Protein–RNA interactions for Protein: P26992

CNTFR, Ciliary neurotrophic factor receptor subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 372 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTFRP26992 AL662844.4-201ENST00000606367 2838 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
CNTFRP26992 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CNTFRP26992 ACOT12-201ENST00000307624 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CNTFRP26992 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CNTFRP26992 FRMPD4-201ENST00000380682 8465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CNTFRP26992 PIGT-207ENST00000543458 2037 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
CNTFRP26992 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CNTFRP26992 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
CNTFRP26992 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CNTFRP26992 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CNTFRP26992 CHRNG-201ENST00000389492 1398 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CNTFRP26992 RAI1-207ENST00000640861 5172 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
CNTFRP26992 RGS6-210ENST00000553530 5685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CNTFRP26992 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CNTFRP26992 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
CNTFRP26992 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
CNTFRP26992 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CNTFRP26992 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
CNTFRP26992 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
CNTFRP26992 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CNTFRP26992 SLC4A1APP2-201ENST00000424054 1259 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
CNTFRP26992 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
CNTFRP26992 SNHG17-206ENST00000436764 973 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
CNTFRP26992 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
CNTFRP26992 ZFPM1-203ENST00000562437 502 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
CNTFRP26992 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
CNTFRP26992 HEXA-210ENST00000567213 1000 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
CNTFRP26992 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
CNTFRP26992 CLEC11A-203ENST00000617718 1128 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CNTFRP26992 PSMA6-216ENST00000627895 484 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
CNTFRP26992 DUOXA2-201ENST00000323030 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CNTFRP26992 SLC45A1-202ENST00000471889 2784 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
CNTFRP26992 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CNTFRP26992 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
CNTFRP26992 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CNTFRP26992 ANKRD35-202ENST00000544626 3093 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
CNTFRP26992 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CNTFRP26992 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CNTFRP26992 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
CNTFRP26992 LINC00323-202ENST00000441268 2095 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
CNTFRP26992 ATRNL1-201ENST00000355044 8479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CNTFRP26992 WLS-202ENST00000354777 2037 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CNTFRP26992 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CNTFRP26992 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CNTFRP26992 PLXDC2-202ENST00000377242 2822 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CNTFRP26992 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
CNTFRP26992 FEM1C-201ENST00000274457 5816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CNTFRP26992 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CNTFRP26992 CRY2-211ENST00000616080 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CNTFRP26992 MLEC-201ENST00000228506 6626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CNTFRP26992 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
CNTFRP26992 ELAC2-203ENST00000426905 2671 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
CNTFRP26992 LMBR1-202ENST00000359422 4727 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
CNTFRP26992 DUOX1-202ENST00000389037 5483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
CNTFRP26992 RANBP3-201ENST00000034275 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
CNTFRP26992 MEG3-206ENST00000423456 1771 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
CNTFRP26992 AC093627.6-201ENST00000478759 1365 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
CNTFRP26992 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
CNTFRP26992 AC131009.4-201ENST00000624048 1740 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
CNTFRP26992 ANTXR1-201ENST00000303714 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
CNTFRP26992 BEND4-203ENST00000611697 1348 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
CNTFRP26992 NFATC4-203ENST00000422617 5491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
CNTFRP26992 PRR15-201ENST00000319694 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
CNTFRP26992 PPA2-201ENST00000341695 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
CNTFRP26992 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
CNTFRP26992 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
CNTFRP26992 ZNF346-202ENST00000503039 2774 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
CNTFRP26992 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
CNTFRP26992 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
CNTFRP26992 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
CNTFRP26992 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
CNTFRP26992 MFSD13A-202ENST00000369931 823 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
CNTFRP26992 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
CNTFRP26992 ABHD11-203ENST00000395147 812 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
CNTFRP26992 TSPY3-202ENST00000440483 414 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
CNTFRP26992 HYAL1-206ENST00000447605 666 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
CNTFRP26992 UCHL1-204ENST00000503431 917 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
CNTFRP26992 MAGIX-204ENST00000614074 778 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
CNTFRP26992 HMGN3-203ENST00000620514 1010 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
CNTFRP26992 TMEM25-202ENST00000354064 1965 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
CNTFRP26992 SLC2A6-201ENST00000371897 2301 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
CNTFRP26992 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
CNTFRP26992 HLA-F-218ENST00000376861 1544 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
CNTFRP26992 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
CNTFRP26992 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
CNTFRP26992 NPY4R-202ENST00000612632 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
CNTFRP26992 NPY4R2-202ENST00000613306 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
CNTFRP26992 SUSD4-202ENST00000343846 3480 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
CNTFRP26992 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
CNTFRP26992 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
CNTFRP26992 SH2B3-202ENST00000538307 2062 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
CNTFRP26992 ADGRB2-206ENST00000398556 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
CNTFRP26992 AASDHPPT-201ENST00000278618 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
CNTFRP26992 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
CNTFRP26992 LILRA6-201ENST00000245621 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
CNTFRP26992 SRSF2-205ENST00000508921 1390 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
CNTFRP26992 TAB1-202ENST00000331454 1660 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
CNTFRP26992 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
CNTFRP26992 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
CNTFRP26992 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.8 ms