Protein–RNA interactions for Protein: P39086

GRIK1, Glutamate receptor ionotropic, kainate 1, humanhuman

Predictions only

Length 918 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK1P39086 ORMDL1-203ENST00000392350 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
GRIK1P39086 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
GRIK1P39086 SH2B1-206ENST00000545570 1488 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
GRIK1P39086 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
GRIK1P39086 CHCHD3-201ENST00000262570 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
GRIK1P39086 CERCAM-213ENST00000612334 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
GRIK1P39086 LINC00895-201ENST00000629028 1637 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
GRIK1P39086 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
GRIK1P39086 PC-204ENST00000524491 1714 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
GRIK1P39086 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
GRIK1P39086 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC17.61■□□□□ 0.41
GRIK1P39086 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
GRIK1P39086 CR392000.2-201ENST00000640235 1994 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
GRIK1P39086 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
GRIK1P39086 WLS-202ENST00000354777 2037 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
GRIK1P39086 BLOC1S2-202ENST00000370372 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
GRIK1P39086 TSEN15P1-201ENST00000423257 515 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
GRIK1P39086 LINC01264-201ENST00000431395 500 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
GRIK1P39086 AL391069.2-202ENST00000447795 622 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
GRIK1P39086 CCND3-213ENST00000510503 1257 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
GRIK1P39086 IGHV3-62-201ENST00000520057 340 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
GRIK1P39086 AC124067.2-201ENST00000521989 510 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
GRIK1P39086 GSTO1-207ENST00000539281 1052 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
GRIK1P39086 SIGLEC29P-201ENST00000599873 1114 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
GRIK1P39086 STXBP2-222ENST00000612033 1188 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
GRIK1P39086 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
GRIK1P39086 TRIP6-209ENST00000619988 1303 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
GRIK1P39086 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
GRIK1P39086 GOLGA6L17P-202ENST00000614358 1398 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
GRIK1P39086 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
GRIK1P39086 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
GRIK1P39086 AC053503.2-201ENST00000420563 1598 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
GRIK1P39086 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
GRIK1P39086 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
GRIK1P39086 AC016027.1-202ENST00000607927 1699 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
GRIK1P39086 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
GRIK1P39086 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
GRIK1P39086 GALNT9-202ENST00000397325 1727 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
GRIK1P39086 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
GRIK1P39086 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
GRIK1P39086 CDC25B-204ENST00000379598 2990 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
GRIK1P39086 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
GRIK1P39086 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
GRIK1P39086 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
GRIK1P39086 TTLL5-219ENST00000556977 1961 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
GRIK1P39086 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
GRIK1P39086 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
GRIK1P39086 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
GRIK1P39086 MRGPRD-201ENST00000309106 966 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
GRIK1P39086 CGB3-201ENST00000357383 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
GRIK1P39086 CGB2-201ENST00000359342 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
GRIK1P39086 FAM24B-201ENST00000368896 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
GRIK1P39086 GBGT1-201ENST00000372036 871 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
GRIK1P39086 ALKBH6-202ENST00000378875 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
GRIK1P39086 CD99-202ENST00000381180 530 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
GRIK1P39086 SUMO1-201ENST00000392244 831 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
GRIK1P39086 CXCL1-201ENST00000395761 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
GRIK1P39086 CYB5A-203ENST00000397914 619 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
GRIK1P39086 SUMO1-209ENST00000409712 761 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
GRIK1P39086 AC023141.5-201ENST00000458585 616 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
GRIK1P39086 NDUFB2-202ENST00000460088 420 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
GRIK1P39086 MLF1-210ENST00000484955 1247 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
GRIK1P39086 FLYWCH2-203ENST00000572006 754 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
GRIK1P39086 TVP23B-206ENST00000574226 1080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
GRIK1P39086 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
GRIK1P39086 BSG-215ENST00000618006 1329 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
GRIK1P39086 BCL2L12-203ENST00000441864 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
GRIK1P39086 F10-202ENST00000375559 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
GRIK1P39086 BHMT2-205ENST00000521567 1537 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
GRIK1P39086 SLC25A35-205ENST00000580340 1541 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
GRIK1P39086 AL139398.1-201ENST00000638795 1529 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
GRIK1P39086 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
GRIK1P39086 FAM60A-203ENST00000454658 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
GRIK1P39086 ATP6AP2-225ENST00000637482 1648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
GRIK1P39086 IRF5-215ENST00000619830 1652 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
GRIK1P39086 PRMT2-208ENST00000451211 1878 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
GRIK1P39086 WAPL-202ENST00000298767 6333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
GRIK1P39086 AL645728.1-201ENST00000366221 2101 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
GRIK1P39086 TRIP10-201ENST00000313244 2153 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
GRIK1P39086 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
GRIK1P39086 CORO6-202ENST00000388767 2397 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
GRIK1P39086 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
GRIK1P39086 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
GRIK1P39086 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
GRIK1P39086 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
GRIK1P39086 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
GRIK1P39086 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
GRIK1P39086 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
GRIK1P39086 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
GRIK1P39086 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
GRIK1P39086 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
GRIK1P39086 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
GRIK1P39086 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
GRIK1P39086 ZFYVE19-203ENST00000355341 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
GRIK1P39086 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
GRIK1P39086 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
GRIK1P39086 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
GRIK1P39086 ZFAND6-201ENST00000261749 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
GRIK1P39086 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
GRIK1P39086 SUFU-202ENST00000369902 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.3 ms