Protein–RNA interactions for Protein: P23467

PTPRB, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase beta, humanhuman

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Length 1,997 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRBP23467 LMF1-AS1-202ENST00000569574 1408 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PTPRBP23467 AC024619.2-201ENST00000581964 517 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PTPRBP23467 SNX33P1-201ENST00000592116 1762 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
PTPRBP23467 AC008758.5-201ENST00000595562 617 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PTPRBP23467 Z84492.1-201ENST00000606589 408 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PTPRBP23467 MRNIP-225ENST00000610475 810 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PTPRBP23467 AC093525.8-201ENST00000624099 1342 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
PTPRBP23467 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PTPRBP23467 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PTPRBP23467 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PTPRBP23467 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PTPRBP23467 AMT-232ENST00000636199 1546 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PTPRBP23467 AC020915.1-201ENST00000413518 1469 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PTPRBP23467 KRT8P39-201ENST00000396270 1433 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
PTPRBP23467 SPAG7-201ENST00000206020 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PTPRBP23467 TSPAN32-204ENST00000381121 999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PTPRBP23467 ATP5D-202ENST00000395633 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PTPRBP23467 PABPN1L-201ENST00000411789 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PTPRBP23467 SPDYE17-201ENST00000412399 783 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
PTPRBP23467 VMO1-203ENST00000416307 712 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PTPRBP23467 KLF2P4-201ENST00000451959 1225 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
PTPRBP23467 C8orf88-201ENST00000517562 894 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PTPRBP23467 AC129510.1-201ENST00000579979 555 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PTPRBP23467 AL022328.1-201ENST00000610050 478 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
PTPRBP23467 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PTPRBP23467 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PTPRBP23467 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PTPRBP23467 PDE4DIP-230ENST00000530472 1690 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PTPRBP23467 CRTC2-202ENST00000368630 1635 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PTPRBP23467 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PTPRBP23467 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PTPRBP23467 EYA2-201ENST00000317304 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PTPRBP23467 ETV7-201ENST00000339796 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PTPRBP23467 MBD1-207ENST00000398488 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PTPRBP23467 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PTPRBP23467 PFDN4-201ENST00000371419 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PTPRBP23467 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PTPRBP23467 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PTPRBP23467 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PTPRBP23467 IFNL2-201ENST00000331982 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PTPRBP23467 KRT43P-201ENST00000434019 910 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
PTPRBP23467 ZNF527-203ENST00000483919 1142 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PTPRBP23467 AC093904.2-201ENST00000495580 418 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PTPRBP23467 AC018653.3-202ENST00000538062 735 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PTPRBP23467 RIT1-205ENST00000539040 919 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PTPRBP23467 C2orf69P2-201ENST00000562032 1123 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
PTPRBP23467 AC007611.1-201ENST00000568150 826 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
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PTPRBP23467 AL160035.1-201ENST00000637583 576 ntTSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
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PTPRBP23467 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
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PTPRBP23467 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PTPRBP23467 DMAC2-201ENST00000221943 1692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PTPRBP23467 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PTPRBP23467 MED19-201ENST00000337672 1637 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PTPRBP23467 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PTPRBP23467 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PTPRBP23467 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PTPRBP23467 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
PTPRBP23467 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.06
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PTPRBP23467 PRG2-202ENST00000525955 1367 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
PTPRBP23467 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
PTPRBP23467 PDCD5-203ENST00000419343 1799 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
PTPRBP23467 TUBB8P12-201ENST00000308911 1335 ntBASIC15.46■□□□□ 0.06
PTPRBP23467 TUBB7P-202ENST00000428444 1305 ntBASIC15.46■□□□□ 0.06
PTPRBP23467 TUBB8P7-204ENST00000567960 1332 ntBASIC15.46■□□□□ 0.06
PTPRBP23467 EIF1B-AS1-206ENST00000631175 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
PTPRBP23467 KRTAP10-2-201ENST00000391621 1149 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PTPRBP23467 AC073133.1-201ENST00000426187 432 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PTPRBP23467 DRGX-202ENST00000434016 955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PTPRBP23467 AL121845.2-201ENST00000467211 252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PTPRBP23467 SNHG9-201ENST00000531523 275 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PTPRBP23467 PLEKHB1-206ENST00000535129 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PTPRBP23467 AC124947.2-201ENST00000547118 1133 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
PTPRBP23467 LINC02279-201ENST00000553435 737 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PTPRBP23467 RN7SL560P-201ENST00000577943 264 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
PTPRBP23467 AC079336.2-201ENST00000578408 927 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PTPRBP23467 AC011497.1-201ENST00000596781 561 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PTPRBP23467 AC005785.1-202ENST00000597164 237 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PTPRBP23467 ZNF586-205ENST00000598885 578 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PTPRBP23467 AC026979.3-201ENST00000607315 403 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
PTPRBP23467 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PTPRBP23467 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PTPRBP23467 TUBBP5-201ENST00000290377 1563 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PTPRBP23467 ALDH3A1-212ENST00000494157 1572 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PTPRBP23467 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PTPRBP23467 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PTPRBP23467 PDXDC1-204ENST00000455313 2183 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PTPRBP23467 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PTPRBP23467 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
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