Protein–RNA interactions for Protein: Q02556

IRF8, Interferon regulatory factor 8, humanhuman

Predictions only

Length 426 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRF8Q02556 ELN-206ENST00000380553 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
IRF8Q02556 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
IRF8Q02556 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
IRF8Q02556 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
IRF8Q02556 HLA-F-218ENST00000376861 1544 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
IRF8Q02556 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
IRF8Q02556 FAM156B-207ENST00000616419 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
IRF8Q02556 FAM156A-212ENST00000617970 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
IRF8Q02556 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
IRF8Q02556 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
IRF8Q02556 WDR90-209ENST00000547944 1672 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
IRF8Q02556 ELAC2-203ENST00000426905 2671 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
IRF8Q02556 PDHX-203ENST00000448838 2653 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
IRF8Q02556 STK35-201ENST00000381482 6685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
IRF8Q02556 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
IRF8Q02556 MOB3B-201ENST00000262244 6454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
IRF8Q02556 CFAP45-201ENST00000368099 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
IRF8Q02556 PLPPR5-202ENST00000370188 4139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
IRF8Q02556 HMGXB3-202ENST00000503427 5275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
IRF8Q02556 AL353732.1-201ENST00000569618 1459 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
IRF8Q02556 SYT6-201ENST00000369547 4369 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
IRF8Q02556 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
IRF8Q02556 MON2-201ENST00000393629 5612 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
IRF8Q02556 MRPL20P1-201ENST00000400819 433 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
IRF8Q02556 ODF3B-204ENST00000405135 917 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
IRF8Q02556 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
IRF8Q02556 ARPC4-203ENST00000433034 926 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
IRF8Q02556 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
IRF8Q02556 AC092910.1-201ENST00000482027 1129 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
IRF8Q02556 AC107918.2-201ENST00000530817 355 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
IRF8Q02556 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
IRF8Q02556 NAA60-217ENST00000572942 1089 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
IRF8Q02556 MIR4492-201ENST00000581627 80 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
IRF8Q02556 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
IRF8Q02556 PPP1R26-202ENST00000401470 4769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
IRF8Q02556 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
IRF8Q02556 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
IRF8Q02556 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
IRF8Q02556 FMNL1-201ENST00000328118 2330 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
IRF8Q02556 SLC2A6-201ENST00000371897 2301 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
IRF8Q02556 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
IRF8Q02556 RGPD8-201ENST00000302558 5576 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
IRF8Q02556 ZNF346-202ENST00000503039 2774 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
IRF8Q02556 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
IRF8Q02556 PIGT-221ENST00000638594 1835 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
IRF8Q02556 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
IRF8Q02556 HLA-F-216ENST00000259951 1635 ntAPPRIS P4 BASIC16.23■□□□□ 0.19
IRF8Q02556 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
IRF8Q02556 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
IRF8Q02556 SUSD4-202ENST00000343846 3480 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
IRF8Q02556 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
IRF8Q02556 PRMT2-208ENST00000451211 1878 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
IRF8Q02556 AC119396.1-201ENST00000576789 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
IRF8Q02556 IQCE-212ENST00000476665 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
IRF8Q02556 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
IRF8Q02556 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
IRF8Q02556 AL021453.1-201ENST00000333487 2989 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
IRF8Q02556 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
IRF8Q02556 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
IRF8Q02556 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
IRF8Q02556 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
IRF8Q02556 AC091180.3-201ENST00000506504 963 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
IRF8Q02556 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
IRF8Q02556 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
IRF8Q02556 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC16.23■□□□□ 0.19
IRF8Q02556 L2HGDH-206ENST00000555610 804 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
IRF8Q02556 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
IRF8Q02556 AC013565.3-202ENST00000570120 460 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
IRF8Q02556 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
IRF8Q02556 ZEB1-AS1-209ENST00000607455 559 ntTSL 4 BASIC16.23■□□□□ 0.19
IRF8Q02556 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
IRF8Q02556 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
IRF8Q02556 BSG-214ENST00000614867 960 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
IRF8Q02556 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
IRF8Q02556 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
IRF8Q02556 VAV2-201ENST00000371850 4837 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
IRF8Q02556 PPP6R1-201ENST00000412770 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
IRF8Q02556 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
IRF8Q02556 GLMP-201ENST00000362007 1604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
IRF8Q02556 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
IRF8Q02556 PEA15-202ENST00000368076 2694 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
IRF8Q02556 MEX3A-202ENST00000532414 6124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
IRF8Q02556 EPHA8-201ENST00000166244 4943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
IRF8Q02556 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
IRF8Q02556 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
IRF8Q02556 FMNL3-202ENST00000352151 4006 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
IRF8Q02556 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
IRF8Q02556 PANX2-201ENST00000159647 2964 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
IRF8Q02556 BRIX1-201ENST00000336767 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
IRF8Q02556 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
IRF8Q02556 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
IRF8Q02556 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
IRF8Q02556 SLC4A1APP2-201ENST00000424054 1259 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
IRF8Q02556 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
IRF8Q02556 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
IRF8Q02556 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
IRF8Q02556 AC108073.2-201ENST00000464002 357 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
IRF8Q02556 AC093909.1-201ENST00000504731 1122 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
IRF8Q02556 MRPL52-208ENST00000553711 586 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
IRF8Q02556 AC005412.3-201ENST00000580309 715 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.1 ms