 2238 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
UBXN1Q04323 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
UBXN1Q04323 FEM1C-201ENST00000274457 5816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
UBXN1Q04323 GABRB3-215ENST00000622697 5876 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
UBXN1Q04323 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
UBXN1Q04323 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
UBXN1Q04323 ITGB1BP1-205ENST00000456913 1043 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
UBXN1Q04323 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
UBXN1Q04323 ITGB1BP1-216ENST00000488451 874 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
UBXN1Q04323 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
UBXN1Q04323 ABHD10-201ENST00000273359 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
UBXN1Q04323 LINC01215-201ENST00000607746 2592 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
UBXN1Q04323 ARVCF-204ENST00000406522 2682 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
UBXN1Q04323 PLPPR2-201ENST00000251473 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
UBXN1Q04323 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
UBXN1Q04323 ZFP1-208ENST00000568079 1426 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
UBXN1Q04323 BCAT2-209ENST00000599246 1449 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
UBXN1Q04323 FBLN1-202ENST00000327858 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
UBXN1Q04323 GGT3P-204ENST00000453783 1664 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
UBXN1Q04323 LMNA-202ENST00000361308 1713 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
UBXN1Q04323 PEG3-206ENST00000598410 5304 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
UBXN1Q04323 STC2-201ENST00000265087 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
UBXN1Q04323 DYRK1B-205ENST00000597639 1806 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
UBXN1Q04323 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
UBXN1Q04323 IL11-201ENST00000264563 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
UBXN1Q04323 SLC27A5-201ENST00000263093 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
UBXN1Q04323 RAI2-206ENST00000545871 2421 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.37■□□□□ 0.53
UBXN1Q04323 KRT76-201ENST00000332411 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
UBXN1Q04323 CACFD1-202ENST00000316948 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.7 ms