Protein–RNA interactions for Protein: P45954

ACADSB, Short/branched chain specific acyl-CoA dehydrogenase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 432 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACADSBP45954 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
ACADSBP45954 AL512625.3-203ENST00000445604 1602 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
ACADSBP45954 NR1H3-204ENST00000407404 1330 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
ACADSBP45954 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ACADSBP45954 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ACADSBP45954 ZFYVE19-203ENST00000355341 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ACADSBP45954 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ACADSBP45954 ESR2-205ENST00000358599 1899 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
ACADSBP45954 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ACADSBP45954 HIST1H3D-201ENST00000356476 411 ntAPPRIS P1 BASIC17.55■□□□□ 0.4
ACADSBP45954 AC092474.2-201ENST00000424288 719 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
ACADSBP45954 AC097532.1-201ENST00000440802 322 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
ACADSBP45954 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
ACADSBP45954 C8orf46-213ENST00000521495 557 ntTSL 4 BASIC17.55■□□□□ 0.4
ACADSBP45954 AC112191.1-201ENST00000523689 701 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
ACADSBP45954 AP002472.1-201ENST00000577490 586 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
ACADSBP45954 CD7-202ENST00000578509 925 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
ACADSBP45954 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ACADSBP45954 AC040963.1-202ENST00000589729 644 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
ACADSBP45954 SDR16C5-201ENST00000303749 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ACADSBP45954 DYRK1B-205ENST00000597639 1806 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
ACADSBP45954 TTC8-216ENST00000614125 2377 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
ACADSBP45954 TULP2-201ENST00000221399 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ACADSBP45954 RBM4-204ENST00000408993 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
ACADSBP45954 PANK2-209ENST00000621507 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ACADSBP45954 SIGLEC7-201ENST00000305628 1469 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ACADSBP45954 AP2A2-222ENST00000534328 1491 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
ACADSBP45954 RGS3-210ENST00000462143 2759 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
ACADSBP45954 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ACADSBP45954 TMEM25-202ENST00000354064 1965 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
ACADSBP45954 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ACADSBP45954 ADAMTS16-201ENST00000274181 4979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
ACADSBP45954 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ACADSBP45954 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
ACADSBP45954 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ACADSBP45954 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ACADSBP45954 NDUFB2-AS1-201ENST00000465466 1648 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
ACADSBP45954 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
ACADSBP45954 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
ACADSBP45954 RAB3IP-202ENST00000362025 2055 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ACADSBP45954 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ACADSBP45954 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ACADSBP45954 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ACADSBP45954 PIGT-207ENST00000543458 2037 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
ACADSBP45954 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ACADSBP45954 HSD17B6-203ENST00000554150 1547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
ACADSBP45954 LYPD5-203ENST00000594013 1519 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
ACADSBP45954 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ACADSBP45954 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ACADSBP45954 CGREF1-201ENST00000260595 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
ACADSBP45954 ANAPC11-201ENST00000344877 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ACADSBP45954 FAM19A5-204ENST00000406880 833 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
ACADSBP45954 SPDYE2-202ENST00000432940 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ACADSBP45954 SPDYE2B-201ENST00000436228 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ACADSBP45954 SPDYE5-201ENST00000455862 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ACADSBP45954 HILS1-201ENST00000504307 1219 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ACADSBP45954 NECAP2-208ENST00000504551 768 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
ACADSBP45954 LINC02123-201ENST00000514869 885 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ACADSBP45954 AC105202.1-202ENST00000522060 834 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
ACADSBP45954 SPCS2-202ENST00000526361 772 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
ACADSBP45954 MVB12A-211ENST00000529939 1091 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
ACADSBP45954 AP000763.4-201ENST00000544674 752 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
ACADSBP45954 ANAPC11-213ENST00000577747 672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
ACADSBP45954 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
ACADSBP45954 AL161645.1-201ENST00000622716 1255 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
ACADSBP45954 AC104581.1-203ENST00000640240 353 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
ACADSBP45954 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ACADSBP45954 PRX-202ENST00000324001 4855 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ACADSBP45954 SLC8A3-203ENST00000357887 5259 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
ACADSBP45954 SLC8A3-204ENST00000381269 5268 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ACADSBP45954 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ACADSBP45954 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ACADSBP45954 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
ACADSBP45954 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ACADSBP45954 AL365277.1-202ENST00000331856 2241 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
ACADSBP45954 BIRC7-201ENST00000217169 1368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ACADSBP45954 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ACADSBP45954 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
ACADSBP45954 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ACADSBP45954 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ACADSBP45954 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ACADSBP45954 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
ACADSBP45954 BHMT2-205ENST00000521567 1537 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
ACADSBP45954 HPCAL1-208ENST00000622018 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
ACADSBP45954 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ACADSBP45954 REEP2-211ENST00000613650 1944 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
ACADSBP45954 AC226118.1-201ENST00000515213 2146 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
ACADSBP45954 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
ACADSBP45954 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ACADSBP45954 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ACADSBP45954 ENOSF1-202ENST00000340116 1658 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
ACADSBP45954 LINC02167-203ENST00000566900 1489 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
ACADSBP45954 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ACADSBP45954 NEK7-201ENST00000367383 586 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
ACADSBP45954 AMACR-204ENST00000382085 1195 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ACADSBP45954 AP000695.1-201ENST00000429588 893 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
ACADSBP45954 SNCA-209ENST00000506244 570 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
ACADSBP45954 ZPBP2-204ENST00000584588 1277 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
ACADSBP45954 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ACADSBP45954 AC087645.4-201ENST00000638890 792 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.9 ms