Protein–RNA interactions for Protein: P59044

NLRP6, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 892 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NLRP6P59044 PRRG2-201ENST00000246794 1404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
NLRP6P59044 TMEM120A-201ENST00000417509 1444 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
NLRP6P59044 HFE2-205ENST00000497365 1419 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NLRP6P59044 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NLRP6P59044 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
NLRP6P59044 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NLRP6P59044 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NLRP6P59044 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
NLRP6P59044 OR52W1-201ENST00000311352 1114 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
NLRP6P59044 PQLC2L-201ENST00000312275 1201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NLRP6P59044 CIDEA-201ENST00000320477 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NLRP6P59044 IDH3B-202ENST00000380851 1230 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NLRP6P59044 SYNGR1-205ENST00000406293 564 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
NLRP6P59044 ARSEP1-201ENST00000420443 635 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
NLRP6P59044 AL512361.1-201ENST00000554200 418 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
NLRP6P59044 MRPL52-211ENST00000555536 451 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
NLRP6P59044 AC004790.1-201ENST00000612686 536 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
NLRP6P59044 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NLRP6P59044 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
NLRP6P59044 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NLRP6P59044 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
NLRP6P59044 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NLRP6P59044 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NLRP6P59044 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NLRP6P59044 ACOT7-204ENST00000377855 1614 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NLRP6P59044 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NLRP6P59044 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NLRP6P59044 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NLRP6P59044 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
NLRP6P59044 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NLRP6P59044 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NLRP6P59044 MFNG-201ENST00000356998 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NLRP6P59044 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
NLRP6P59044 RBM4-204ENST00000408993 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
NLRP6P59044 TDH-201ENST00000525246 1357 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NLRP6P59044 EBI3-201ENST00000221847 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NLRP6P59044 NDUFA2-201ENST00000252102 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NLRP6P59044 ACTA1-201ENST00000366683 1122 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
NLRP6P59044 AC010336.2-201ENST00000564226 506 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
NLRP6P59044 AC239798.4-201ENST00000609879 700 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
NLRP6P59044 CREB3L2-208ENST00000620715 1053 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
NLRP6P59044 AL031056.2-201ENST00000637957 1217 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
NLRP6P59044 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
NLRP6P59044 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NLRP6P59044 CXCL6-201ENST00000226317 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NLRP6P59044 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NLRP6P59044 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NLRP6P59044 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
NLRP6P59044 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NLRP6P59044 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
NLRP6P59044 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NLRP6P59044 ACSL6-201ENST00000296869 2561 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
NLRP6P59044 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NLRP6P59044 MYOD1-201ENST00000250003 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NLRP6P59044 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NLRP6P59044 CMA1-201ENST00000206446 633 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NLRP6P59044 AC098614.1-201ENST00000368528 745 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
NLRP6P59044 AGER-204ENST00000375067 1250 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NLRP6P59044 AC007388.1-210ENST00000415640 458 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
NLRP6P59044 DFFBP1-201ENST00000433250 979 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
NLRP6P59044 AL669831.5-201ENST00000434264 844 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
NLRP6P59044 ATP5G2P4-201ENST00000442175 420 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
NLRP6P59044 MRPL36-204ENST00000508987 686 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
NLRP6P59044 IFITM2-204ENST00000533141 588 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.3■■□□□ 1.16
NLRP6P59044 AC091544.3-201ENST00000556424 531 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
NLRP6P59044 MIR6752-201ENST00000618442 71 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
NLRP6P59044 AL132857.2-201ENST00000634305 1737 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
NLRP6P59044 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NLRP6P59044 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NLRP6P59044 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NLRP6P59044 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
NLRP6P59044 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NLRP6P59044 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
NLRP6P59044 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NLRP6P59044 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NLRP6P59044 MAPT-215ENST00000574436 1326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
NLRP6P59044 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NLRP6P59044 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NLRP6P59044 OTUB1-206ENST00000535715 1391 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
NLRP6P59044 HIST1H4J-201ENST00000355057 373 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
NLRP6P59044 RASL12-203ENST00000434605 982 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
NLRP6P59044 AC099552.3-201ENST00000454149 367 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
NLRP6P59044 RN7SL618P-201ENST00000477850 296 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
NLRP6P59044 AL161757.4-201ENST00000554149 621 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
NLRP6P59044 AC044860.1-202ENST00000559481 777 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
NLRP6P59044 AC007216.4-201ENST00000574364 562 ntTSL 4 BASIC22.29■■□□□ 1.16
NLRP6P59044 SDCBP2-202ENST00000360779 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NLRP6P59044 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
NLRP6P59044 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NLRP6P59044 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
NLRP6P59044 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NLRP6P59044 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NLRP6P59044 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NLRP6P59044 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NLRP6P59044 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NLRP6P59044 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NLRP6P59044 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
NLRP6P59044 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NLRP6P59044 ETV2-205ENST00000479824 1342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NLRP6P59044 VASH1-203ENST00000554237 1462 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.1 ms