Protein–RNA interactions for Protein: P58512

LINC01547, Uncharacterized protein encoded by LINC01547, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 204 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC01547P58512 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
LINC01547P58512 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
LINC01547P58512 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
LINC01547P58512 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
LINC01547P58512 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
LINC01547P58512 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
LINC01547P58512 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
LINC01547P58512 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
LINC01547P58512 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
LINC01547P58512 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
LINC01547P58512 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
LINC01547P58512 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
LINC01547P58512 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
LINC01547P58512 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
LINC01547P58512 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
LINC01547P58512 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
LINC01547P58512 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
LINC01547P58512 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
LINC01547P58512 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
LINC01547P58512 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
LINC01547P58512 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
LINC01547P58512 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
LINC01547P58512 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
LINC01547P58512 IRF4-201ENST00000380956 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
LINC01547P58512 CAAP1-201ENST00000333916 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
LINC01547P58512 TMPRSS4-201ENST00000437212 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
LINC01547P58512 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
LINC01547P58512 ERG28-201ENST00000256319 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
LINC01547P58512 LINGO1-201ENST00000355300 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
LINC01547P58512 DNM1-208ENST00000486160 3181 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
LINC01547P58512 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
LINC01547P58512 GPD1L-201ENST00000282541 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
LINC01547P58512 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
LINC01547P58512 AP1AR-201ENST00000274000 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
LINC01547P58512 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
LINC01547P58512 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
LINC01547P58512 UBE2J1-201ENST00000435041 4290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
LINC01547P58512 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
LINC01547P58512 ZNF280D-207ENST00000559237 4902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
LINC01547P58512 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
LINC01547P58512 AC006058.4-201ENST00000624016 1670 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
LINC01547P58512 AC104836.1-202ENST00000636805 6041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
LINC01547P58512 PDE8B-204ENST00000342343 2677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
LINC01547P58512 AC092364.2-201ENST00000596710 2692 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
LINC01547P58512 CASP2-201ENST00000310447 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
LINC01547P58512 MAP3K12-201ENST00000267079 4319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
LINC01547P58512 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
LINC01547P58512 EPB41L3-206ENST00000544123 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
LINC01547P58512 FADS1-201ENST00000350997 4525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
LINC01547P58512 ZNF302-207ENST00000505365 2955 ntTSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
LINC01547P58512 VARS2-201ENST00000321897 4073 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
LINC01547P58512 LIMS2-205ENST00000409455 2500 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
LINC01547P58512 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
LINC01547P58512 SLC17A5-201ENST00000355773 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
LINC01547P58512 CLASP2-204ENST00000399362 7282 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
LINC01547P58512 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
LINC01547P58512 ARL10-201ENST00000310389 10845 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
LINC01547P58512 SYT5-201ENST00000354308 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
LINC01547P58512 SOGA3-201ENST00000465909 3756 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
LINC01547P58512 WDR33-201ENST00000322313 9471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
LINC01547P58512 STK17B-201ENST00000263955 5287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
LINC01547P58512 WT1-203ENST00000379079 2466 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
LINC01547P58512 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
LINC01547P58512 AIFM2-202ENST00000373248 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
LINC01547P58512 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
LINC01547P58512 CICP13-201ENST00000422015 2789 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
LINC01547P58512 RGS3-210ENST00000462143 2759 ntTSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
LINC01547P58512 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
LINC01547P58512 AHCY-201ENST00000217426 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
LINC01547P58512 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
LINC01547P58512 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
LINC01547P58512 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
LINC01547P58512 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
LINC01547P58512 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
LINC01547P58512 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
LINC01547P58512 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
LINC01547P58512 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
LINC01547P58512 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
LINC01547P58512 TRA2B-205ENST00000453386 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
LINC01547P58512 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
LINC01547P58512 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
LINC01547P58512 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
LINC01547P58512 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
LINC01547P58512 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
LINC01547P58512 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
LINC01547P58512 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
LINC01547P58512 FOXN1-203ENST00000579795 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
LINC01547P58512 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
LINC01547P58512 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
LINC01547P58512 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
LINC01547P58512 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
LINC01547P58512 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
LINC01547P58512 ATP5F1-202ENST00000369722 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
LINC01547P58512 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
LINC01547P58512 PAPOLA-223ENST00000557320 3264 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
LINC01547P58512 COL11A2-203ENST00000374708 6209 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
LINC01547P58512 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
LINC01547P58512 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
LINC01547P58512 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
LINC01547P58512 TTC28-AS1-207ENST00000428584 5859 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 77.2 ms