Protein–RNA interactions for Protein: P35247

SFTPD, Pulmonary surfactant-associated protein D, humanhuman

Predictions only

Length 375 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFTPDP35247 AC087386.1-201ENST00000553658 572 ntTSL 4 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SFTPDP35247 BEAN1-203ENST00000561796 1078 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SFTPDP35247 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SFTPDP35247 AQP6-205ENST00000618286 829 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SFTPDP35247 CPEB2-201ENST00000259997 5612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SFTPDP35247 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SFTPDP35247 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SFTPDP35247 GULP1-209ENST00000410051 1595 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SFTPDP35247 PTHLH-202ENST00000395868 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SFTPDP35247 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SFTPDP35247 AL391256.1-201ENST00000443260 1855 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
SFTPDP35247 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SFTPDP35247 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SFTPDP35247 ZFYVE19-203ENST00000355341 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SFTPDP35247 ADAMTS13-206ENST00000371929 4934 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SFTPDP35247 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SFTPDP35247 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SFTPDP35247 FAM184B-201ENST00000265018 6622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SFTPDP35247 FOXS1-201ENST00000375978 1319 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SFTPDP35247 AC025580.3-201ENST00000617932 1424 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
SFTPDP35247 AC012569.1-201ENST00000591191 1524 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
SFTPDP35247 XKR7-201ENST00000562532 7844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SFTPDP35247 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SFTPDP35247 SGO1-201ENST00000263753 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SFTPDP35247 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SFTPDP35247 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SFTPDP35247 RCAN3-202ENST00000374395 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SFTPDP35247 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SFTPDP35247 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SFTPDP35247 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SFTPDP35247 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SFTPDP35247 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SFTPDP35247 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SFTPDP35247 MEX3A-202ENST00000532414 6124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SFTPDP35247 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SFTPDP35247 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SFTPDP35247 HDAC5-201ENST00000225983 5326 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SFTPDP35247 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SFTPDP35247 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SFTPDP35247 ZDHHC24-201ENST00000310442 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SFTPDP35247 FCN2-201ENST00000291744 1057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SFTPDP35247 SLC9A7-201ENST00000328306 3838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SFTPDP35247 CKLF-204ENST00000362093 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SFTPDP35247 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SFTPDP35247 FABP5-202ENST00000396359 986 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SFTPDP35247 ZGLP1-201ENST00000403352 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SFTPDP35247 AC064807.1-202ENST00000423716 936 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SFTPDP35247 RHOQP3-201ENST00000437982 621 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
SFTPDP35247 NMU-202ENST00000505262 693 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SFTPDP35247 AP002490.2-201ENST00000524791 560 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
SFTPDP35247 MMP17-203ENST00000535004 719 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SFTPDP35247 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SFTPDP35247 DYNLL1-204ENST00000548214 616 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SFTPDP35247 PAX9-204ENST00000554201 1289 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SFTPDP35247 AL513190.1-201ENST00000621254 727 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
SFTPDP35247 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SFTPDP35247 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SFTPDP35247 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SFTPDP35247 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SFTPDP35247 STEAP3-204ENST00000409811 2103 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SFTPDP35247 NBPF15-202ENST00000488031 4535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SFTPDP35247 GIGYF1-201ENST00000275732 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SFTPDP35247 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SFTPDP35247 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SFTPDP35247 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SFTPDP35247 PPP1R26-202ENST00000401470 4769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SFTPDP35247 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SFTPDP35247 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SFTPDP35247 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SFTPDP35247 FAM131A-207ENST00000450976 1335 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SFTPDP35247 TMEM19-201ENST00000266673 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SFTPDP35247 DUOX1-202ENST00000389037 5483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SFTPDP35247 HS3ST3B1-201ENST00000360954 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SFTPDP35247 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SFTPDP35247 LFNG-207ENST00000614382 1969 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SFTPDP35247 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SFTPDP35247 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SFTPDP35247 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SFTPDP35247 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SFTPDP35247 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SFTPDP35247 AL139300.1-201ENST00000472726 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SFTPDP35247 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SFTPDP35247 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SFTPDP35247 HARS-203ENST00000431330 1774 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SFTPDP35247 CUX1-213ENST00000549414 4452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SFTPDP35247 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SFTPDP35247 KIAA1217-206ENST00000376462 6123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SFTPDP35247 AC073957.2-201ENST00000549241 1562 ntTSL 4 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SFTPDP35247 AC119396.1-201ENST00000576789 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SFTPDP35247 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SFTPDP35247 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SFTPDP35247 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SFTPDP35247 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SFTPDP35247 TBRG4-202ENST00000361278 1917 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SFTPDP35247 FBXO24-206ENST00000468962 1901 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SFTPDP35247 TUBA4B-203ENST00000490341 1380 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SFTPDP35247 MIER1-206ENST00000371016 1802 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SFTPDP35247 ASXL1-210ENST00000613218 7038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SFTPDP35247 HELT-201ENST00000338875 1008 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SFTPDP35247 CDK2AP2P3-201ENST00000422476 372 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.8 ms