Protein–RNA interactions for Protein: P42575

CASP2, Caspase-2, humanhuman

Predictions only

Length 452 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP2P42575 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CASP2P42575 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CASP2P42575 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CASP2P42575 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CASP2P42575 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CASP2P42575 STAC-201ENST00000273183 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CASP2P42575 PTGFRN-201ENST00000393203 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CASP2P42575 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CASP2P42575 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CASP2P42575 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CASP2P42575 ZNF276-201ENST00000289816 4589 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CASP2P42575 CHST14-201ENST00000306243 3574 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CASP2P42575 AC046158.3-201ENST00000624947 2558 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
CASP2P42575 MYH11-211ENST00000576790 6272 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CASP2P42575 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CASP2P42575 DAAM2-211ENST00000633794 3871 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CASP2P42575 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CASP2P42575 INPPL1-207ENST00000538751 4656 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CASP2P42575 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CASP2P42575 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CASP2P42575 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CASP2P42575 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CASP2P42575 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CASP2P42575 MROH1-201ENST00000326134 5183 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CASP2P42575 CTNND2-214ENST00000511377 4336 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CASP2P42575 ELAVL3-201ENST00000359227 4729 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CASP2P42575 AC026412.1-202ENST00000512335 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CASP2P42575 MAPK13-203ENST00000373766 6196 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CASP2P42575 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CASP2P42575 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CASP2P42575 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CASP2P42575 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CASP2P42575 MICALL2-201ENST00000297508 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CASP2P42575 AC067930.6-201ENST00000623257 4947 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
CASP2P42575 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CASP2P42575 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CASP2P42575 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CASP2P42575 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CASP2P42575 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
CASP2P42575 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CASP2P42575 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CASP2P42575 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CASP2P42575 AL589182.2-201ENST00000619332 1049 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
CASP2P42575 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CASP2P42575 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CASP2P42575 C2CD4A-201ENST00000355522 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CASP2P42575 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CASP2P42575 TACR3-201ENST00000304883 5190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CASP2P42575 NEDD4-202ENST00000435532 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CASP2P42575 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CASP2P42575 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CASP2P42575 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CASP2P42575 INA-201ENST00000369849 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CASP2P42575 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CASP2P42575 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CASP2P42575 CASP2-201ENST00000310447 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CASP2P42575 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CASP2P42575 KCTD11-201ENST00000333751 2783 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CASP2P42575 ADRA2A-201ENST00000280155 3745 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CASP2P42575 LY6K-205ENST00000522591 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CASP2P42575 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
CASP2P42575 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CASP2P42575 DCAF17-202ENST00000375255 5828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CASP2P42575 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CASP2P42575 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CASP2P42575 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CASP2P42575 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CASP2P42575 EPHA10-203ENST00000427468 3167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CASP2P42575 FAM83C-201ENST00000374408 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CASP2P42575 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CASP2P42575 GOLGA2-213ENST00000610329 2212 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CASP2P42575 C18orf25-203ENST00000615052 5462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CASP2P42575 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CASP2P42575 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
CASP2P42575 FUK-207ENST00000571514 3054 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CASP2P42575 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CASP2P42575 HNRNPA0-201ENST00000314940 8726 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CASP2P42575 DNM2-202ENST00000359692 3588 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CASP2P42575 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CASP2P42575 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CASP2P42575 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
CASP2P42575 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CASP2P42575 ATP6V0E2-AS1-201ENST00000461019 2973 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CASP2P42575 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CASP2P42575 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CASP2P42575 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CASP2P42575 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CASP2P42575 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CASP2P42575 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
CASP2P42575 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
CASP2P42575 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CASP2P42575 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CASP2P42575 GRIN3A-201ENST00000361820 7770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CASP2P42575 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CASP2P42575 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CASP2P42575 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CASP2P42575 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CASP2P42575 BCAR1-206ENST00000535626 2894 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CASP2P42575 CSNK2A1-203ENST00000400217 1451 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CASP2P42575 ZNF346-202ENST00000503039 2774 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.5 ms