Protein–RNA interactions for Protein: P20963

CD247, T-cell surface glycoprotein CD3 zeta chain, humanhuman

Predictions only

Length 164 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD247P20963 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CD247P20963 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CD247P20963 ZNF644-201ENST00000337393 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CD247P20963 EPS15L1-207ENST00000594975 2489 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CD247P20963 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CD247P20963 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CD247P20963 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CD247P20963 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CD247P20963 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
CD247P20963 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CD247P20963 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CD247P20963 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CD247P20963 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CD247P20963 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CD247P20963 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CD247P20963 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CD247P20963 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CD247P20963 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
CD247P20963 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CD247P20963 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
CD247P20963 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CD247P20963 ITFG1-201ENST00000320640 3400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CD247P20963 DIABLO-208ENST00000464942 2569 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CD247P20963 TUBB8P12-201ENST00000308911 1335 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
CD247P20963 TUBB7P-202ENST00000428444 1305 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
CD247P20963 TUBB8P7-204ENST00000567960 1332 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
CD247P20963 HMGA1-202ENST00000347617 1773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CD247P20963 FOXP3-202ENST00000376199 2274 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CD247P20963 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CD247P20963 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CD247P20963 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CD247P20963 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CD247P20963 SLC25A27-201ENST00000371347 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CD247P20963 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CD247P20963 COL2A1-202ENST00000380518 5071 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CD247P20963 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
CD247P20963 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
CD247P20963 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
CD247P20963 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
CD247P20963 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
CD247P20963 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
CD247P20963 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
CD247P20963 ATG5-210ENST00000636437 2261 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
CD247P20963 ZNF140-210ENST00000544426 2340 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CD247P20963 ADGRA1-202ENST00000392607 4283 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CD247P20963 CPEB2-203ENST00000382395 5524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CD247P20963 SYBU-208ENST00000440310 3072 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CD247P20963 SEC14L4-201ENST00000255858 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CD247P20963 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CD247P20963 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CD247P20963 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CD247P20963 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CD247P20963 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CD247P20963 PCDH1-203ENST00000394536 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CD247P20963 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
CD247P20963 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
CD247P20963 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CD247P20963 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CD247P20963 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
CD247P20963 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
CD247P20963 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CD247P20963 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CD247P20963 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CD247P20963 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CD247P20963 PKDREJ-201ENST00000253255 7693 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CD247P20963 BRIX1-201ENST00000336767 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CD247P20963 CALD1-204ENST00000417172 1915 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CD247P20963 SF3A2-201ENST00000221494 1963 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CD247P20963 ABTB1-206ENST00000468137 2065 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CD247P20963 ORMDL3-201ENST00000304046 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CD247P20963 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CD247P20963 PANX2-201ENST00000159647 2964 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CD247P20963 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CD247P20963 CACNA1G-201ENST00000352832 7848 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CD247P20963 SURF4-202ENST00000371989 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CD247P20963 LINGO1-201ENST00000355300 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CD247P20963 STEAP3-204ENST00000409811 2103 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CD247P20963 AGTPBP1-201ENST00000337006 4473 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CD247P20963 CHN1-205ENST00000409900 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CD247P20963 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CD247P20963 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CD247P20963 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CD247P20963 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CD247P20963 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CD247P20963 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CD247P20963 WNT7B-203ENST00000410058 714 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CD247P20963 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CD247P20963 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
CD247P20963 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
CD247P20963 AP002490.2-201ENST00000524791 560 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
CD247P20963 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CD247P20963 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CD247P20963 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CD247P20963 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CD247P20963 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CD247P20963 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CD247P20963 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CD247P20963 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CD247P20963 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
CD247P20963 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.8 ms