Protein–RNA interactions for Protein: P56817

BACE1, Beta-secretase 1, humanhuman

Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BACE1P56817 OR52W1-201ENST00000311352 1114 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
BACE1P56817 GPHB5-201ENST00000314140 393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
BACE1P56817 WDR45-208ENST00000396681 1146 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
BACE1P56817 AL669831.5-201ENST00000434264 844 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
BACE1P56817 PMF1-BGLAP-203ENST00000490491 1007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
BACE1P56817 AP002008.1-201ENST00000530283 1155 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
BACE1P56817 EEF1AKMT3-204ENST00000551420 836 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
BACE1P56817 RPS19-202ENST00000593863 526 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
BACE1P56817 RNA5-8SN1-201ENST00000610460 153 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
BACE1P56817 RNA5-8SN5-202ENST00000612463 153 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
BACE1P56817 Metazoa_SRP.112-201ENST00000613101 279 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
BACE1P56817 RNA5-8SN4-201ENST00000613359 153 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
BACE1P56817 RNA5-8SN5-201ENST00000619471 153 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
BACE1P56817 SFT2D2-204ENST00000630869 1073 ntTSL 4 BASIC19.13■□□□□ 0.65
BACE1P56817 PRRT3-202ENST00000411976 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
BACE1P56817 AC007541.1-201ENST00000570282 1469 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
BACE1P56817 TEKT2-201ENST00000207457 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
BACE1P56817 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
BACE1P56817 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
BACE1P56817 RAD1-208ENST00000628399 1678 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
BACE1P56817 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
BACE1P56817 AL512652.2-201ENST00000625156 1716 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
BACE1P56817 DYRK1B-205ENST00000597639 1806 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
BACE1P56817 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
BACE1P56817 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
BACE1P56817 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
BACE1P56817 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
BACE1P56817 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
BACE1P56817 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
BACE1P56817 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
BACE1P56817 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
BACE1P56817 MFNG-201ENST00000356998 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
BACE1P56817 SDR16C5-201ENST00000303749 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
BACE1P56817 ATP5S-201ENST00000245448 1671 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
BACE1P56817 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
BACE1P56817 BTBD7P1-201ENST00000447253 1453 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
BACE1P56817 TMEM120A-201ENST00000417509 1444 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
BACE1P56817 DUSP26-203ENST00000523956 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
BACE1P56817 NPM2-201ENST00000289820 1100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
BACE1P56817 TOMM5-201ENST00000321301 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
BACE1P56817 ZUFSP-201ENST00000368573 1225 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
BACE1P56817 C1QC-202ENST00000374639 1183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
BACE1P56817 MAP9-202ENST00000379248 1165 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
BACE1P56817 NPM2-202ENST00000381530 925 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
BACE1P56817 RBM39-205ENST00000397370 612 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
BACE1P56817 AL353779.1-201ENST00000434793 351 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
BACE1P56817 AC093724.1-201ENST00000448659 1027 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
BACE1P56817 MEIS3P1-201ENST00000495167 958 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
BACE1P56817 API5-211ENST00000534695 560 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
BACE1P56817 OBP2A-206ENST00000539850 914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
BACE1P56817 PPP1R14A-203ENST00000587515 607 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
BACE1P56817 AL132655.2-201ENST00000596276 594 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
BACE1P56817 BARD1-209ENST00000613192 703 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
BACE1P56817 AL136531.2-202ENST00000617804 573 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.12■□□□□ 0.65
BACE1P56817 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
BACE1P56817 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
BACE1P56817 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
BACE1P56817 CXCL6-201ENST00000226317 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
BACE1P56817 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
BACE1P56817 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
BACE1P56817 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
BACE1P56817 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
BACE1P56817 CU639417.3-201ENST00000624240 1404 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
BACE1P56817 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
BACE1P56817 CCDC84-201ENST00000334418 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
BACE1P56817 DLX2-AS1-201ENST00000448117 950 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
BACE1P56817 AC099552.3-201ENST00000454149 367 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
BACE1P56817 AC136475.3-203ENST00000525217 617 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
BACE1P56817 AC135586.1-201ENST00000539323 574 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
BACE1P56817 TMEM5-AS1-201ENST00000546214 563 ntTSL 4 BASIC19.11■□□□□ 0.65
BACE1P56817 SLC8B1-206ENST00000549069 1058 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
BACE1P56817 MRPS23-202ENST00000578444 580 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
BACE1P56817 AC138474.1-201ENST00000586630 523 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
BACE1P56817 AL355974.2-201ENST00000614099 556 ntTSL 4 BASIC19.11■□□□□ 0.65
BACE1P56817 AL355974.2-202ENST00000617298 936 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
BACE1P56817 AC090164.4-201ENST00000632451 313 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
BACE1P56817 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
BACE1P56817 TMEM25-202ENST00000354064 1965 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
BACE1P56817 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
BACE1P56817 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
BACE1P56817 KAT7-213ENST00000510819 1769 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
BACE1P56817 PANK2-209ENST00000621507 1763 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
BACE1P56817 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
BACE1P56817 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
BACE1P56817 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
BACE1P56817 FBLIM1-206ENST00000441801 1543 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
BACE1P56817 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
BACE1P56817 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
BACE1P56817 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
BACE1P56817 PHGDH-202ENST00000369409 1882 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
BACE1P56817 SCP2-201ENST00000371509 1889 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
BACE1P56817 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
BACE1P56817 AKR7L-202ENST00000429712 1313 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
BACE1P56817 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
BACE1P56817 C2orf40-201ENST00000238044 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
BACE1P56817 C12orf10-201ENST00000267103 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
BACE1P56817 OR8S1-201ENST00000310194 1080 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
BACE1P56817 VHLL-201ENST00000339922 676 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
BACE1P56817 AL096814.1-202ENST00000372963 647 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
BACE1P56817 ARRB2-203ENST00000381488 1236 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42 ms